Gene Information

Name : SSUD12_1294 (SSUD12_1294)
Accession : YP_006082830.1
Strain : Streptococcus suis D12
Genome accession: NC_017621
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1297572 - 1300115 bp
Length : 2544 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
TTGATTTTAAAGATAATATTTTTTTGGGGGTTAGAATTGCGAGGATTTAATAATAAGATAAAATCTGTTTATCGAGAATT
AACAAATACCAAAGAGAAATTCGGTAGTTTTCATAAGACCTTGATTCATTTACATACACCTGTTTCTTATGATTATAAGC
TATTTTCGAGCTGGACTTCAACGAAATATAGAAAAAGTACAGAAGATGAATTATTTGATATATTTTTCAAAAATAAGAAA
ATCAAAGTTGATAAAACAAAATTTTTTGGTAGCTTTGATAAAGTTATCTTTTCTAGCCCAAAAGAGTACATTAGTTTTCT
TTTGTTAGCAGAAGCTATCTTAAAAAATGAAATAGAAATAGTTGTAGTAACTGATCATAATACTACCAAAGGTATTAAAA
AACTTCAAACAGCAGTTTCAATTATAACGAGAACCTATCCGACTTATAATATACATCCTCATATTTTACATGGAGTAGAA
ATTAGTGCAGCAGATAAGTTACATATTGTTTGTATATACGATCATGAAAAAGAATCTTGGGTTAATCAATGGTTATGTGA
AAATATTATAAGTGAAAAAGATGGAAGTTATCAGCATTCGTTGACTATCATGAAAGATTTTAATAATCAAAACATAATTA
ACTACATTGCTCATTTCAATAGTTATAATATTTTGAAAAAAGGTTCTCACTTGTCGGGTGCATATAAGAGACAAGTTTTT
ACAAAAGAAAATACACGATTTATTGGTGTAAAAAATATAAATTCTGTTGAAGGATCGAAAAATCGTTTATTGACAGATTT
TAATTGTGAACCAAATTTTTTATTAGATAATGATTCACATGATATTGATTCAGTCGGAAAGAATAATATGTGGATAAAAG
GTGGAAAGATTTCTTTTAAAATGTTCCAAGAAGCTTTGCTTGATTACACTGTATCAGTAAGTTTATTTGAACCAAATTTT
GAACAAAAGTCTTACATAAAAGGTTTATACATTCAAAGTCGTGGAGGCGATAGAAGTTTTCTTACAGGTGATAAGTTAGA
AAAAGATAGAGACTTCTTTTTAACATTCTCACCATCTATGAACTGTTTAATTGGAGGGAGAGGTACAGGGAAAAGTACAC
TAATAGATATGTTACAATTTGTACTTTCTCAGGATTGCGACAAGCAGAGTAAATTAGAATTCCTATGTAACCATGCAAAT
GCTTTTGTACTCTATGTTTTAGAGGATGCTGAATATATCATTGAGGTTAGTTTGCCAGATGTCTTGCAGGAAAATAGGGA
CAATATCTTACAATATTATGGGCAAAATCGTGAGAATAGGTATGGATATCCTTATAACTACAATTCTGACTCTATCAAAG
AGTGGACACGCTCTCAATATACGAAAGTATACAAAGTTGAGGGAAAATTTTTCAAATTAGTTGATAAAACTAGAATATTA
GAAAAAATGTTTGATAGGAGATATTCTGTTAATGAGTTGGTTAGAACAGCGGATGGAGAAAAAATTACAGAATTTATTTC
CGACTTAATGCTAAAAAATAAAAATTTACCGAGACCAAACTATGGTTTAAGAACTCAGACTCTAGAATCATTCGAAGCTA
