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Name : polA (SSUD12_0576) Accession : YP_006082145.1 Strain : Streptococcus suis D12 Genome accession: NC_017621 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 581586 - 584222 bp Length : 2637 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAAAAAAATAAATTATTATTAATCGATGGCTCTTCGGTAGCCTTCCGTGCTTTCTTTGCACTTTATAATCAAATTGA TCGTTTTAAGAGTCCGACAGGTCTTCACACCAATGCTATCTACGGCTTCAATCTCATGCTGGACCACATGATGAAGCGGA TTGAACCGACCCATATTCTCGTGGCTTTTGATGCTGGAAAGACCACTTTCCGTACGGAGATGTATGCAGACTATAAGGCA GGTCGTGCCAAGACTCCAGACGAATTCCGTGAGCAGTTTCCTTTTATCCGTCAGATGTTGGATGCCATGGGAGTCAAGCA TTACGAACTGGATCAGTATGAGGCAGATGACATTATCGGTACCTTGGACAAAATGGCAGAGCGGACAGACATTCCTTTCG ATGTGACCATTGTTAGCGGTGATAAGGATTTGATCCAGCTGACTGATGAGAACACCGTAGTCGAAATTTCCAAGAAAGGC GTTGCCGAATTCGAAGAATTTACCCCAGCCTACCTCATGGAAAAAATGGGGATTACCCCTACTCAGTTTATTGACCTCAA GGCTCTAATGGGAGATAAGTCCGATAACATCCCTGGGGTGACCAAAATCGGTGAAAAAACAGGTCTAAAACTCCTGACAG AATTCGGTTCATTGGATGGTATCTACGAAAACATTGACAGCATGAAGGCTTCTAAGATGAAAGAAAACCTGATTGCTGAT AAGGAGAAGGCCTTCCTATCTCGTACACTTGCTACCATTGATACTCAGGCTCCAATCGAAATTGGTCTGGATGACATTGT TTATCAAGGTCCTAAGGTGGATGAACTGGGACAATTCTACGATGATATGGGCTTCAAGCAATTAAGGGCTCAGTTAGGTA CGACCAGCTCGCAAGAGGAAGCGGTACTCGATTTCCAAATCGTAACGGAAATCAGCCCCGCTATGCTCAAACAAGACCAG TTTTTCTATTTTGAAATCTTGGGTGAAAATTATCACCGAGAGGATTTGGTTGGTTTAGCTTGGGGAGATAAGGAGAAAAT CTATGTCGGAGGGCCTGAGCTACTTGATAGTCCAGTCTTGCGTGACTTTTTAGAAAACCAAACCATAAAAACCTATGACT TTAAGCGTGGAAAAGTTCTTCTCGACCGAAAAGAGATTACGCTACCTCCAGCTACTTTCGATAGCCGTCTAGCCAAATAC TTGCTTTCCACCGTTGAGGACAACTCCCTAACAACGATTGCCAACCTCTATGGTCGGACCAGTCTTGTTCCAGATGAGGC AGTTTATGGTAAGGGTGCTAAGTTAGACTTGCCTGAACGAGAGGTCTTTTTCCCACATTTGGCACGTAAGGTTCAGGTTT TGATTGAGACAGAAGAGCCGATGTTGACCAAATTAGAAGGAAATCAGCAATTAGATCTTTTGTTTGACATGGAGTTACCA CTGGCAAATGTTTTAGCTAAGATGGAAATTGCTGGTATTAAAGTGGAAGCTGAGACTCTCAAAGCTATGCAATCTGAAAA CGAAGTTTTGATTGACCAGTTGACCAAGGAAATCTATGAACTAGCTGGTCAGGAATTTAATATCAATTCGCCTAAGCAGC TTGGGACCATTCTCTTTGAAGATATGGGACTACCATTGGAATATACCAAGAAAACCAAGACAGGCTATTCAACAGCAGTA