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Name : coxA (rpr22_CDS395) Accession : YP_005998829.1 Strain : Rickettsia prowazekii Rp22 Genome accession: NC_017560 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase polypeptide I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.9.3.1 Position : 494862 - 496466 bp Length : 1605 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAACTCATTAACAAATATAGAAGACTTAAATTGTGATAATCAACATATTCCAAACGGTTTTAGGAGATGGATTTTTTC TACTAATCACAAAGATATCGGAATTATGTATATCATATTTGCTATTTTTGCTGGAGTTGTCGGAGGGTTATTTTCCCTTC TCTTTAGGTTAGAGCTTGCAATGCCAGGCGGCACTTTCTTAAATCATAATTTTCAGTTATATAACGTGCTTATCACGGTA CATGCTATTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCTGCATTATTTAGTGGATTTGGTAACTATTTTGTACCTCTATTAAT AGGAGCGCCTGATATGGCTTTTCCACGCCTTAACAATATAAGTTTTTGGCTATTAATTCCTGCTTTTCTTTTACTTATTA GTTCAACTTTTATTGACGGCGGGCCTGGAACTGGATGGACACTCTACCCTCCTTTAAGTAATTTGAACGGTCATACTGGA GCAGCAGTCGATGTAGCTATTTTTAGCTTACATTTAACCGGTCTCTCATCAATACTCGGATCAATTAATTTAATCGTTAC TATATTTAATATGCGAGCTCCAGGGATGGGGCTTTTCAAAATGCCATTATTCGTTTGGTCGATATTAGTAACCGCATTTC TGATAATCTTAGCTATGCCTGTGCTTAGCGGAGCTATCACTATGCTACTGACCGATCGTAACTTTGGCACCACTTTTTTT AAACCTGATGGTGGCGGCGATCCTTTATTATTTCAACATCTTTTTTGGTTTTTTGGTCATCCTGAAGTATACATTGTAAT ACTCCCAGGCTTTGGCATAGTAAGTCAGGTTATTTCAACTTTTTCACGTAAACCTATATTTGGTTATCAAGGTATGGTTG GAGCTATGGTCATAATCGGTTTCGTTGGATTTATTGTATGGGCTCATCATATGTTTACTGTTGGACTTTCTTATAATGCA CTGATATATTTCACTGCTGGAACAATGATTATAGCAGTACCAACAGGCATTAAAATATTTAGCTGGATAGCAACTATGTG GGGTGGTTCTATTACATTTCCAACTCCTATGTTATTTGCAATTGGATTTATTATATTATTCACAATTGGCGGCGTAACAG GTATAATATTATCAAATTCTGCGCTTGATAGAGTCCTGCACGATACATATTATGTTGTCGCACATTTTCATTATACGATG TCTCTCGGCGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGAAAAATATCTGGAAAACAATATCCAGAAAT TCTAGGCAAAATTCATTTTTGGATTACATTTATTGGTGTTAATTTAACTTTTTTTCCGCAACATTTTTTAGGTCTTGCGG GAATGCCAAGAAGAATACCTGACTATCCTGAGGCTTTTGCAGGTTGGAATATGGTTTCATCAATAGGCGCAGGTATTTCT ATATTCGCTGCTTTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTACACGCTAAAATACGGCAAAAATTGTACAGCAAATCCTTGGGG TGATGGAGCTGATACACTCGAGTGGAAACTTAATTCACCACCACCATTCCATACTTTTGAAACACCACCACATATTGTGG AGTAA Protein sequence : MNSLTNIEDLNCDNQHIPNGFRRWIFSTNHKDIGIMYIIFAIFAGVVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHNFQLYNVLITV HAIIMVFFMIMPALFSGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLIPAFLLLISSTFIDGGPGTGWTLYPPLSNLNGHTG AAVDVAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLSGAITMLLTDRNFGTTFF KPDGGGDPLLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQVISTFSRKPIFGYQGMVGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNA LIYFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFAIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTM SLGALFTAFAGFYYWFGKISGKQYPEILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFAGWNMVSSIGAGIS IFAAFYFVFIVFYTLKYGKNCTANPWGDGADTLEWKLNSPPPFHTFETPPHIVE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 3e-92 | 48 |
