Gene Information

Name : polA (INV104_00260)
Accession : YP_006061737.1
Strain : Streptococcus pneumoniae INV104
Genome accession: NC_017591
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : DNA polymerase I
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 2.7.7.7
Position : 31525 - 34158 bp
Length : 2634 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGATAAGAAAAAATTATTATTGATTGATGGGTCTTCTGTAGCTTTTCGGGCGTTTTTTGCGCTGTATCAGCAGTTGGA
CCGTTTTAAGAATGCGGCTGGTTTGCATACCAATGCGATTTATGGTTTTCAGTTGATGTTGAGTCATTTGTTGGAGCGGG
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GGTCGGGCCAAGACTCCTGATGAGTTTCGTGAGCAATTTCCTTTCATTCGTGAGTTGCTGGATCATATGGGGATTCGTCA
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CAGCTGATGTGGCTGAGGGTTTGGATTTTACTATTGTTGACCAAATCAGTCAAGATATGCTGAGTGAAGAGTCTATCTTC
CACTTTGAGCTTTTTGGTGAGAATTATCATACGGATAATTTGGTTGGATTTGCCTGGTCTTGTGGGGATAAGCTCTATGC
CACAGACAAGCTTGAGCTGTTGCAAGACCCGATTTTCAAGGATTTCTTAGAAAAAACATCTCTGAGAGTTTATGACTTTA
AGAAGGTTAAAGTTCTTTTGCAACGTTTTGGTGTGGATTTGCAGGCGCCTGCTTTTGACATCCGTTTGGCTAAATACCTC
CTTTCGACTGTGGAGGACAATGAAATTGCGACCATCGCTAGTCTTTATGGTCAGACTTACTTGGTTGATGATGAAACTTT
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TAGAAACAGAGCCTATTTTACTTGAAAAACTCAGCGAAAATGGGCAATTAGAGCTTCTTTATGATATGGAGCAACCTCTG
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GCTTGTCATTGAAAAACTGACTCAAGAGATTTACGAGCTGGCTGGTGAGGAGTTTAATGTCAACTCGCCTAAGCAGTTGG
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GGCTTGTCTAATAATTTGGGAATTAGTCGTAAGGAAGCCAAAGCCTACATTGATACCTACTTTGAACGTTTTCCAGGTAT
TAAAAACTACATGGATGAAGTGGTGCGGGAGGCGCGTGATAAGGGCTATGTAGAGACCCTCTTTAAGCGTCGCCGTGAGT
TGCCAGATATCAATTCGCGCAACTTCAATATTCGTGGTTTTGCGGAGCGAACTGCTATCAACTCACCTATCCAGGGTTCG
GCAGCAGATATTCTCAAGATTGCCATGATTCAGCTGGATAAAGCCTTGGTTGCAGGTGGTTATCAGACTAAGATGCTGTT
ACAAGTGCACGATGAAATCGTCCTTGAAGTGCCTAAATCTGAATTGGTAGAGATGAAAAAATTGGTGAAACAAACCATGG
AAGAAGCCATTCAACTCAGTGTTCCTCTTATCGCAGATGAGAATGAAGGGGCAACCTGGTACGAGGCTAAATAA

Protein sequence :
MDKKKLLLIDGSSVAFRAFFALYQQLDRFKNAAGLHTNAIYGFQLMLSHLLERVEPSHILVAFDAGKTTFRTEMYADYKG
GRAKTPDEFREQFPFIRELLDHMGIRHYELAQYEADDIIGTLDKLAEQDGFDITIVSGDKDLIQLTDEHTVVEISKKGVA
EFEAFTPDYLMEEMGLTPAQFIDLKALMGDKSDNIPGVTKVGEKTGIKLLLEHGSLEGIYENIDGMKTSKMKENLINDKE
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LSTVEDNEIATIASLYGQTYLVDDETFYGKGVKKAIPEREKFLEHLACKLAVLVETEPILLEKLSENGQLELLYDMEQPL
AFVLAKMEIAGIVVKKETLLEMQAENELVIEKLTQEIYELAGEEFNVNSPKQLGVLLFEKLGLPLEYTKKTKTGYSTAVD
VLERLAPIAPIVKKILDYRQIAKIQSTYVIGLQDWILADGKIHTRYMQDLTQTGRLSSVDPNLQNIPARLEQGRLIRKAF
VPEWEDSVLLSSDYSQIELRVLAHISKDEHLIKAFQEGADIHTSTAMRVFGIERPDNVTANDRRNAKAVNFGVVYGISDF
GLSNNLGISRKEAKAYIDTYFERFPGIKNYMDEVVREARDKGYVETLFKRRRELPDINSRNFNIRGFAERTAINSPIQGS
AADILKIAMIQLDKALVAGGYQTKMLLQVHDEIVLEVPKSELVEMKKLVKQTMEEAIQLSVPLIADENEGATWYEAK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
polA YP_281523.1 DNA polymerase I Not tested Not named Protein 0.0 73