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Name : LMRG_00127 (LMRG_00127) Accession : YP_005961576.1 Strain : Listeria monocytogenes 10403S Genome accession: NC_017544 Putative virulence/resistance : Virulence Product : internalin B Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 456354 - 458246 bp Length : 1893 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGAAAGAAAAGCACAACCCAAGAAGGAAGTATTGTTTAATCTCAGGTTTAGCTATTATTTTTAGTTTATGGATAATTAT TGGAAACGGGGCGAAAGTACAAGCGGAGACTATCACCGTGTCAACGCCAATCAAGCAAATTTTTCCAGATGATGCTTTTG CAGAAACAATCAAAGACAATTTAAAGAAAAAAAGTGTGACAGATGCAGTGACACAAAATGAATTAAATAGTATAGATCAA ATCATTGCGAATAATAGTGATATTAAATCCGTTCAAGGAATTCAGTATTTACCCAATGTGACAAAGTTATTTTTAAACGG GAATAAACTAACAGATATAAAACCCTTAACAAACTTGAAAAATTTAGGATGGCTTTTTTTAGACGAAAATAAAATTAAAG ACCTAAGTTCGCTCAAGGATCTAAAAAAATTAAAATCACTTTCTTTGGAGCATAATGGTATAAGTGATATAAACGGACTT GTTCATTTACCACAGCTGGAAAGTTTGTATTTGGGAAATAATAAAATAACGGATATAACGGTTCTTTCACGTTTAACTAA ACTGGATACTTTGTCTCTCGAAGATAACCAAATTAGTGATATTGTGCCACTTGCAGGTTTAACTAAATTGCAGAACCTAT ATTTAAGTAAAAATCACATAAGCGATTTAAGAGCATTAGCAGGACTTAAAAATCTAGATGTTTTAGAATTATTTAGCCAA GAATGTCTTAATAAGCCTATTAATCATCAATCTAATTTGGTCGTTCCGAATACAGTGAAAAACACTGATGGGTCGTTAGT GACTCCAGAAATAATAAGTGATGATGGCGATTATGAAAAACCTAATGTTAAATGGCATTTACCAGAATTTACAAATGAAG TGAGTTTTATTTTCTATCAGCCAGTCACTATTGGAAAAGCAAAAGCAAGATTTCATGGGAGAGTAACCCAACCACTGAAA GAGGTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATTAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTGCACC TAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTGGAATTTTAATA CGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAAAAAACAGTCAACTTAACC CGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAGATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCT AGTCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAATGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATA TTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACCGATACGATAAAATGGAATATGACAAAGGGGTTACCGCTTATGCA AGAGTGAGAAATGCGTCTGGAAATTCGGTTTGGACAAAACCCTACAACACAGCCGGCGCTAAACACGTGAATAAGCTATC GGTCTACCAAGGTAAAAATATGCGTATCTTGCGCGAAGCCAAAACGCCAATTACTACATGGTATCAATTTAGCATTGGTG GTAAAGTAATTGGTTGGGTCGATACCCGAGCACTTAACACATTCTACAAACAAAGTATGGAAAAACCAACCCGTTTAACT CGTTATGTCAGCGCCAATAAAGCTGGCGAATCGTACTATAAAGTCCCGGTAGCAGATAATCCAGTCAAAAGGGGTACTTT AGCCAAGTATAAAAATCAAAAGTTAATTGTTGATTGTCAAGCAACCATCGAAGGTCAACTTTGGTACCGAATAAGGACTA GTTCCACTTTCATTGGTTGGACGAAAGCAGCTAATTTAAGGGCACAGAAATAA Protein sequence : MKEKHNPRRKYCLISGLAIIFSLWIIIGNGAKVQAETITVSTPIKQIFPDDAFAETIKDNLKKKSVTDAVTQNELNSIDQ IIANNSDIKSVQGIQYLPNVTKLFLNGNKLTDIKPLTNLKNLGWLFLDENKIKDLSSLKDLKKLKSLSLEHNGISDINGL VHLPQLESLYLGNNKITDITVLSRLTKLDTLSLEDNQISDIVPLAGLTKLQNLYLSKNHISDLRALAGLKNLDVLELFSQ ECLNKPINHQSNLVVPNTVKNTDGSLVTPEIISDDGDYEKPNVKWHLPEFTNEVSFIFYQPVTIGKAKARFHGRVTQPLK EVYTVSYDVDGTVIKTKVEAGTRITAPKPPTKQGYVFKGWYTEKNGGHEWNFNTDYMSGNDFTLYAVFKAETTEKTVNLT RYVKYIRGNAGIYKLPREDNSLKQGTLVSHRCKALTVDREARNGGKLWYRLKNIGWTKAENLSLDRYDKMEYDKGVTAYA RVRNASGNSVWTKPYNTAGAKHVNKLSVYQGKNMRILREAKTPITTWYQFSIGGKVIGWVDTRALNTFYKQSMEKPTRLT RYVSANKAGESYYKVPVADNPVKRGTLAKYKNQKLIVDCQATIEGQLWYRIRTSSTFIGWTKAANLRAQK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| inlB | CAC20629.1 | internalin B | Virulence | Internalin | Protein | 0.0 | 99 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| LMRG_00127 | YP_005961576.1 | internalin B | VFG0076 | Protein | 0.0 | 99 |
