|
Name : ctaD (HBHAL_2836) Accession : YP_006180458.1 Strain : Halobacillus halophilus DSM 2266 Genome accession: NC_017668 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase subunit I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.9.3.1 Position : 1838669 - 1840537 bp Length : 1869 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGAGTACTACAGCAGCGCAAAATGGTGGGCTCGGCGCTGCGATTTGGGATTACTTGACTACTGTAGACCATAAGAAGAT TGCACATCTTTACTTGGTAGCAGGCGGTCTGTTCTTCTTAATCGGCGGGCTCGAAGCCATGTTAATACGAATTCAATTGA TGAAACCAGATAACAATTTCATCTCTGCCGGGCTTTATAATGAAATGATTACGATGCATGGTACAACCATGATTTTCTTA GCAGCCATGCCGCTTATATTCGCTTTAATGAATGCGGTGGTTCCACTGCAGATAGGAGCGCGCGACGTAGCGTTTCCATT CTTGAACTCATTAGGGTTCTGGCTGTTTCTTTTTGGTGGCCTATTGCTAAACGTTTCCTGGTTTACAGGAGGGGCTCCTG ATGCTGGGTGGACGAACTATGCACCGCTATCTACCACATCACCGGGCCATGGAGTCGATTATTATGTGATGGGGCTTCAG ATTTCAGGGGCTGGTACATTAATTGGTGGTATTAACTTCCTGGTAACCATCGTTAACATGAGGGCACCAGGTATGACTTA CATGCGTATGCCGCTGTTTACTTGGTCTACGTTTGTTACAAGTACACTAATTCTATTCGCATTCCCTGCATTGACTGTAG GATTGTTCCTTATGATGTTTGACCGTATGTTTGGTGCTGCCTTCTTCGATGTAGCGAAAGGCGGAAACGTCATTATTTGG GAGCACTTATTCTGGATATTCGGACACCCGGAAGTTTATATCTTAATTCTTCCTCTGTTCGGAGCATTTAGTGATATATT CTCAACTTTTTCTAAAAAGCGATTGTTCGGTTACTCAGCGATGGTCTTCGCAACCGTTTTGATTGGTTTCCTTGGTTTCA TGGTGTGGGCTCACCATATGTTTACCGTAGGTATGGGACCAATCGCTAACTCCATCTTTGCTGTAGCAACGATGGCAATT GCTGTTCCGACAGGGATCAAAATATTTAACTGGCTCTTCACGATGTGGGGCGGACAGATAAGAATGACCTCAGCTATGCT CTGGTCTGTAGCGTTCATTCCTTCCTTTACTATCGGAGGGATGACGGGTGTTATGCTTGCAGCGGCAGCAGCTGACTTTC AGTACCATGATACTTATTTCGTAGTTGGTCACTTCCACTACGTTATCGTTGGTGGTGTAGTCTTTGGTATATTTGCAGCA TTACATTACTGGTGGCCGAAAATGTTTGGTAAAGTACTTAATGAAAAGCTTGGTAAATTGGCATTCTGGCCATTTTTCAT CGGGTTCCACCTAACGTTCTTTATCCAACACTTCCTTGGTCTAATGGGAATGCCGCGTCGTTACTGGGTCTTCCTTGAGG GACAAGGACTTGAAGCTGGTAATATGATTAGTACGATTGGCGCTTTCTTAATGGCTATTGGTTCCGTTATCTTCTTAATC AACATTGTTTACACAGCCGTTAAGGAGAAGAAAGTGAGTGGGGATCCTTGGGATGGTCGTACGCTAGAATGGACGATGCC TTCACCGCCACCTCACTACAACTTCGTACAAACACCTTTAGTACGTGGTTTAGATCCGCTATGGGTTGAAAAAACAGAAG GTAAAGAAGGAATGACTCCAGCAGAGCCACTTGGTGACATTCACATGCCTAACGCTTCCATCCTGCCTTTCACCATGTCC TTAGGTCTATTCATCGCCGGTTTTGGATTTATTTATCAAACGGATGATAAAACATGGCTCGTGGCAGCCGTGATCGGTAT GGGTATTACACTAGGTTCAATGTTGATTCGTTCCTTGAAAGATGATCTTGGACACCATATTCATAAAGAAGAGCTGGAAG AAGATATTAAGAAGGGGGTTGGCAAATAA Protein sequence : MSTTAAQNGGLGAAIWDYLTTVDHKKIAHLYLVAGGLFFLIGGLEAMLIRIQLMKPDNNFISAGLYNEMITMHGTTMIFL AAMPLIFALMNAVVPLQIGARDVAFPFLNSLGFWLFLFGGLLLNVSWFTGGAPDAGWTNYAPLSTTSPGHGVDYYVMGLQ ISGAGTLIGGINFLVTIVNMRAPGMTYMRMPLFTWSTFVTSTLILFAFPALTVGLFLMMFDRMFGAAFFDVAKGGNVIIW EHLFWIFGHPEVYILILPLFGAFSDIFSTFSKKRLFGYSAMVFATVLIGFLGFMVWAHHMFTVGMGPIANSIFAVATMAI AVPTGIKIFNWLFTMWGGQIRMTSAMLWSVAFIPSFTIGGMTGVMLAAAAADFQYHDTYFVVGHFHYVIVGGVVFGIFAA LHYWWPKMFGKVLNEKLGKLAFWPFFIGFHLTFFIQHFLGLMGMPRRYWVFLEGQGLEAGNMISTIGAFLMAIGSVIFLI NIVYTAVKEKKVSGDPWDGRTLEWTMPSPPPHYNFVQTPLVRGLDPLWVEKTEGKEGMTPAEPLGDIHMPNASILPFTMS LGLFIAGFGFIYQTDDKTWLVAAVIGMGITLGSMLIRSLKDDLGHHIHKEELEEDIKKGVGK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 7e-91 | 49 |
