|
Name : SSU12_0864 (SSU12_0864) Accession : YP_006078295.1 Strain : Streptococcus suis SS12 Genome accession: NC_017619 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 889785 - 892292 bp Length : 2508 bp Strand : - Note : - DNA sequence : TTGCGAGGATTTAATAATAAGATAAAATCTGTTTATCGAGAATTAACAAATACCAAAGAGAAATTCGGTAGTTTTCATAA GACCTTGATTCATTTACATACACCTGTTTCTTATGATTATAAGCTATTTTCGAGCTGGACTTCAACGAAATATAGAAAAA GTACAGAAGATGAATTATTTGATATATTTTTCAAAAATAAGAAAATCAAAGTTGATAAAACAAAATTTTTTGGTAGCTTT GATAAAGTTATCTTTTCTAGCCCAAAAGAGTACATTAGTTTTCTTTTGTTAGCAGAAGCTATCTTAAAAAATGAAATAGA AATAGTTGTAGTAACTGATCATAATACTACCAAAGGTATTAAAAAACTTCAAACAGCAGTTTCAATTATAACGAGAACCT ATCCGACTTATAATATACATCCTCATATTTTACATGGAGTAGAAATTAGTGCAGCAGATAAGTTACATATTGTTTGTATA TACGATCATGAAAAAGAATCTTGGGTTAATCAATGGTTATGTGAAAATATTATAAGTGAAAAAGATGGAAGTTATCAGCA TTCGTTGACTATCATGAAAGATTTTAATAATCAAAACATAATTAACTACATTGCTCATTTCAATAGTTATAATATTTTGA AAAAAGGTTCTCACTTGTCGGGTGCATATAAGAGACAAGTTTTTACAAAAGAAAATACACGATTTATTGGTGTAAAAAAT ATAAATTCTGTTGAAGGATCGAAAAATCGTTTATTGACAGATTTTAATTGTGAACCAAATTTTTTATTAGATAATGATTC ACATGATATTGATTCAGTCGGAAAGAATAATATGTGGATAAAAGGTGGAAAGATTTCTTTTAAAATGTTCCAAGAAGCTT TGCTTGATTACACTGTATCAGTAAGTTTATTTGAACCAAATTTTGAACAAAAGTCTTACATAAAAGGTTTATACATTCAA AGTCGTGGAGGCGATAGAAGTTTTCTTACAGGTGATAAGTTAGAAAAAGATAGAGACTTCTTTTTAACATTCTCACCATC TATGAACTGTTTAATTGGAGGGAGAGGTACAGGGAAAAGTACACTAATAGATATGTTACAATTTGTACTTTCTCAGGATT GCGACAAGCAGAGTAAATTAGAATTCCTATGTAACCATGCAAATGCTTTTGTACTCTATGTTTTAGAGGATGCTGAATAT ATCATTGAGGTTAGTTTGCCAGATGTCTTGCAGGAAAATAAGGACAATATCTTACAATATTATGGGCAAAATCGTGAGAA TAGGTATGGATATCCTTATAACTACAATTCTGACTCTATCAAAGAGTGGACACGCTCTCAATATACGAAAGTATACAAAG TTGAGGGAAAATTTTTCAAATTAGTTGATAAAACTAGAATATTAGAAAAAATGTTTGATAGGAGATATTCTGTTAATGAG TTGGTTAGAACAGCGGATGGAGAAAAAATTACAGAATTTATTTCCGACTTAATGCTAAAAAATAAAAATTTACCGAGACC AAACTATGGTTTAAGAACTCAGACTCTAGAATCATTCGAAGCTAAACTACAGGAACTTGATAAATATAGGAGAGTTCGTA AGGATTCAATACTCAAAATAATTGATGATTTCAATCAAACTCAAGTTGGTAAGTTAAGAATCTGTTATGAGCAAATTGAT AGATGGGAAGTACCAGATTTTGAAAGCACTCTTTTCAAAAGTAATTCAACTCTCAATTTCTCATTTGAAAATTATAGAAT TAGTAAGCGGGATGTTGCAGATATTCTATACCTTGTTTATCAGGAGTTAGGAATAAAAGGATTTGTTAACGTTATTTTGA AACAAAATATTCCTAATAGGTATTTTATATTATTAAAAAATATTTCTGAGGAGAATTTTGCAAAACATGAGAATAAGTGG AGAAATAATTCCGAGATTAATGATTCTAACATACCCTATTTAAAAACTAGTATTTATTCTTTAATCGCAAATAGTAGTTT ACTAGATGAGTTAAAGAGAGTGCTAAAAGAACACGTAGCCAATGAAAGACTTTTTTTGGAGTTTAACATTAACTCAAAAG AAACATCACAACATCTTGACATTCTTTATAAAGAAGTTAGTGTATTAAGTTTGGGTCAAAAAGTTGTAGCGATGTTAGAT TTTTTACTAGCATATAGTGATTATTCAAAGGATTTCAGACCATTAATTATTGATCAACCTGAAGATAATTTGGATAACCG CTATATATACAGACATTTAGTTCAACAGTTTAGAGACGTGAAAGCTCAACGACAAATTATTTTAGCAACCCATAATGCGA CAATTGTAACAAATTCCATGACCGATCAAGTGGTAATTATGGAATCAGATGGGGCTCATGCTTGGATTGAATCACAGGGA TATGTTAGTGAAAAATTTATAAAAAACCATATTATCAATCAATTGGAAGGTGGAAGAGACTCATTTAAACATAAGATGTC CATATATGAGACAGCTCTTTCTGAATAA Protein sequence : MRGFNNKIKSVYRELTNTKEKFGSFHKTLIHLHTPVSYDYKLFSSWTSTKYRKSTEDELFDIFFKNKKIKVDKTKFFGSF DKVIFSSPKEYISFLLLAEAILKNEIEIVVVTDHNTTKGIKKLQTAVSIITRTYPTYNIHPHILHGVEISAADKLHIVCI YDHEKESWVNQWLCENIISEKDGSYQHSLTIMKDFNNQNIINYIAHFNSYNILKKGSHLSGAYKRQVFTKENTRFIGVKN INSVEGSKNRLLTDFNCEPNFLLDNDSHDIDSVGKNNMWIKGGKISFKMFQEALLDYTVSVSLFEPNFEQKSYIKGLYIQ SRGGDRSFLTGDKLEKDRDFFLTFSPSMNCLIGGRGTGKSTLIDMLQFVLSQDCDKQSKLEFLCNHANAFVLYVLEDAEY IIEVSLPDVLQENKDNILQYYGQNRENRYGYPYNYNSDSIKEWTRSQYTKVYKVEGKFFKLVDKTRILEKMFDRRYSVNE LVRTADGEKITEFISDLMLKNKNLPRPNYGLRTQTLESFEAKLQELDKYRRVRKDSILKIIDDFNQTQVGKLRICYEQID RWEVPDFESTLFKSNSTLNFSFENYRISKRDVADILYLVYQELGIKGFVNVILKQNIPNRYFILLKNISEENFAKHENKW RNNSEINDSNIPYLKTSIYSLIANSSLLDELKRVLKEHVANERLFLEFNINSKETSQHLDILYKEVSVLSLGQKVVAMLD FLLAYSDYSKDFRPLIIDQPEDNLDNRYIYRHLVQQFRDVKAQRQIILATHNATIVTNSMTDQVVIMESDGAHAWIESQG YVSEKFIKNHIINQLEGGRDSFKHKMSIYETALSE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| Spaf_1101 | YP_006309903.1 | hypothetical protein | Not tested | FWisland_1 | Protein | 0.0 | 86 |
