Name : LMKG_01476 (LMKG_01476) Accession : YP_005967351.1 Strain : Listeria monocytogenes FSL R2-561 Genome accession: NC_017546 Putative virulence/resistance : Virulence Product : internalin B Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 455700 - 457592 bp Length : 1893 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGAAAGAAAAGCACAACCCAAGAAGGAAGTATTGTTTAATCTCAGGTTTAGCTATTATTTTTAGTTTATGGATAATTAT TGGAAACGGGGCGAAAGTACAAGCGGAGACTATCACCGTGCCAACGCCAATCAAGCAAATTTTTTCAGATGATGCTTTTG CAGAAACAATCAAAGACAATTTAAAGAAAAAAAGTGTGACAGATGCAGTGACACAAAATGAATTAAATAGTATAGATCAA ATCATTGCGAATAATAGTGATATTAAATCCGTTCAAGGAATTCAGTATTTACCCAATGTGACAAAGTTATTTTTAAACGG GAATAAACTAACAGATATAAAGCCCTTAGCAAACTTGAAAAATTTAGGATGGCTTTTTTTAGACGAAAATAAAGTTAAGG ACCTAAGTTCGCTCAAGGATTTAAAAAAATTAAAATCACTTTCTTTGGAGCATAATGGTATAAGTGATATAAACGGACTT GTTCATTTACCACAGCTGGAAAGTTTGTATTTGGGAAATAATAAAATAACGGATATAACGGTTCTTTCACGTTTAACTAA ACTGGATACTTTGTCTCTCGAAGATAACCAAATTAGTGATATTGTGCCACTTGCAGGTTTAACTAAATTGCAGAACCTAT ATTTAAGTAAAAATCACATAAGCGATTTAAGAGCATTAGCAGGACTTAAAAATCTAGATGTTTTAGAATTATTTAGCCAA GAATGTCTTAATAAGCCTATTAATCATCAATCTAATTTGGTTGTTCCGAATACAGTGAAAAACACTGATGGGTCGTTAGT GACTCCAGAAATAATAAGTGATGATGGCGATTATGAAAAACCTAATGTTAAATGGCATTTACCAGAATTTACAAATGAAG TGAGTTTTATTTTCTATCAGCCAGTCACTATTGGAAAAGCAAAAGCAAGATTTCATGGGAGAGTAACCCAACCACTGAAA GAGGTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTGCACC TAAACCTCCGACTAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTGGAATTTTAATA CGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAAAAAGCAGTCAACTTAACC CGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAGATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCT AGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAATGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATA TTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACCGATACGATAAAATGGAATATGACAAAGGGGTTACCGCTTATGCA AGAGTGAGAAATGCGTCTGGAAATTCGGTTTGGACAAAACCCTACAACACAGCCGGCGCTAAACACGTGAATAAGCTATC GGTCTACCAAGGTAAAAATATGCGTATCTTGCGCGAAGCCAAAACACCAATTACTACATGGTATCAATTTAGCATTGGTG GTAAAGTAATTGGTTGGGTCGATACCCGAGCACTTAACACATTCTACAAACAAAGCATGGAAAAGCCAACCCGTTTAACT CGTTATGTCAGCGCCAATAAAGCTGGCGAATCGTACTATAAAGTCCCGGTAGCAGATAATCCAGTCAAAAGGGGTACTTT AGCCAAGTATAAAAATCAAAAGTTAATTGTTGATTGTCAAGCAACCATCGAAGGTCAACTTTGGTACCGAATAAGGACTA GTTCCACTTTCATTGGTTGGACGAAAGCAGCTAATTTAAGGGCACAGAAATAA Protein sequence : MKEKHNPRRKYCLISGLAIIFSLWIIIGNGAKVQAETITVPTPIKQIFSDDAFAETIKDNLKKKSVTDAVTQNELNSIDQ IIANNSDIKSVQGIQYLPNVTKLFLNGNKLTDIKPLANLKNLGWLFLDENKVKDLSSLKDLKKLKSLSLEHNGISDINGL VHLPQLESLYLGNNKITDITVLSRLTKLDTLSLEDNQISDIVPLAGLTKLQNLYLSKNHISDLRALAGLKNLDVLELFSQ ECLNKPINHQSNLVVPNTVKNTDGSLVTPEIISDDGDYEKPNVKWHLPEFTNEVSFIFYQPVTIGKAKARFHGRVTQPLK EVYTVSYDVDGTVIKTKVEAGTRITAPKPPTKQGYVFKGWYTEKNGGHEWNFNTDYMSGNDFTLYAVFKAETTEKAVNLT RYVKYIRGNAGIYKLPREDNSLKQGTLASHRCKALTVDREARNGGKLWYRLKNIGWTKAENLSLDRYDKMEYDKGVTAYA RVRNASGNSVWTKPYNTAGAKHVNKLSVYQGKNMRILREAKTPITTWYQFSIGGKVIGWVDTRALNTFYKQSMEKPTRLT RYVSANKAGESYYKVPVADNPVKRGTLAKYKNQKLIVDCQATIEGQLWYRIRTSSTFIGWTKAANLRAQK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
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Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
LMKG_01476 | YP_005967351.1 | internalin B | VFG0076 | Protein | 0.0 | 100 |