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Name : polA (SSUJS14_1353) Accession : YP_006076689.1 Strain : Streptococcus suis JS14 Genome accession: NC_017618 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1358262 - 1360898 bp Length : 2637 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAAAAAAAATAAATTATTATTAATCGATGGCTCTTCGGTAGCCTTCCGTGCTTTCTTTGCACTTTATAATCAAATTGA TCGTTTTAAGAGTCCGACAGGTCTTCACACCAATGCTATCTACGGCTTCAATCTCATGCTGGACCACATGATGAAGCGGA TTGAGCCGACCCACATTCTTGTGGCTTTTGATGCTGGAAAGACCACTTTCCGCACGGAGATGTATGCAGACTATAAGGCA GGTCGTGCCAAGACTCCAGACGAATTCCGTGAGCAGTTTCCTTTTATCCGTCAGATGTTGGATGCCATGGGAGTCAAGCA TTACGAACTGGATCAGTACGAGGCAGATGACATTATCGGTACCTTGGACAAAATGGCAGAGCGGACAGAAATTCCTTTCG ATGTGACCATTGTTAGCGGTGATAAGGACTTGATCCAGCTGACAGACGAAAACACCGTAGTTGAGATTTCTAAGAAAGGC GTAGCCGAATTCGAAGAATTTACTCCAGCCTACCTCATGGAAAAAATGGGGATTACCCCTACTCAGTTTATTGACCTCAA GGCTTTGATGGGAGATAAGTCCGATAACATTCCTGGCGTGACCAAAATCGGTGAAAAAACAGGTCTAAAACTCCTGACAG AATTTGGTTCTTTGGATGGTATCTACGAAAACATTGACAGCATGAAGGCTTCTAAGATGAAAGAAAACCTGATTGCTGAT AAGGAGAAGGCCTTCCTATCTCGTACACTTGCTACCATTGATACTCAGGCACCAATCGAAATTGGTCTGGATGACATTGT TTATCAAGGCCCCAAGGTGGATGAATTAGGACAATTTTATGATGACATGGGCTTCAAACAATTAAGGGCTCAGTTAGGTA CGACCAGCTCGCAAGAGGAAGCGGTACTCGATTTCCAAATCGTAACGGAAATCAGCCCCGCTATGCTCAAACAAGACCAG TTTTTCTATTTTGAAATCTTGGGTGAAAATTATCACCGAGAGGATTTGGTTGGTTTAGCTTGGGGAGATAAGGAGAAAAT CTATGTCGGAGGGCCTGAGCTACTTGACAGTCCAGTCTTGCGTGACTTTTTAGAAAACCAAACTATAAAAACCTATGACT TTAAGCGTGGAAAAGTTCTTCTCGACCGAAAAGAGATTACGCTACCTCCAGCTACTTTCGATAGCCGTCTAGCCAAATAC TTGCTTTCCACCGTTGAGGACAATTCCCTAACAACCATTGCCAACCTCTATGGTCAGATCAGTCTTGTTCCAGATGAGGC AGTTTATGGCAAGGGTGCTAAGTTAGACTTGCCAGAACGCGAGATCTTTTTCCCACACTTGGCACGTAAGGTTCAGGTTT TGATTGAGACAGAAGAGCCGATGTTGACCAAATTAGAAGAAAATCAGCAATTAGATCTTTTGTTTGACATGGAGTTGCCA CTGGCAAATGTTTTAGCTAAGATGGAAATTGCTGGTATTAAGGTGGAAGCTGAGACTCTCAAAGCTATGCAATCTGAAAA CGAAGTTTTGATTGACCAGTTGACTAAGGAAATCTATGAACTAGCTGGTCAGGAATTTAATATCAATTCGCCTAAGCAGC TTGGGATCATTCTCTTTGAAGAGATGGGACTACCGTTGGAATATACCAAGAAAACCAAGACAGGCTATTCAACAGCAGTA