Gene Information

Name : nrdE (STH8232_1495)
Accession : YP_006041131.1
Strain : Streptococcus thermophilus JIM 8232
Genome accession: NC_017581
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ribonucleotide reductase subunit alpha
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1242359 - 1244518 bp
Length : 2160 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGTCTTTAAAAAATCTTGGCGATGTTTCTTACTTCCGCCTCAACAACGAAATTAACCGTCCTGTAAACGGTCAGATTCC
TTTGCATAAGGATAAAGAAGCGCTTCGTGCCTTTTTCCTTGAAAATGTTAAGCCAAATTCAATGGCATTCAACAGCATCA
CAGATAAAATTAATTATTTGATTGAAAACGACTATATTGAGTCTGAATTCATCGGTAAATATGAACCTGCTTTCATCGAA
AAATTGTCTGCAGAAATTCATGCTCAAAAATTCCGCTTTCAATCTTTCATGGCAGCCTACAAGTTCTACCAACAATATGC
TCTCAAAACAAACGATGGCGAGACATACCTTGAAAGTTTTGAAGATCGTGTTCTTTTTAATGCTCTTTACTTCGCTGATG
GTGATGAAAACCTGGCTAGTGACCTTGCTAACGAAATGATTCACCAACGTTATCAACCTGCTACTCCTTCATTTTTAAAT
GCTGGACGTAGTCGTCGTGGAGAACTCGTTTCATGTTTCCTTATCCAAGTAACGGACGATATGAATTCCATCGGTCGTTC
TATTAACTCAGCTCTCCAATTATCACGTATTGGTGGAGGGGTTGGTATTAGCCTATCTAACCTACGTGAAGCTGGTGCTC
CTATCAAGGGATATGCTGGTGCTGCTTCTGGAGTTGTCCCAGTTATGAAGCTTTTTGAAGACAGCTTCTCTTACTCAAAT
CAACTTGGTCAACGTCAAGGTGCTGGTGTTGTTTATCTGGATGTTTTCCACCCAGATATCCTTGCCTTCCTTTCAACTAA
GAAAGAGAACGCTGATGAAAAGGTACGTGTTAAGACATTGTCACTAGGTGTTACAGTACCAGATAAATTCTACGAGTTAG
CACGTAATAATGAAGATATGTATCTCTTCAGCCCCTACTCTCTCGAAAAAGAATACGGTAAACCATATAACTACATTGAT
ATTACAGCTATGTATGATGAATTGGTTGCCAATCCTAATATCACCAAAACTAAGATTAATGCGCGTGAGTTAGAAACTGA
AATTTCTAAACTCCAACAAGAATCTGGTTACCCATATATCATCAACGTTGATACAGCTAACAGACATAACCCAATTGATG
GTAAAATTGTTATGTCCAACCTCTGTTCTGAGATTCTCCAAGTTCAAACACCAAGTGAACTTAACGATTCTCAAGAATTT
GTTAAACTCGGTACAGATATCTCATGTAACCTTGGATCTACTAATATCATGAACATGATGACTTCACCTGACTTTGGTCG
TTCCATTAAGGCTATGACACGTGCGCTTACCTTTGTTACAGACAACTCAAGTATCGATGCCGTTCCATCAATAAAAAATG
GGAACCAACAAGCTCATACCTTCGGTTTAGGAGCTATGGGGCTTCACTCTTACCTTGCTAAACACCATATCGAGTATGGT
AGCCCAGAATCTGTTGAATTCACTAATATCTACTTCATGCTTATGAACTACTGGACTTTAGTTGAGTCTAACAATATCGC
CCGTGAACGTCAAGAAACCTTTGTCGGCTTTGAGAATTCAAAATATGCTGACGGTTCTTACTTTGATAAATACGTTACAG
GGCAATACGTTCCTAAATCTGACCGTGTTAAAGAACTTTTCGAAGGCCACTTCATCCCACAAGCCAAGGATTGGGAGGAA
CTACGTGAACTCGTTAAAAAAGATGGTCTCTACCATCAAAACCGTTTGGCTGTTGCGCCAAATGGCTCAATCTCTTACAT
TAACGACTGTTCTGCTTCTATTCATCCAATCACACAACGTATTGAAGAACGTCAAGAGAAGAAAATCGGAAAAATTTACT
ATCCAGCCAACGGTCTTTCAACAGACACTATTCCTTTCTACACTTCAGCCTACGACATGGACATGCGTAAAGTTATCGAC
GTTTATGCCGCTGCGACTGAACACGTTGATCAAGGTTTGTCATTAACCCTATTTTTGCGTAGTGAGTTGCCTAAAGAAAT
TTACGAATGGAAAACAGAAAATAAACTAACAACTCGTGATCTTTCTATCCTTCGCAACTACGCCTTTAACAAAGGAATCA
AGTCAATCTACTACATCCGTACTTACACAGATGACGGCGAAGAGGTTGGCTCTAACCAGTGTGAAAGCTGTGTCATCTAA

Protein sequence :
MSLKNLGDVSYFRLNNEINRPVNGQIPLHKDKEALRAFFLENVKPNSMAFNSITDKINYLIENDYIESEFIGKYEPAFIE
KLSAEIHAQKFRFQSFMAAYKFYQQYALKTNDGETYLESFEDRVLFNALYFADGDENLASDLANEMIHQRYQPATPSFLN
AGRSRRGELVSCFLIQVTDDMNSIGRSINSALQLSRIGGGVGISLSNLREAGAPIKGYAGAASGVVPVMKLFEDSFSYSN
QLGQRQGAGVVYLDVFHPDILAFLSTKKENADEKVRVKTLSLGVTVPDKFYELARNNEDMYLFSPYSLEKEYGKPYNYID
ITAMYDELVANPNITKTKINARELETEISKLQQESGYPYIINVDTANRHNPIDGKIVMSNLCSEILQVQTPSELNDSQEF
VKLGTDISCNLGSTNIMNMMTSPDFGRSIKAMTRALTFVTDNSSIDAVPSIKNGNQQAHTFGLGAMGLHSYLAKHHIEYG
SPESVEFTNIYFMLMNYWTLVESNNIARERQETFVGFENSKYADGSYFDKYVTGQYVPKSDRVKELFEGHFIPQAKDWEE
LRELVKKDGLYHQNRLAVAPNGSISYINDCSASIHPITQRIEERQEKKIGKIYYPANGLSTDTIPFYTSAYDMDMRKVID
VYAAATEHVDQGLSLTLFLRSELPKEIYEWKTENKLTTRDLSILRNYAFNKGIKSIYYIRTYTDDGEEVGSNQCESCVI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1481 YP_001800875.1 ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Not tested Not named Protein 0.0 53