Gene Information

Name : neuS (ECOK1_3365)
Accession : YP_006102480.1
Strain : Escherichia coli IHE3034
Genome accession: NC_017628
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : alpha-2,8-polysialyltransferase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 3450318 - 3451547 bp
Length : 1230 bp
Strand : -
Note : identified by similarity to GB:AAA24213.1; match to protein family HMM PF07388

DNA sequence :
ATGATATTTGATGCTAGTTTAAAGAAGTTGAGGAAATTATTTGTAAATCCAATTGGGTTTTTCCGTGACTCATGGTTTTT
TAATTCTAAAAACAAGGCTGAAGAGCTACTATCACCGTTAAAAATAAAAAGTAAAAATATTTTTATAATTAGTAACCTGG
GGCAATTAAAAAAAGCTGAGTCATTTGTACAAAAATTTAGCAAGAGAAGTAACTATCTTATTGTTTTGGCAACTGAAAAA
AATACTGAGATGCCAAAAATTATTGTTGAACAAATAAATAATAAATTATTTTCTTCATACAAGGTACTATTCATTCCAAC
TTTCCCAAATGTTTTTTCACTTAAAAAGGTTATATGGTTTTATAACGTATATAATTATTTAGTTTTAAATTCAAAAGCTA
AAGATGCTTATTTTATGAGCTATGCGCAACATTATGCAATCTTCGTATATTTGTTCAAAAAAAATAATATAAGATGTTCA
TTAATTGAAGAGGGGACAGGGACTTATAAAACCGAAAAAGAAAACCCAGTAGTAAATATTAATTTTTATTCAGAGATTAT
TAATTCAATTATCTTGTTCCATTATCCAGATTTGAAATTTGAAAATGTATACGGTACATATCCAATTTTGCTTAAGAAAA
AATTTAATGCGCAAAAATTTGTTGAGTTTAAAGGTGCTCCATCAGTTAAATCATCAACCAGAATAGATAATGTTATCCAT
AAATATTCTATAACTAGAGATGATATAATATATGCAAATCAAAAGTATTTGATTGAACATACATTATTTGCGGATTCGTT
AATTTCTATCTTACTTAGAATAGATAAGCCTGATAATGCAAGAATATTTATAAAACCTCACCCTAAAGAGCCTAAAAAAA
ATATTAATGCAATTCAAAAGGCAATAAAAAAGGCAAAATGTCGTGACATAATTCTTATAACAGAGCCAGACTTTTTAATA
GAGCCGGTAATAAAAAAAGCAAAAATAAAACACTTAATTGGATTAACATCATCTTCTTTGGTATATGCACCTTTAGTTTC
TAAAAGATGTCAGTCTTATTCAATAGCGCCTCTTATGATAAAGTTGTGTGATAATGATAAATCCCAAAAAGGGATTAATA
CGCTGCGTCTCCATTTCGATATTTTAAAGAATTTTGATAATGTTAAAATATTATCGGATGATATAACATCTCCCTCTTTG
CACGATAAAAGGATTTTCTTGGGGGAGTAA

Protein sequence :
MIFDASLKKLRKLFVNPIGFFRDSWFFNSKNKAEELLSPLKIKSKNIFIISNLGQLKKAESFVQKFSKRSNYLIVLATEK
NTEMPKIIVEQINNKLFSSYKVLFIPTFPNVFSLKKVIWFYNVYNYLVLNSKAKDAYFMSYAQHYAIFVYLFKKNNIRCS
LIEEGTGTYKTEKENPVVNINFYSEIINSIILFHYPDLKFENVYGTYPILLKKKFNAQKFVEFKGAPSVKSSTRIDNVIH
KYSITRDDIIYANQKYLIEHTLFADSLISILLRIDKPDNARIFIKPHPKEPKKNINAIQKAIKKAKCRDIILITEPDFLI
EPVIKKAKIKHLIGLTSSSLVYAPLVSKRCQSYSIAPLMIKLCDNDKSQKGINTLRLHFDILKNFDNVKILSDDITSPSL
HDKRIFLGE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
neuS YP_854390.1 poly-alpha-2,8 sialosyl sialyltransferase NeuS Not tested PAI I APEC-O1 Protein 6e-167 100
ORF_63 AAZ04472.1 polysialyltransferase protein Not tested PAI I APEC-O1 Protein 5e-167 100