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Name : HPB14_00670 (HPB14_00670) Accession : YP_006218872.1 Strain : Helicobacter pylori HUP-B14 Genome accession: NC_017733 Putative virulence/resistance : Unknown Product : LctP family lactate transporter Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 139791 - 141440 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCCATATTTGGCTGAGCGCTTTAGTCGCACTTTCGCCCATTGCACTCTT TTTTGTCTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAAGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTATTGCTTTCAATCCTTATTGCGT TATTTGTGTATAAAATGCCCGCTCAAATGGTGAGCACGAGTTTTTTCTACGGCTTTCTTTATGGTTTGTGGCCGATCGCT TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AACCCTAACGCCGGATCACCGCATTTTGGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCGGCT TTGGAGGCCCGGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTAGTCGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCTGGGTTGTGCCTG ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGTGCGGTGGGTATTCCTATTACGGCAATGGCTAGCGTGGTGGGTATCCCTGA GTTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGGGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGTATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAGAGGGATTAGAGAGACTTTTCCTGCAGTGGCTGTTACCGGGTTTAGTTTCGCTATTGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATCTAGGGCCGCAGCTCCCAGATATTATTTCAGCTTTAGTGTCATTGATTGCTACCACTTTGTTTTTAAAATT CTGGCAGCCCAAGCGCATTTTCACTAGCAATGGCAAAGAACCCACGATGAACACAGAAAAACACCATATTTGTAAGGTGG TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCATGATTACGATTATTATATGGACGCAACCCTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGCGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTTGATTCTATCAGTCAAAAGATTTTTAAAACCGTTCCTAT TGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCCGTCGTGTTCAAACTCCCTTTGATTTTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CTCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCCACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTCGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCTACGCTCGCTTT AGCGTTAGCGGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTTGTAGGCTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACAAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTGCAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCCAACACTTCAGGGGGCGTTGTGGGCAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCAGCGGTGGGGTT AGTGGGGAAAGAGAGTGAATTGTTCAGATTTACAGTAAAATACTCTATCGCTTTGGCAATCATTATGGGGATTGTCTTCA CTCTTATCGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATTCCAGTTACTCCTACTTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGHIWLSALVALSPIALFFVSLIVFKLKGYSAGFLSLLLSILIALFVYKMPAQMVSTSFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKFWQPKRIFTSNGKEPTMNTEKHHICKVVVAWMPFVLLMITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFDSISQKIFKTVPIVTEATNFPVVFKLPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPVTPT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-127 | 55 |
