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Name : qoxB (lmo4a_0014) Accession : YP_005925005.1 Strain : Listeria monocytogenes L99 Genome accession: NC_017529 Putative virulence/resistance : Unknown Product : quinol oxidase AA3 subunit I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.10.3.- Position : 17346 - 19325 bp Length : 1980 bp Strand : + Note : 'Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1' DNA sequence : ATGAAATGGAATGAGTTTATCGTAACTGGCGACCCAATGATTTTAGGTGCGCAGATTTCTATCGTACTTGTAAGTATTGG TGTTGTTGCGTTACTAACTTATACAAAAAAATGGAAGTGGCTCATGAAAGAGTGGATTTCTTCCGTTGATCATAAAAAAA TAGGTATTATGTACTTGCTTGCTGCTGTCTTAATGTTTTTCCGTGGCGGTGTGGATGCGCTAATGATGCGTACCCAGCTC GCTTTACCGGATATGAAATTTTTAGACGCACAGCATTACAATGAAGTTTTTTCTACACATGGAACGATTATGATTTTATT TATGGCGATGCCGTTTATCATCGGGTTGATGAACATTGCCGTACCACTTCAAATTGGTGCGCGTGATGTAGCATTTCCAT TTTTAAACAACTTAAGTTTTTGGACGTTCTTTATGGGAGCGATGCTATTTAACTTATCATTCGTAATTGGTGGTTCGCCA GATGCTGGTTGGACAAACTATGCGCCACTTGCGACAGATTTTAGCGCGGGATATGGAATTAACTTCTATCTTCTAGGTGT TCAAATCGCTGGTATTGGTACGCTGATGACGGGGATTAACTTTTTCGTTACGATTTTAAGAATGCGTACAAAAGGTATGA CGTTAATGAAAATGCCAATGTTTACTTGGTCTTCATTAATTACAAGTTTGATCATTATTTTCGCTTTCCCAGTTTTAACA GTGGCACTTGCTTTGATGTCATTTGACCGACTGTTTGGGACAGCATTCTTCACACTCACGAATGGCGGGCTCCCAATGAT GTGGGCCAACTTGTTCTGGGTTTGGGGACATCCGGAAGTATATATTGTTATTTTGCCAGCTTTCGGTATTTTCTCAGAGA TTATTTCTACTTTCTCCAGGAAAAAATTATTCGGTTATCCGGCGATGGTTGCCGCGATGGCAGTTATTTCTTTACTAAGT TTCCTAGTTTGGGTCCATCACTTCTTTACAATGGGATCAGGGGCGCTTGTTAACTCCTTCTTCTCCATTACAACGATGAT GATTGCGATACCGACCGGGATTAAGATATTCAACTGGCTCTTTACGATGTACAAAGGGCGAATAACCTTTACAACGCCAA TGCTTTGGTCGCTTGCCTTTATCCCTAACTTTGTTGTTGGTGGGGTAACTGGGGTTATGCTTGCGATGGCTGCAGCCGAT TATCAATATCACAATACGTACTTCTTAGTATCCCATTTCCACTACGTATTAATTGCTGGAACCGTGTTCTCCTGCTTTGC CGGGCTTACATACTGGTATCCAAAAATGGTCGGTTACAGACTAAATGAAAAAATTGGTAAATGGTTCTTCTGGATTTTCG TTGTTGGATTTAACGTTTGTTTCTTCCCGCAATATTTCCTAGGACTAGATGGTATGCCGCGTCGTATTTACACTTATGTA CAAGGTGATGGCTGGACAACGCTTAACTTTATCTCCACAGTTGGCGGATTCTTGATGGGTGTAGCATTCTTAGTTCTTTG CTACAACATCTACTACAGCTATAAAAACTCTAAACGTGAAGTTACTGGTGACCCGTGGGATGCTCGTACGCTTGAATGGG CTACAAGTTCTGCAGTTCCTCCAAAATATAACTTTGCTGTTTTACCAGAATGGAATGACTTGGATGATTTCTGGAATAGA AAACAAAAAGGCGATCCATATGTAAATGATAAAAATTATAAACCAATCCATATGCCAAGCAATACCATGGTTGGGTTTGT AATGTCTGTCTTCTTCTTCATTGCAGGTTTCGGACTAGTCTTCTACTGGTACTGGATGGGAATTATTGGTCTAGTTGGTA TTTTAGGATGTATGATTTATCGTTCGTTCCAAAATAACGATGGTTACCACGTTGAAGTGGACGAAATTAAAGCAACAGAA GAACATAATGCGCGCGAACTTGCGACTGGTGTGAAGGAGGGTAACCCATGGAATCTGTAG Protein sequence : MKWNEFIVTGDPMILGAQISIVLVSIGVVALLTYTKKWKWLMKEWISSVDHKKIGIMYLLAAVLMFFRGGVDALMMRTQL ALPDMKFLDAQHYNEVFSTHGTIMILFMAMPFIIGLMNIAVPLQIGARDVAFPFLNNLSFWTFFMGAMLFNLSFVIGGSP DAGWTNYAPLATDFSAGYGINFYLLGVQIAGIGTLMTGINFFVTILRMRTKGMTLMKMPMFTWSSLITSLIIIFAFPVLT VALALMSFDRLFGTAFFTLTNGGLPMMWANLFWVWGHPEVYIVILPAFGIFSEIISTFSRKKLFGYPAMVAAMAVISLLS FLVWVHHFFTMGSGALVNSFFSITTMMIAIPTGIKIFNWLFTMYKGRITFTTPMLWSLAFIPNFVVGGVTGVMLAMAAAD YQYHNTYFLVSHFHYVLIAGTVFSCFAGLTYWYPKMVGYRLNEKIGKWFFWIFVVGFNVCFFPQYFLGLDGMPRRIYTYV QGDGWTTLNFISTVGGFLMGVAFLVLCYNIYYSYKNSKREVTGDPWDARTLEWATSSAVPPKYNFAVLPEWNDLDDFWNR KQKGDPYVNDKNYKPIHMPSNTMVGFVMSVFFFIAGFGLVFYWYWMGIIGLVGILGCMIYRSFQNNDGYHVEVDEIKATE EHNARELATGVKEGNPWNL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 4e-90 | 45 |