AACTACAGGAACTTGATAAATATAGGAGAGTTCGTAAGGATTCAATACTCAAAATAATTGATGATTTCAATCAAACTCAA
GTTGGTAAGTTAAGAATCTGTTATGAGCAAATTGATAGATGGGAAGTACCAGATTTTGAAAGCACTCTTTTCAAAAGTAA
TTCAACTCTCAATTTCTCATTTGAAAATTATAGAATTAGTAAGCGGGATGTTGCAGATATTCTATACCTTGTTTATCAGG
AGTTAGGAATAAAAGGATTTGTTAACGTTATTTTGAAACAAAATATTCCTAATAGGTATTTTATATTATTAAAAAATATT
TCTGAGGAGAATTTTGCAAAACATGAGAATAAGTGGAGAAATAATTCCGAGATTAATGATTCTAACATACCCTATTTAAA
AACTAGTATTTATTCTTTAATCGCAAATAGTAGTTTACTAGATGAGTTAAAGAGAGTGCTAAAAGAACACGTAGCCAATG
AAAGACTTTTTTTGGAGTTTAACATTAACTCAAAAGAAACATCACAACATCTTGACATTCTTTATAAAGAAGTTAGTGTA
TTAAGTTTGGGTCAAAAAGTTGTAGCGATGTTAGATTTTTTACTAGCATATAGTGATTATTCAAAGGATTTCAGACCATT
AATTATTGATCAACCTGAAGATAATTTGGATAACCGCTATATATACAGACATTTAGTTCAACAGTTTAGAGACGTGAAAG
CTCAACGACAAATTATTTTAGCAACCCATAATGCGACAATTGTAACAAATTCCATGACCGATCAAGTGGTAATTATGGAA
TCAGATGGGGCTCATGCTTGGATTGAATCACAGGGATATGTTAGTGAAAAATTTATAAAAAACCATATTATCAATCAATT
GGAAGGTGGAAGAGACTCATTTAAACATAAGATGTCCATATATGAGACAGCTCTTTCTGAATAA

Protein sequence :
MILKIIFFWGLELRGFNNKIKSVYRELTNTKEKFGSFHKTLIHLHTPVSYDYKLFSSWTSTKYRKSTEDELFDIFFKNKK
IKVDKTKFFGSFDKVIFSSPKEYISFLLLAEAILKNEIEIVVVTDHNTTKGIKKLQTAVSIITRTYPTYNIHPHILHGVE
ISAADKLHIVCIYDHEKESWVNQWLCENIISEKDGSYQHSLTIMKDFNNQNIINYIAHFNSYNILKKGSHLSGAYKRQVF
TKENTRFIGVKNINSVEGSKNRLLTDFNCEPNFLLDNDSHDIDSVGKNNMWIKGGKISFKMFQEALLDYTVSVSLFEPNF
EQKSYIKGLYIQSRGGDRSFLTGDKLEKDRDFFLTFSPSMNCLIGGRGTGKSTLIDMLQFVLSQDCDKQSKLEFLCNHAN
AFVLYVLEDAEYIIEVSLPDVLQENRDNILQYYGQNRENRYGYPYNYNSDSIKEWTRSQYTKVYKVEGKFFKLVDKTRIL
EKMFDRRYSVNELVRTADGEKITEFISDLMLKNKNLPRPNYGLRTQTLESFEAKLQELDKYRRVRKDSILKIIDDFNQTQ
VGKLRICYEQIDRWEVPDFESTLFKSNSTLNFSFENYRISKRDVADILYLVYQELGIKGFVNVILKQNIPNRYFILLKNI
SEENFAKHENKWRNNSEINDSNIPYLKTSIYSLIANSSLLDELKRVLKEHVANERLFLEFNINSKETSQHLDILYKEVSV
LSLGQKVVAMLDFLLAYSDYSKDFRPLIIDQPEDNLDNRYIYRHLVQQFRDVKAQRQIILATHNATIVTNSMTDQVVIME
SDGAHAWIESQGYVSEKFIKNHIINQLEGGRDSFKHKMSIYETALSE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
Spaf_1101 YP_006309903.1 hypothetical protein Not tested FWisland_1 Protein 0.0 86