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Name : polA (SSUD9_0607) Accession : YP_006080092.1 Strain : Streptococcus suis D9 Genome accession: NC_017620 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 595257 - 597893 bp Length : 2637 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAAAAAAATAAATTATTATTAATTGATGGCTCTTCGGTAGCCTTCCGTGCTTTCTTTGCACTTTATAATCAAATTGA TCGTTTTAAGAGTCCGACAGGTCTTCACACCAATGCTATCTACGGCTTTAACCTCATGCTGGACCACATGATGAAGCGGA TTGAACCGACCCACATTCTCGTGGCTTTTGATGCTGGAAAGACCACCTTCCGTACGGAGATGTACGCCGATTATAAGGCA GGTCGTGCCAAGACACCAGACGAGTTCCGTGAACAATTCCCCTTCATCCGTCAGATGCTGGATGCTATGGGGGTCAAGCA TTATGAGCTGGCTCAGTACGAGGCAGACGATATTATCGGTACCTTGGACAAAATGGCAGAGCGGACAGAGATTCCTTTCG ATGTGACCATTGTTAGCGGTGATAAGGACTTGATCCAGCTGACAGACGAAAACACCGTAGTTGAGATTTCTAAGAAAGGC GTAGCCGAATTCGAAGAATTTACTCCAGCCTACCTCATGGAAAAAATGGGGATTACCCCTACTCAGTTTATTGACCTCAA GGCTTTGATGGGAGATAAGTCCGATAACATTCCTGGCGTGACCAAAATCGGTGAAAAAACAGGTCTAAAACTCCTGACAG AATTTGGTTCTTTGGATGGTATCTACGAAAACATTGACAGCATGAAGGCTTCTAAGATGAAAGAAAACCTGATTGCTGAT AAGGAGAAGGCCTTCCTATCTCGTACACTTGCTACCATTGATACTCAGGCACCAATCGAAATTGGTCTGGATGACATTGT TTATCAAGGCCCCAAGGTGGATGAACTAGGACAATTTTATGATGACATGGGCTTCAAACAATTAAGGGCTCAGTTAGGTA CGACCAGCTCGCAAGAGGAAGCGGTACTCGATTTCCAAATCGTAACGGAAATCAGCCCCGCTATGCTCAAACAAGACCAG TTTTTCTATTTTGAAATCTTGGGTGAAAATTATCACCGAGAGGATTTGGTTGGTTTAGCTTGGGGAGATAAGGAGAAAAT CTATGTCGGAGGGCCTGAGCTACTTGATAGTCCAGTCTTGCGTGACTTTTTAGAAAACCAAACTATAAAAACCTATGACT TTAAGCGTGGAAAAGTTCTTCTCGACCGAAAAGAGATTACGCTACCTCCAGCTACTTTCGATAGCCGTCTAGCCAAATAC TTGCTTTCCACCGTTGAGGACAATTCCCTAACAACCATTGCCAACCTCTATGGTCAGATCAGTCTTGTTCCAGATGAGGC AGTTTATGGCAAGGGTGCTAAGTTAGACTTGCCAGAACGCGAGATCTTTTTCCCACACTTGGCACGTAAGGTTCAGGTTT TGATTGAGACAGAAGAGCCGATGTTGACCAAATTAGAAGAAAATCAGCAATTAGATCTTTTGTTTGACATGGAGTTGCCA CTGGCAAATGTTTTAGCTAAGATGGAAATTGCTGGTATTAAGGTGGAAGCTGAGACTCTCAAAGCTATGCAATCTGAAAA CGAAGTTTTGATTGACCAGTTGACCAAGGAAATCTATGAACTAGCTGGTCAGGAATTTAATATCAATTCGCCTAAGCAGC TTGGGACCATTCTCTTTGAAGAGATGGGACTACCGTTGGAATATACCAAGAAAACCAAGACAGGCTATTCAACAGCAGTA