|
Name : inlA (lmo4a_0453) Accession : YP_005925444.1 Strain : Listeria monocytogenes L99 Genome accession: NC_017529 Putative virulence/resistance : Virulence Product : internalin A Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 481401 - 483803 bp Length : 2403 bp Strand : + Note : Leucine-rich repeat (LRR) protein DNA sequence : GTGAGAAGAAAACGATATGTATGGTTGAAAAGTATACTAGTAGCAATATTAGTACTTGGCAGTGGAGTATGGATTAACAC GAGTAACGGGACAAATGCTCAGGCAGCTACAATTACACAAGATACTCCTATTAATCAGATTTTTACAGATACAGCTCTAG CGGAAAAAATGAAGACGGTCTTAGGAAAAACGAATGTAACAGACACGGTCTCGCAAACAGATCTAGACCAAGTTACGACG CTTCAGGCGGATAGATTAGGGATAAAATCTATCGATGGATTGGAATACTTGAACAATTTAACACAAATAAATTTCAGCAA TAATCAACTGACGGATATAACGCCACTTAAAGATTTAACTAAGTTAGTTGATATTTTGATGAATAATAATCAAATAGCAG ATATAACTCCGCTAGCTAATTTGTCGAATCTAACTGGTTTGACTTTGTTCAACAATCAGATAACGGACATAGACCCGCTT AAAAATCTAACAAATTTAAATCGGCTAGAACTATCTAGTAACACGATTAGTGATATTAGTGCGCTTTCAGGTTTAACTAA TCTACAGCAATTATCTTTTGGTAATCAAGTGACAGATTTAAAACCATTAGCTAATTTAACAACACTAGAACGACTAGATA TTTCAAGTAATAAGGTGTCGGATATTAGTGTTCTGGCTAAATTAACCAATTTAGAAAGTCTTATCGCTACTAACAACCAA ATAAGTGATATAACTCCACTTGGGATTTTAACAAATTTGGACGAATTATCCTTAAATGGTAACCAGTTAAAAGATATAGG CACATTGGCGAGTTTAACAAACCTTACAGATTTAGATTTAGCAAATAACCAAATTAGTAATCTAGCACCACTGTCGGGTC TAACAAAACTAACTGAGTTAAAACTGGGAGCTAACCAAATAAGTAACATCAGTCCCCTAGCTGGTCTAACCGCACTCACT AACTTAGAGCTAAATGAAAATCAGTTAGAAGATATTAGCCCAATTTCTAACCTGAAAAATCTCACATATTTAACGTTATA CTTTAATAATATAAGTGATATAAGCCCAGTTTCTAGTTTAACAAAGCTTCAAAGATTATTTTTCTATAATAACAAGGTAA GTGACGTAAGCTCGCTTGCGAGTTTAACCAATATTAATTGGCTTTCGGCTGGGCATAACCAAATTAGCGACCTTACACCA TTGGCTAATTTAACAAGAATTACCCAATTAGGGTTGAATGATCAAGCATGGACAAATGCACCAGTAAACTACAAAGCAAA TGTATCCATTCCAAACACGGTGAAAAATGTGACTGGCGCTTTGATTGCACCAGCTACTATTAGCGATGGCGGTAGTTACG CAGAACCTGATATAACATGGAACTTACCTAGTTATACCAATGAAGTAAGTTATACCTTTAACCAATCTGTCACTATTGGA AAAGGAACGACAACATTTAGTGGAACTGTGACGCAGCCACTTAAGGCAATTTTTAATGCTAAGTTTCATGTGGACGGCAA AGAAACAACCAAAGAAGTGGAAGCTGGGAATTTATTGACTGAACCAGCTAAGCCTGTAAAAGAAGGTTATACATTTGTTG GGTGGTTTGATGCCCAAACCGGCGGAACTAAATGGAATTTCAGTACGGATAAAATGCCGACAAATGACATCGATTTATAT GCGCAATTTAGTATTAACAGCTACACAGCAACGTTTGATAATGACGGTGTAACAACATCTCAAACAGTAGATTATCAAGG CTTGCTACAAGAACCTACGGCACCAACAAAAGAAGGTTATACTTTCAAAGGCTGGTATGACGCAAAAACTGGCGGTGACA AGTGGGATTTTGCAACTAGTAAAATGCCTGCTAAAAACATCACCTTATATGCTCAATATAGCGCCAATAGCTATACAGCA ACCTTTGATGTTGATGGAAAAACAACGACTCAAGCAGTAGACTATCAAGGACTTCTAAAAGAACCAAAAACGCCAACAAA AGCCGGATATACTTTCAAAGGTTGGTATGACGAAAAAACAGATGGTAAAAAATGGGATTTTGCGACAGATAAAATGCCAG CAAATGATATTACGCTGTACGCTCAATTCACGAAAAATCCTGTGGCACCACCAACAACTGGAGGGAACACTCCGCCGACT ACAAATAACGGAGGGAACACTACATCACCTTCCGCAAATATACCTGGAAGCAACACATCTAACACATCAACTGGGAATTC AGCTAGCACAACAAGTACAATGAACGCTTATGACCCTTATAATTCAAAAGAAGCTTCACTCCCTACAACTGGCGATAGCG ATAATGCGCTCTACCTGTTGATAGGGTTATTAGCAGTAGGAACTGCAGTGGCTCTTACTAAAAAAGCACGTGCTAGTAAA TAG Protein sequence : MRRKRYVWLKSILVAILVLGSGVWINTSNGTNAQAATITQDTPINQIFTDTALAEKMKTVLGKTNVTDTVSQTDLDQVTT LQADRLGIKSIDGLEYLNNLTQINFSNNQLTDITPLKDLTKLVDILMNNNQIADITPLANLSNLTGLTLFNNQITDIDPL KNLTNLNRLELSSNTISDISALSGLTNLQQLSFGNQVTDLKPLANLTTLERLDISSNKVSDISVLAKLTNLESLIATNNQ ISDITPLGILTNLDELSLNGNQLKDIGTLASLTNLTDLDLANNQISNLAPLSGLTKLTELKLGANQISNISPLAGLTALT NLELNENQLEDISPISNLKNLTYLTLYFNNISDISPVSSLTKLQRLFFYNNKVSDVSSLASLTNINWLSAGHNQISDLTP LANLTRITQLGLNDQAWTNAPVNYKANVSIPNTVKNVTGALIAPATISDGGSYAEPDITWNLPSYTNEVSYTFNQSVTIG KGTTTFSGTVTQPLKAIFNAKFHVDGKETTKEVEAGNLLTEPAKPVKEGYTFVGWFDAQTGGTKWNFSTDKMPTNDIDLY AQFSINSYTATFDNDGVTTSQTVDYQGLLQEPTAPTKEGYTFKGWYDAKTGGDKWDFATSKMPAKNITLYAQYSANSYTA TFDVDGKTTTQAVDYQGLLKEPKTPTKAGYTFKGWYDEKTDGKKWDFATDKMPANDITLYAQFTKNPVAPPTTGGNTPPT TNNGGNTTSPSANIPGSNTSNTSTGNSASTTSTMNAYDPYNSKEASLPTTGDSDNALYLLIGLLAVGTAVALTKKARASK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| inlA | CAC20628.1 | internalin A | Virulence | Internalin | Protein | 0.0 | 98 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| inlA | YP_005925444.1 | internalin A | VFG0075 | Protein | 0.0 | 98 |
