Name : LMKG_01477 (LMKG_01477) Accession : YP_005967350.1 Strain : Listeria monocytogenes FSL R2-561 Genome accession: NC_017546 Putative virulence/resistance : Virulence Product : internalin-A Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 453213 - 455615 bp Length : 2403 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGAGAAAAAAACGATATGTATGGTTGAAAAGTATACTAGTAGCAATATTAGTATTTGGCAGCGGAGTATGGATTAACAC GAGTAACGGGACAAATGCTCAGGCAGCTACAATTACACAAGATACTCCTATTAATCAGATTTTTACAGATACAGCTCTAG CGGAAAAAATGAAGACGGTCTTAGGAAAAACGAATGTAACAGACACGGTCTCACAAACAGATCTAGACCAAGTTACAACG CTTCAGGCGGATAGATTAGGGATAAAATCTATCGATGGAGTGGAATACTTGAACAATTTAACACAAATAAATTTCAGCAA TAATCAACTTACGGACATAACGCCACTTAAAAATTTAACTAAGTTAGTTGATATTTTGATGAATAATAATCAAATAGCAG ATATAACTCCGCTAGCTAATTTGACGAATCTAACTGGTTTGACTTTGTTCAACAATCAGATAACGGATATAGACCCGCTT AAAAATCTAACAAATTTAAATCGGCTAGAACTATCCAGTAACACGATTAGTGATATTAGTGCGCTTTCAGGTTTAACTAG TCTACAGCAATTATCTTTTGGTAATCAAGTGACAGATTTAAAACCATTAGCTAATTTAACAACACTAGAACGACTAGATA TTTCAAGTAATAAGGTGTCGGATATTAGTGTTCTGGCTAAATTAACCAATTTAGAAAGTCTTATCGCTACTAACAACCAA ATAAGTGATATAACTCCACTTGGGATTTTAACAAATTTGGACGAATTATCCTTAAATGGTAACCAGTTAAAAGATATAGG CACATTGGCGAGTTTAACAAACCTTACAGATTTAGATTTAGCAAATAACCAAATTAGTAATCTAGCACCACTGTCGGGTC TAACAAAACTAACTGAGTTAAAACTTGGAGCTAACCAAATAAGTAACATCAGTCCCCTAGCAGGTTTAACCGCACTCACT AACTTAGAGCTTAATGAAAATCAGCTGGAAGATATTAGCCCAATTTCTAACCTGAAAAATCTCACATATTTAACTTTGTA CTTTAATAATATAAGTGATATAAGCCCAGTTTCTAGTTTAACAAAGCTTCAAAGATTATTTTTCTATAATAACAAGGTAA GTGACGTAAGCTCACTTGCGAACTTAACAAATATTAATTGGCTTTCAGCTGGGCATAACCAAATTAGCGATCTTACACCA TTGGCTAATTTAACAAGAATCACCCAACTAGGGTTGAATGATCAAGCATGGACAAATGCACCAGTAAACTACAAAGCAAA TGTATCCATTCCAAACACGGTGAAAAATGTGACTGGCGCTTTAATTGCACCAGCTACTATTAGCGATGGCGGTAGTTACA CAGAGCCTGATATAACATGGAACTTACCTAGTTATACAAATGAAGTAAGCTATACCTTTAGCCAACCTGTCACTATTGGA AAAGGAACGACAACATTTAGTGGAACCGTGACGCAGCCACTTAAGGCAATTTTTAATGTTAAGTTTCATGTGGACGGCAA AGAAACAACCAAAGAAGTGGAAGCTGGGAATTTATTGACTGAACCAGCTAAGCCCGTAAAAGAAGGTCACACATTTGTTG GTTGGTTTGATGCCCAAACAGGCGGAACTAAATGGAATTTCAGTACGGATAAAATGCCGACAAATGACATCAATTTATAT GCACAATTTAGTATTAACAGCTACACAGCAACCTTTGATAATGACGGTGTAACAACATCTCAAACAGTAGATTATCAAGG CTTGTTACAAGAACCTACGGCACCAACAAAAGAAGGTTATACTTTTAAAGGCTGGTATGACGCAAAAACTGGTGGTGACA AGTGGGATTTCGCAACTAGCAAAATGCCTGCTAAAAACATCACCTTATATGCCCAATATAGCGCCAATAGCTATACAGCA ACGTTTGATGTTGATGGAAAATCAACGACTCAAGCAGTAGACTATCAAGGACTTCTAAAAGAACCAAAGGCACCAACGAA AGCCGGATATACTTTCAAAGGCTGGTATGACGAAAAAACAGATGGGAAAAAATGGGATTTTGCGACGGATAAAATGCCAG CAAATGACATTACGCTGTACGCTCAATTTACGAAAAATCCTGTGGCACCACCAACAACTGGAGGGAACACACCGCCTACA ACAAATAACGGCGGGAATACTACACCACCTTCCGCAAATATACCTGGAAGCGACACATCTAACACATCAACTGGGAATTC AGCCAGCACAACAAGTACAATGAACGCTTATGACCCTTATAATTCAAAAGAAGCTTCACTCCCTACAACTGGCGATAGCG ATAATGCGCTCTACCTTTTGTTAGGGTTATTAGCAGTAGGAACTGCAATGGCTCTTACTAAAAAAGCACGTGCTAGTAAA TAG Protein sequence : MRKKRYVWLKSILVAILVFGSGVWINTSNGTNAQAATITQDTPINQIFTDTALAEKMKTVLGKTNVTDTVSQTDLDQVTT LQADRLGIKSIDGVEYLNNLTQINFSNNQLTDITPLKNLTKLVDILMNNNQIADITPLANLTNLTGLTLFNNQITDIDPL KNLTNLNRLELSSNTISDISALSGLTSLQQLSFGNQVTDLKPLANLTTLERLDISSNKVSDISVLAKLTNLESLIATNNQ ISDITPLGILTNLDELSLNGNQLKDIGTLASLTNLTDLDLANNQISNLAPLSGLTKLTELKLGANQISNISPLAGLTALT NLELNENQLEDISPISNLKNLTYLTLYFNNISDISPVSSLTKLQRLFFYNNKVSDVSSLANLTNINWLSAGHNQISDLTP LANLTRITQLGLNDQAWTNAPVNYKANVSIPNTVKNVTGALIAPATISDGGSYTEPDITWNLPSYTNEVSYTFSQPVTIG KGTTTFSGTVTQPLKAIFNVKFHVDGKETTKEVEAGNLLTEPAKPVKEGHTFVGWFDAQTGGTKWNFSTDKMPTNDINLY AQFSINSYTATFDNDGVTTSQTVDYQGLLQEPTAPTKEGYTFKGWYDAKTGGDKWDFATSKMPAKNITLYAQYSANSYTA TFDVDGKSTTQAVDYQGLLKEPKAPTKAGYTFKGWYDEKTDGKKWDFATDKMPANDITLYAQFTKNPVAPPTTGGNTPPT TNNGGNTTPPSANIPGSDTSNTSTGNSASTTSTMNAYDPYNSKEASLPTTGDSDNALYLLLGLLAVGTAMALTKKARASK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
inlA | CAC20628.1 | internalin A | Virulence | Internalin | Protein | 0.0 | 100 |
inlF | AAB67968.1 | internalin | Virulence | Internalin | Protein | 9e-137 | 45 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
LMKG_01477 | YP_005967350.1 | internalin-A | VFG0075 | Protein | 0.0 | 100 |