GATGTCTTAGAACGATTAGCGCCAATTGCACCAGTTGTTTCAAAAATCTTGGAATACCGTCAGATTACCAAACTTCAATC AACTTATGTAGTCGGCTTGCAGGATGCCATTTTAGAAGATGGTAAGATCCATACCCGCTATGTGCAGGATTTGACACAAA CAGGTCGTCTATCTTCGACGGACCCTAACTTGCAAAATATTCCTGTTCGTCTAGAACAAGGGCGCTTGATTCGTAAGGCA TTTGTGCCATCGCTTGAAAATAGTGTCCTTTTGGCATCGGACTATTCACAGATTGAATTGCGCGTCTTGGCTCATATTTC TCAGGACAAGCATTTGATTGAGGCCTTCCAGCAAGGTGCAGATATTCACACTTCGACAGCTATGCGGGTCTTCGGTATCG AAAAAGCTGAGGATGTGACACCAAATGACCGTCGGAATGCCAAGGCTGTAAACTTTGGTGTCGTCTATGGTATTTCAGAT TTCGGTCTATCCAATAACTTGGGGATTACACGTAAGGAAGCTAAAGCCTATATCGATACCTATTTTGAACGCTTCCCAGG AATTAAGAATTACATGGAAACCATTGTTCGTGAGGCACGTGATAAGGGTTATGTAGAGACGATTTACAAACGCCGTCGTG AATTACCAGATATAAACTCTCGCAATTTCAATGTCCGTAATTTTGCGGAGCGAACAGCTATCAACTCACCAATTCAAGGT TCGGCCGCAGATATTCTCAAAGTAGCCATGATTAATCTTGACAAGGCTTTGACTGAAGCAGGTCTTGCGACACGTATGTT ATTGCAAGTACACGATGAGATTGTTTTGGAAGTCCCAGTGGCAGAGCTAGAAACGGTAAAAGCCATGGTAAAAGAGACCA TGGAATCGGCGATTAGCCTGTCTGTGCCATTGATTGCGGATGAAAATGAAGGTTCAACATGGTATGAAGCAAAGTAA Protein sequence : MKKNKLLLIDGSSVAFRAFFALYNQIDRFKSPTGLHTNAIYGFNLMLDHMMKRIEPTHILVAFDAGKTTFRTEMYADYKA GRAKTPDEFREQFPFIRQMLDAMGVKHYELAQYEADDIIGTLDKMAERTEIPFDVTIVSGDKDLIQLTDENTVVEISKKG VAEFEEFTPAYLMEKMGITPTQFIDLKALMGDKSDNIPGVTKIGEKTGLKLLTEFGSLDGIYENIDSMKASKMKENLIAD KEKAFLSRTLATIDTQAPIEIGLDDIVYQGPKVDELGQFYDDMGFKQLRAQLGTTSSQEEAVLDFQIVTEISPAMLKQDQ FFYFEILGENYHREDLVGLAWGDKEKIYVGGPELLDSPVLRDFLENQTIKTYDFKRGKVLLDRKEITLPPATFDSRLAKY LLSTVEDNSLTTIANLYGQISLVPDEAVYGKGAKLDLPEREIFFPHLARKVQVLIETEEPMLTKLEENQQLDLLFDMELP LANVLAKMEIAGIKVEAETLKAMQSENEVLIDQLTKEIYELAGQEFNINSPKQLGTILFEEMGLPLEYTKKTKTGYSTAV DVLERLAPIAPVVSKILEYRQITKLQSTYVVGLQDAILEDGKIHTRYVQDLTQTGRLSSTDPNLQNIPVRLEQGRLIRKA FVPSLENSVLLASDYSQIELRVLAHISQDKHLIEAFQQGADIHTSTAMRVFGIEKAEDVTPNDRRNAKAVNFGVVYGISD FGLSNNLGITRKEAKAYIDTYFERFPGIKNYMETIVREARDKGYVETIYKRRRELPDINSRNFNVRNFAERTAINSPIQG SAADILKVAMINLDKALTEAGLATRMLLQVHDEIVLEVPVAELETVKAMVKETMESAISLSVPLIADENEGSTWYEAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 75 |
