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Name : lctP (SPSE_0442) Accession : YP_006014618.1 Strain : Staphylococcus pseudintermedius ED99 Genome accession: NC_017568 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 516919 - 518523 bp Length : 1605 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF02652, match to protein family HMM TIGR00795 DNA sequence : ATGTTAGTAGAGCATTTTGATCCATTTCACAATCTTGCAATTTCTGCATTGGTTGCAAGTATTCCAATCATTTTATTCTT GTTATGTTTAACAGTGTTTAAAATGAAAGGGATTTATGCAGCAATTACAACACTCGTCGTCACACTTGTGATTGCATTAG TTGTATTTAAATTACCAGTAGGCATTGCTTCTGGTGGTATTTTAGAAGGTTTCTATCAAGGTATTTTACCAATTGGCTTT ATCGTTATGATGGCCGTATGGTTATACAAAGTGACAGTGGCGACAGGTCAGTTTGCTATTGTACAAGATAGTATCACGAC AATTTCTGAAGACCAACGTATTCAATTGTTATTAATTGGTTTTGCGTTCAACGCATTTTTAGAAGGTGTAGCTGGATTCG GTGTACCAATCGCAATCTGTGCGGTATTACTGATTCAACTTGGATTTAAACCATTACAAGCTGCAATGCTTTGTTTAGTA GGTAACGGTGCAGCAGGTGCATTTGGTGCTATTGGTTTACCAGTTTCTGTTATCGATACATTAGCATTAAAAGGTGACGT ATCAGCATTAGACGTTGCTCAAGCGACAAACTTAAGTTTACCTATTTTAAGTGTCATTGTACCTTTCTTATTAGTCTTTA TTATCGACGGATTTAAAGGGATTAAAGAAACATTACCGGCGATTATTGTAACAATCGTGCCATTTGTTGTATTACAAGTC TTCTTTAACCAATTTTTCGGTCCTGAATTAGTGGATATCCTTCCACCACTTGCTTCAATGGGTGCATTAGCATTATTCTC TAAAAAATTCCAACCGAAAAATATTTTCCGTTTAAATGCTGGCGAAGAAAAGATGGAAGTCAAACATCATTCTTTCAAAG AAGTCGTATTTGCATGGAGTCCATTCATTATTTTAACAATTCTTGTATTAATTTGGAGCTCAAAAGCATTTAAAGGCCTC TTTTTGGAAGATGGCGCATTATCATTTATGAATGTTAAATTTGGTATTCCAGGAACAATGAATGATATTTCGGGTCATCC GATTATGTTAACATTCAACATTTTAAATCAAACAGGTACAGCGTTATTGATTGCCGGTATTATTACGGTTTTAATTTCGT CAAAAGTCAACTTCAAACGTGCCGGTGCATTGTTTGTAGAAGCATTTAAAGAATTATGGTTACCGATTTTAACAATTTGT TTCATCTTAGCCATTGCGAAAGTGACAACATATGGTGGTTTAACAAGCGCGATGGGTGAAGGTATTTCAAAAACTGGAGC AGCCTTCCCATTCTTATCACCAATTCTCGGTTGGATTGGCGTGTTTATGACAGGTTCAGTTACGAACAACAACGCATTAT TCGCACCAATTCAAGCGTCAGTTGCCCCTCAAGTTGGTACAAGTGGTGCCTTACTTGTTGGCGCTAACACTGCAGGGGGT GCGATTGCGAAATTGATTTCTCCACAATCTATTGCGATTGCGACTGCAGCCGTAAAACAAGTAGGTAGAGAGTCAGAGTT GTTGAAGATGACTTTAAAATATAGTGTCGGTTTATTGATATTCTGGTGTATTTGGACGTTTATTTTATCGTTAATTTTAG GTTAA Protein sequence : MLVEHFDPFHNLAISALVASIPIILFLLCLTVFKMKGIYAAITTLVVTLVIALVVFKLPVGIASGGILEGFYQGILPIGF IVMMAVWLYKVTVATGQFAIVQDSITTISEDQRIQLLLIGFAFNAFLEGVAGFGVPIAICAVLLIQLGFKPLQAAMLCLV GNGAAGAFGAIGLPVSVIDTLALKGDVSALDVAQATNLSLPILSVIVPFLLVFIIDGFKGIKETLPAIIVTIVPFVVLQV FFNQFFGPELVDILPPLASMGALALFSKKFQPKNIFRLNAGEEKMEVKHHSFKEVVFAWSPFIILTILVLIWSSKAFKGL FLEDGALSFMNVKFGIPGTMNDISGHPIMLTFNILNQTGTALLIAGIITVLISSKVNFKRAGALFVEAFKELWLPILTIC FILAIAKVTTYGGLTSAMGEGISKTGAAFPFLSPILGWIGVFMTGSVTNNNALFAPIQASVAPQVGTSGALLVGANTAGG AIAKLISPQSIAIATAAVKQVGRESELLKMTLKYSVGLLIFWCIWTFILSLILG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-77 | 44 |
