Gene Information

Name : copB (STH8232_1032)
Accession : YP_006040690.1
Strain : Streptococcus thermophilus JIM 8232
Genome accession: NC_017581
Putative virulence/resistance : Resistance
Product : Cu2+-Cu+-Ag+-P-type ATPase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 871519 - 873615 bp
Length : 2097 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence : 
ATGTCAAATAAAACTCATTCGTCTAATTACGAAGAAATGATGTCTGAGCATCATCACAATCATGAAATGGTGGATATGAA
GCACGAAAATCATGAGATGCACAACATGCACAACATGCACAATATGGATAATATGCATGATATGGACAATATGGATATGA
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CTACTCATTTCACCAATCGCTGGCTTTACTATCCTTAAATTCCCCGGAAGTGAAATTTTGCAACTTATCCTTGGTACAAT
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GGTATCTTCTCATTAATTTTTTGGACAATTAGTTATAACTTTAGTTTTGCTCTACTTCTTGCGGTTTCTGTTTTTGTAAT
TGCATGTCCACACGCTTTAGGTCTTGCGGTTCCACTTATTATTTCTCGCTTAACCAGTATTTCTGCTAAAAATGGTTTAT
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GGTAAGTTTATTGTCCGTAATGTTATTGATTTTACTGATGAAACAGACATTCTCCAAATCATGGCAGCACTTGAAGGAAG
TTCCACTCACCCGATTGCTCAATCAATCGTTTCAGCTGCTAAACCTCTTAAAAATCTAAAAGTTGAAGCGGTTGAAAATA
TTCCAGGAGTTGGAATTAAAGGGCAAGTTAATCAAAACTTTTATCAAATTGTTAACTATAAATATCTTCGTGAAAATCAA
CTTTCTTATGATGAACAAAAGATTGCTCAATATTTAGATTTAGGTTTAACTTTATCTTTCCTAATCAATGAACAACAAGA
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TTACCCCTGTTATGCTCACGGGTGATAATAAAGAAACTGCTCAAAAAATTGCTAGTGCACTAAATATTACCGAATTTAGA
GCGGAATTAAAACCTGAAGATAAAGCAGAAATTGTGAAAGAATACCAAAAGAAAGCCGGCGTTCTTTTCATTGGTGATGG
TGTCAATGATTCCCCAGCTCTTGCAACTGCTACGATTGGTTTTGCGATTGGAGCAGGAACTTCGGTTGCTATCAGTACCG
CTGATGTCGTCCTAGTTAACTCCAATCCAAGTGACGTCTTGGATATGATTAATATCTCCAAACGCATGCTTAGAAAAATG
AAACAAAACCTCTGGTTTGGAGCAGGCTATAACATTATTGCTATTCCTGTTGCAGCGGGTATTCTTTATCCATTTACAGG
ATTTTATATTGACCCTCTCATTGCAGCAGTCCTGATGTCAATCTCAACCGTGATTGTCTCAATCAACGCGATGGGATTGA
GGTATGATAAAAAATAG

Protein sequence : 
MSNKTHSSNYEEMMSEHHHNHEMVDMKHENHEMHNMHNMHNMDNMHDMDNMDMMNHGGHMMHMGDMSKKLKVAIILMIPL
LLISPIAGFTILKFPGSEILQLILGTIIFFYSGTPFFRGAKGELKSRKPAMMMLITMGISVAYAYSVYATIMSLNGHMGM
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• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SH0105 YP_252020.1 hypothetical protein Not tested SCCmec Protein 3e-101 48

• Homologs from CARD and BacMet (resistance genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
copB YP_006040690.1 Cu2+-Cu+-Ag+-P-type ATPase BAC0079 Protein 4e-119 48
copB YP_006040690.1 Cu2+-Cu+-Ag+-P-type ATPase BAC0629 Protein 9e-108 46
copB YP_006040690.1 Cu2+-Cu+-Ag+-P-type ATPase BAC0383 Protein 6e-111 46