Gene Information

Name : LMKG_01477 (LMKG_01477)
Accession : YP_005967350.1
Strain : Listeria monocytogenes FSL R2-561
Genome accession: NC_017546
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : internalin-A
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 453213 - 455615 bp
Length : 2403 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
GTGAGAAAAAAACGATATGTATGGTTGAAAAGTATACTAGTAGCAATATTAGTATTTGGCAGCGGAGTATGGATTAACAC
GAGTAACGGGACAAATGCTCAGGCAGCTACAATTACACAAGATACTCCTATTAATCAGATTTTTACAGATACAGCTCTAG
CGGAAAAAATGAAGACGGTCTTAGGAAAAACGAATGTAACAGACACGGTCTCACAAACAGATCTAGACCAAGTTACAACG
CTTCAGGCGGATAGATTAGGGATAAAATCTATCGATGGAGTGGAATACTTGAACAATTTAACACAAATAAATTTCAGCAA
TAATCAACTTACGGACATAACGCCACTTAAAAATTTAACTAAGTTAGTTGATATTTTGATGAATAATAATCAAATAGCAG
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GTGACGTAAGCTCACTTGCGAACTTAACAAATATTAATTGGCTTTCAGCTGGGCATAACCAAATTAGCGATCTTACACCA
TTGGCTAATTTAACAAGAATCACCCAACTAGGGTTGAATGATCAAGCATGGACAAATGCACCAGTAAACTACAAAGCAAA
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CAGAGCCTGATATAACATGGAACTTACCTAGTTATACAAATGAAGTAAGCTATACCTTTAGCCAACCTGTCACTATTGGA
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AGAAACAACCAAAGAAGTGGAAGCTGGGAATTTATTGACTGAACCAGCTAAGCCCGTAAAAGAAGGTCACACATTTGTTG
GTTGGTTTGATGCCCAAACAGGCGGAACTAAATGGAATTTCAGTACGGATAAAATGCCGACAAATGACATCAATTTATAT
GCACAATTTAGTATTAACAGCTACACAGCAACCTTTGATAATGACGGTGTAACAACATCTCAAACAGTAGATTATCAAGG
CTTGTTACAAGAACCTACGGCACCAACAAAAGAAGGTTATACTTTTAAAGGCTGGTATGACGCAAAAACTGGTGGTGACA
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AGCCGGATATACTTTCAAAGGCTGGTATGACGAAAAAACAGATGGGAAAAAATGGGATTTTGCGACGGATAAAATGCCAG
CAAATGACATTACGCTGTACGCTCAATTTACGAAAAATCCTGTGGCACCACCAACAACTGGAGGGAACACACCGCCTACA
ACAAATAACGGCGGGAATACTACACCACCTTCCGCAAATATACCTGGAAGCGACACATCTAACACATCAACTGGGAATTC
AGCCAGCACAACAAGTACAATGAACGCTTATGACCCTTATAATTCAAAAGAAGCTTCACTCCCTACAACTGGCGATAGCG
ATAATGCGCTCTACCTTTTGTTAGGGTTATTAGCAGTAGGAACTGCAATGGCTCTTACTAAAAAAGCACGTGCTAGTAAA
TAG

Protein sequence :
MRKKRYVWLKSILVAILVFGSGVWINTSNGTNAQAATITQDTPINQIFTDTALAEKMKTVLGKTNVTDTVSQTDLDQVTT
LQADRLGIKSIDGVEYLNNLTQINFSNNQLTDITPLKNLTKLVDILMNNNQIADITPLANLTNLTGLTLFNNQITDIDPL
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TNNGGNTTPPSANIPGSDTSNTSTGNSASTTSTMNAYDPYNSKEASLPTTGDSDNALYLLLGLLAVGTAMALTKKARASK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
inlA CAC20628.1 internalin A Virulence Internalin Protein 0.0 100
inlF AAB67968.1 internalin Virulence Internalin Protein 9e-137 45

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
LMKG_01477 YP_005967350.1 internalin-A VFG0075 Protein 0.0 100