GATGTCTTAGAACGATTAGCGCCAATTGCACCAGTTGTTTCAAAAATCTTGGAATACCGTCAGATTACCAAGCTTCAATC AACTTATGTAGTCGGCTTGCAGGATGCCATTTTAGAAGATGGTAAGATCCATACCCGCTATGTACAGGATTTGACACAAA CAGGTCGCCTATCTTCGACGGACCCTAACTTGCAAAATATTCCTGTTCGTCTAGAACAAGGGCGCTTGATTCGTAAGGCA TTTGTGCCATCGCTTGAAAATAGTGTCCTTTTAGCATCGGACTATTCACAGATTGAATTGCGCGTCTTGGCTCATATTTC TCAGGACAAGCATTTGATTGAGGCCTTCCAGCAAGGTGCAGATATTCACACTTCGACAGCTATGCGGGTCTTCGGTATCG AAAAAGCTGAGGATGTGACACCAAATGACCGTCGGAATGCCAAGGCTGTAAACTTTGGTGTCGTCTATGGTATTTCAGAT TTCGGTCTATCCAATAACTTGGGGATTACACGTAAGGAAGCTAAAGCCTATATCGATACCTATTTTGAACGCTTCCCAGG AATTAAGAATTACATGGAAACCATTGTTCGTGAGGCACGTGATAAGGGTTATGTAGAGACGATTTACAAACGCCGTCGTG AATTACCAGATATAAACTCTCGCAATTTCAATGTCCGTAATTTTGCGGAACGAACAGCCATCAACTCACCAATTCAAGGT TCGGCCGCAGATATTCTCAAAGTAGCCATGATTAATCTCGACAAGGCTTTGACTGAAGCAGGTCTTGCGACACGTATGTT ATTGCAAGTACACGATGAGATTGTTTTGGAAGTCCCAGTGGCAGAGCTAGAAACGGTAAAAGCCATGGTAAAAGAGACCA TGGAATCGGCGATTAGCCTGTCTGTACCATTGATTGTGGATGAAAATGAGGGACCGACATGGTATGAAGCTAAGTAA Protein sequence : MKKNKLLLIDGSSVAFRAFFALYNQIDRFKSPTGLHTNAIYGFNLMLDHMMKRIEPTHILVAFDAGKTTFRTEMYADYKA GRAKTPDEFREQFPFIRQMLDAMGVKHYELDQYEADDIIGTLDKMAERTEIPFDVTIVSGDKDLIQLTDENTVVEISKKG VAEFEEFTPAYLMEKMGITPTQFIDLKALMGDKSDNIPGVTKIGEKTGLKLLTEFGSLDGIYENIDSMKASKMKENLIAD KEKAFLSRTLATIDTQAPIEIGLDDIVYQGPKVDELGQFYDDMGFKQLRAQLGTTSSQEEAVLDFQIVTEISPAMLKQDQ FFYFEILGENYHREDLVGLAWGDKEKIYVGGPELLDSPVLRDFLENQTIKTYDFKRGKVLLDRKEITLPPATFDSRLAKY LLSTVEDNSLTTIANLYGQISLVPDEAVYGKGAKLDLPEREIFFPHLARKVQVLIETEEPMLTKLEENQQLDLLFDMELP LANVLAKMEIAGIKVEAETLKAMQSENEVLIDQLTKEIYELAGQEFNINSPKQLGIILFEEMGLPLEYTKKTKTGYSTAV DVLERLAPIAPVVSKILEYRQITKLQSTYVVGLQDAILEDGKIHTRYVQDLTQTGRLSSTDPNLQNIPVRLEQGRLIRKA FVPSLENSVLLASDYSQIELRVLAHISQDKHLIEAFQQGADIHTSTAMRVFGIEKAEDVTPNDRRNAKAVNFGVVYGISD FGLSNNLGITRKEAKAYIDTYFERFPGIKNYMETIVREARDKGYVETIYKRRRELPDINSRNFNVRNFAERTAINSPIQG SAADILKVAMINLDKALTEAGLATRMLLQVHDEIVLEVPVAELETVKAMVKETMESAISLSVPLIVDENEGPTWYEAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 75 |
