Name : LMRG_00126 (LMRG_00126) Accession : YP_005961575.1 Strain : Listeria monocytogenes 10403S Genome accession: NC_017544 Putative virulence/resistance : Virulence Product : internalin A Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 453867 - 456269 bp Length : 2403 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGAGAAAAAAACGATATGTATGGTTGAAAAGTATACTAGTAGCAATATTAGTATTTGGCAGTGGAGTATGGATTAACAC GAGCAACGGGACAAATGCTCAGGCAGCTACAATTACACAAGATACTCCTATTAATCAGATTTTTACAGACGCAGCTCTAG CGGAAAAAATGAAGACGGTCTTAGGAAAAACGAATGTAACAGACACGGTCTCGCAAACAGATCTAGACCAAGTTACAACG CTTCAGGCGGATAGATTAGGGATAAAATCTATCGATGGATTGGAATACTTGAACAATTTAACACAAATAAATTTCAGCAA TAATCAACTTACGGATATAACGCCACTTAAAGATTTAACTAAGTTAGTTGATATTTTGATGAATAATAATCAAATAGCAG ATATAACTCCGCTAGCTAATTTGACGAATCTAACTGGTTTGACTTTGTTCAACAATCAGATAACAGATATAGACCCGCTT AAAAATCTAACAAATTTAAATCGGCTAGAACTATCTAGTAACACGATTAGTGATATTAGTGCGCTTTCAGGTTTAACTAA TCTACAGCAATTATCTTTTGGTAATCAAGTGACAGATTTAAAACCATTAGCTAATTTAACAACACTAGAACGACTAGATA TTTCAAGTAATAAGGTGTCAGATATTAGTGTTCTGGCTAAATTAACCAATTTAGAAAGTCTTATCGCTACTAACAACCAA ATAAGTGATATAACTCCACTTGGGATTTTAACAAATTTGGACGAATTATCCTTAAATGGTAACCAGTTAAAAGATATAGG CACATTGGCGAGTTTAACAAACCTTACAGATTTAGATTTAGCAAATAACCAAATTAGTAATCTAGCACCACTGTCGGGTC TAACAAAACTAACTGAGTTAAAACTTGGAGCTAACCAAATAAGTAACATCAGTCCCCTAGCAGGTTTAACCGCACTCACT AACTTAGAGCTTAATGAAAATCAGCTGGAAGATATTAGCCCAATTTCTAACCTGAAAAATCTCACATATTTAACGTTGTA CTTTAATAATATAAGTGATATAAGCCCAGTTTCTAGTTTAACAAAGCTTCAAAGATTATTTTTCTATAATAACAAGGTAA GTGACGTAAGCTCACTTGCGAACTTAACCAATATTAATTGGCTTTCAGCTGGGCATAACCAAATTAGCGATCTTACACCA TTGGCTAATTTAACAAGAATCACCCAACTAGGGTTGAATGATCAAGCATGGACAAATGCACCAGTAAACTACAAAGCAAA TGTATCCATTCCAAACACGGTGAAAAATGTGACTGGCGCTTTGATTGCACCTGCTACTATTAGCGATGGCGGTAGTTACG CAGAACCGGATATAACATGGAACTTACCTAGTTATACAAATGAAGTAAGCTATACCTTTAGCCAACCTGTCACTATTGGA AAAGGAACGACAACATTTAGTGGAACCGTGACGCAGCCACTTAAGGCAATTTTTAATGCTAAGTTTCATGTGGACGGCAA AGAAACAACCAAAGAAGTGGAAGCTGGGAATTTATTGACTGAACCAGCTAAGCCCGTAAAAGAAGGTCACACATTTGTTG GTTGGTTTGATGCCCAAACAGGCGGAACTAAATGGAATTTCAGTACGGATAAAATGCCGACAAATGACATCAATTTATAT GCACAATTTAGTATTAACAGCTACACAGCAACCTTTGAGAATGACGGTGTAACAACATCTCAAACAGTAGATTATCAAGG CTTGTTACAAGAACCTACACCACCAACAAAAGAAGGTTATACTTTCAAAGGCTGGTATGACGCAAAAACTGGTGGTGACA AGTGGGATTTCGCAACTAGCAAAATGCCTGCTAAAAACATCACCTTATATGCCCAATATAGCGCCAATAGCTATACAGCA ACGTTTGATGTTGATGGAAAATCAACGACTCAAGCAGTAGACTATCAAGGACTTCTAAAAGAACCAAAGGCACCAACGAA AGCCGGATATACTTTCAAAGGCTGGTATGACGAAAAAACAGATGGGAAAAAATGGGATTTTGCGACGGATAAAATGCCAG CAAATGACATTACGCTGTACGCTCAATTTACGAAAAATCCTGTGGCACCACCAACAACTGGAGGGAACACACCGCCTACA ACAAATAACGGCGGGAATACTACACCACCTTCCGCAAATATACCTGGAAGCGACACATCTAACACATCAACTGGGAATTC AGCCAGCACAACAAGTACAATGAACGCTTATGACCCTTATAATTCAAAAGAAGCTTCACTCCCTACAACTGGCGATAGCG ATAATGCGCTCTACCTTTTGTTAGGGTTATTAGCAGTAGGAACTGCAATGGCTCTTACTAAAAAAGCACGTGCTAGTAAA TAG Protein sequence : MRKKRYVWLKSILVAILVFGSGVWINTSNGTNAQAATITQDTPINQIFTDAALAEKMKTVLGKTNVTDTVSQTDLDQVTT LQADRLGIKSIDGLEYLNNLTQINFSNNQLTDITPLKDLTKLVDILMNNNQIADITPLANLTNLTGLTLFNNQITDIDPL KNLTNLNRLELSSNTISDISALSGLTNLQQLSFGNQVTDLKPLANLTTLERLDISSNKVSDISVLAKLTNLESLIATNNQ ISDITPLGILTNLDELSLNGNQLKDIGTLASLTNLTDLDLANNQISNLAPLSGLTKLTELKLGANQISNISPLAGLTALT NLELNENQLEDISPISNLKNLTYLTLYFNNISDISPVSSLTKLQRLFFYNNKVSDVSSLANLTNINWLSAGHNQISDLTP LANLTRITQLGLNDQAWTNAPVNYKANVSIPNTVKNVTGALIAPATISDGGSYAEPDITWNLPSYTNEVSYTFSQPVTIG KGTTTFSGTVTQPLKAIFNAKFHVDGKETTKEVEAGNLLTEPAKPVKEGHTFVGWFDAQTGGTKWNFSTDKMPTNDINLY AQFSINSYTATFENDGVTTSQTVDYQGLLQEPTPPTKEGYTFKGWYDAKTGGDKWDFATSKMPAKNITLYAQYSANSYTA TFDVDGKSTTQAVDYQGLLKEPKAPTKAGYTFKGWYDEKTDGKKWDFATDKMPANDITLYAQFTKNPVAPPTTGGNTPPT TNNGGNTTPPSANIPGSDTSNTSTGNSASTTSTMNAYDPYNSKEASLPTTGDSDNALYLLLGLLAVGTAMALTKKARASK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
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inlF | AAB67968.1 | internalin | Virulence | Internalin | Protein | 9e-137 | 45 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
LMRG_00126 | YP_005961575.1 | internalin A | VFG0075 | Protein | 0.0 | 99 |