GATGTCTTAGAACGATTAGCGCCAATTGCACCAGTTGTTTCAAAAATCTTGGAATACCGTCAGATTACCAAGCTTCAATC AACTTATGTAGTCGGCTTGCAGGATGCCATTTTAGAAGATGGTAAGATCCATACCCGCTATGTACAGGATTTGACACAAA CAGGTCGCCTATCTTCGACGGACCCTAACTTGCAAAATATTCCTGTTCGTCTAGACCAAGGGCGCTTGATTCGTAAGGCA TTTGTTCCATCGCTTGAAAATAGTGTCCTTTTGGCATCGGACTATTCACAGATTGAATTGCGCGTCTTGGCTCATATTTC TCAGGACCAGCATTTGATTGAGGCCTTCCAGCAAGGTGCAGATATTCACACTTCGACAGCTATGCGGGTCTTCGGTATCG AAAAAGCTGAGGATGTGACCCCAAATGACCGTCGGAATGCCAAGGCTGTAAACTTCGGTGTCGTCTATGGTATTTCGGAT TTCGGTCTATCCAATAACTTGGGGATTACACGTAAGGAAGCTAAAGCCTATATCGATACCTATTTTGAACGCTTCCCAGG AATTAAGAATTACATGGAAACCATTGTTCGTGAGGCACGTGATAAGGGTTATGTAGAGACGATTTACAAACGCCGTCGTG AATTACCAGATATAAACTCTCGCAATTTCAATGTCCGTAATTTTGCGGAACGAACAGCCATCAACTCACCAATTCAAGGT TCGGCTGCAGATATTCTCAAAGTAGCCATGATTAATCTTGACAAGGCTTTGACTGAAACAGGTCTTGCGACACGTATGTT ATTGCAAGTACACGATGAGATTGTTTTGGAAGTCCCAGTGGCAGAGCTAGAAACGGTAAAAGCCATGGTAAAAGAGACCA TGGAATCGGCGATTAGCCTGTCTGTGCCATTAATTGCGGATGAAAATGAAGGTTCAACATGGTATGAAGCAAAGTAA Protein sequence : MKKNKLLLIDGSSVAFRAFFALYNQIDRFKSPTGLHTNAIYGFNLMLDHMMKRIEPTHILVAFDAGKTTFRTEMYADYKA GRAKTPDEFREQFPFIRQMLDAMGVKHYELDQYEADDIIGTLDKMAERTDIPFDVTIVSGDKDLIQLTDENTVVEISKKG VAEFEEFTPAYLMEKMGITPTQFIDLKALMGDKSDNIPGVTKIGEKTGLKLLTEFGSLDGIYENIDSMKASKMKENLIAD KEKAFLSRTLATIDTQAPIEIGLDDIVYQGPKVDELGQFYDDMGFKQLRAQLGTTSSQEEAVLDFQIVTEISPAMLKQDQ FFYFEILGENYHREDLVGLAWGDKEKIYVGGPELLDSPVLRDFLENQTIKTYDFKRGKVLLDRKEITLPPATFDSRLAKY LLSTVEDNSLTTIANLYGRTSLVPDEAVYGKGAKLDLPEREVFFPHLARKVQVLIETEEPMLTKLEGNQQLDLLFDMELP LANVLAKMEIAGIKVEAETLKAMQSENEVLIDQLTKEIYELAGQEFNINSPKQLGTILFEDMGLPLEYTKKTKTGYSTAV DVLERLAPIAPVVSKILEYRQITKLQSTYVVGLQDAILEDGKIHTRYVQDLTQTGRLSSTDPNLQNIPVRLDQGRLIRKA FVPSLENSVLLASDYSQIELRVLAHISQDQHLIEAFQQGADIHTSTAMRVFGIEKAEDVTPNDRRNAKAVNFGVVYGISD FGLSNNLGITRKEAKAYIDTYFERFPGIKNYMETIVREARDKGYVETIYKRRRELPDINSRNFNVRNFAERTAINSPIQG SAADILKVAMINLDKALTETGLATRMLLQVHDEIVLEVPVAELETVKAMVKETMESAISLSVPLIADENEGSTWYEAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 74 |
