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Name : LMLG_1990 (LMLG_1990) Accession : YP_005970266.1 Strain : Listeria monocytogenes Finland 1988 Genome accession: NC_017547 Putative virulence/resistance : Virulence Product : internalin B Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 464652 - 466544 bp Length : 1893 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGAAAGAAAAGCACAACCCAAGAAGGAAGTATTGTTTAATCTCAGGTTTAGCTATTATTTTTAGTTTATGGATAATTAT TGGAAACGGGGCGAAAGTACAAGCGGAGACTATCACCGTGCCAACGCCAATCAAGCAAATTTTTTCAGATGATGCTTTTG CAGAAACAATCAAAGACAATTTAAAGAAAAAAAGTGTGACAGATGCAGTGACACAAAATGAATTAAATAGTATAGATCAA ATCATTGCGAATAATAGTGATATTAAATCCGTTCAAGGAATTCAGTATTTACCCAATGTGACAAAGTTATTTTTAAACGG GAATAAACTAACAGATATAAAACCCTTAACAAACTTGAAAAATTTAGGATGGCTTTTTTTAGACGAAAATAAAATTAAAG ACCTAAGTTCGCTCAAGGATCTAAAAAAATTAAAATCACTTTCTTTGGAGCATAATGGTATAAGTGATATAAACGGACTT GTTCATTTACCACAGCTGGAAAGTTTGTATTTGGGAAATAATAAAATAACGGATATAACGGTTCTTTCACGTTTAACTAA ACTGGATACTTTGTCTCTCGAAGATAACCAAATTAGTGATATTGTGCCACTTGCAGGTTTAACTAAATTGCAGAACCTAT ATTTAAGTAAAAATCACATAAGCGATTTAAGAGCATTAGCAGGACTTAAAAATCTAGATGTTTTAGAATTATTTAGCCAA GAATGTCTTAATAAGCCTATTAATCATCAATCTAATTTGGTCGTTCCGAATACAGTGAAAAACACTGATGGGTCGTTAGT GACTCCAGAAATAATAAGTGATGATGGCGATTATGAAAAACCTAATGTTAAATGGCATTTACCAGAATTTACAAATGAAG TGAGTTTTATTTTCTATCAGCCAGTCACTATTGGAAAAGCAAAAGCAAGATTTCATGGGAGAGTAACCCAACCACTGAAA GAGGTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTGCACC TAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTGGAATTTTAATA CGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAAAAAGCAGTCAACTTAACC CGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAGATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCT AGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAATGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATA TTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACCGATACGATAAAATGGAATATGACAAAGGGGTTACCGCTTATGCA AGAGTGAGAAATGCGTCTGGAAATTCGGTTTGGACAAAACCCTACAACACAGCCGGCGCTAAACACGTGAATAAGCTATC GGTCTACCAAGGTAAAAATATGCGTATCTTGCGCGAAGCCAAAACACCAATTACTACATGGTATCAATTTAGCATTGGTG GTAAAGTAATTGGTTGGGTCGATACCCGAGCACTTAACACATTCTACAAACAAAGCATGGAAAAGCCAACCCGTTTAACT CGTTATGTCAGCGCCAATAAAGCTGGCGAATCGTACTATAAAGTCCCGGTAGCAGATAATCCAGTCAAAAGGGGTACTTT AGCCAAGTATAAAAATCAAAAGTTAATTGTTGATTGTCAAGCAACCATCGAAGGTCAACTTTGGTACCGAATAAGGACTA GTTCCACTTTCATTGGTTGGACGAAAGCAGCTAATTTAAGGGCACAGAAATAA Protein sequence : MKEKHNPRRKYCLISGLAIIFSLWIIIGNGAKVQAETITVPTPIKQIFSDDAFAETIKDNLKKKSVTDAVTQNELNSIDQ IIANNSDIKSVQGIQYLPNVTKLFLNGNKLTDIKPLTNLKNLGWLFLDENKIKDLSSLKDLKKLKSLSLEHNGISDINGL VHLPQLESLYLGNNKITDITVLSRLTKLDTLSLEDNQISDIVPLAGLTKLQNLYLSKNHISDLRALAGLKNLDVLELFSQ ECLNKPINHQSNLVVPNTVKNTDGSLVTPEIISDDGDYEKPNVKWHLPEFTNEVSFIFYQPVTIGKAKARFHGRVTQPLK EVYTVSYDVDGTVIKTKVEAGTRITAPKPPTKQGYVFKGWYTEKNGGHEWNFNTDYMSGNDFTLYAVFKAETTEKAVNLT RYVKYIRGNAGIYKLPREDNSLKQGTLASHRCKALTVDREARNGGKLWYRLKNIGWTKAENLSLDRYDKMEYDKGVTAYA RVRNASGNSVWTKPYNTAGAKHVNKLSVYQGKNMRILREAKTPITTWYQFSIGGKVIGWVDTRALNTFYKQSMEKPTRLT RYVSANKAGESYYKVPVADNPVKRGTLAKYKNQKLIVDCQATIEGQLWYRIRTSSTFIGWTKAANLRAQK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
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| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| LMLG_1990 | YP_005970266.1 | internalin B | VFG0076 | Protein | 0.0 | 99 |
