Gene Information

Name : lysS (MLEA_008390)
Accession : YP_005907731.1
Strain : Mycoplasma leachii 99/014/6
Genome accession: NC_017521
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : lysyl-tRNA synthetase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 6.1.1.6
Position : 923762 - 925264 bp
Length : 1503 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGTTAGATGATAGAAAATTTAGTGAACAAGAATTAGTTAGAAGAAATAAATATAAAAATTTAGTTGATCAAAATAAAGA
TCCTTATAAAATAACAAACTGAAAAAGAAACACTACATTATTAAAGTTAAATGAAAAATATAAAGATTATAGTAAAGAAG
AGTTATTAAATTTAACTCAAGAACTAGTTATTGTAGCTGGAAGAATTAAGTTATATAGAGAAGCTGGAAAAAAAGCTGCA
TTTGTTAATATTGATGATCAAGATTCAAGTATTCAATTATATGTAAGATTAGATGAAATAGGTCAAGAAGCTTTTGAAGA
TTTTAGGGATTTAGATCTTGGAGATATTATTGGAGTAAAAGGGATCATGATGAGAACAGATCATGGTGAATTATCAATTA
GATGTAAAGAGGTTGTCTTACTATCTAAAGCTTTAAGACCTTTACCTGATAAACATGCTGGAATTCAAGATATAGAAGAA
AAATATCGTAGAAGATATGTTGACCTAATTATGAATCATGACGTTAGAAAAACATTTCAAGCTAGAACTAAAATTATAAG
AACAATGCAAAATTTTTTAGATAATAGAGGTTATATGGAAGTTGAGACTCCTATTTTGCATTCATTAAAAGGTGGAGCTT
CTGCTAAACCGTTTGTTACTCATTATAATGTTTTAAATACTGATGTTTATTTAAGAATAGCAACAGAATTACATTTAAAA
CGTTTAATTGTTGGTGGTTTTGAAGGAGTTTATGAAATAGGACGTATTTTTAGAAATGAAGGTATGAGCACAAGACACAA
CCCTGAATTTACAAGTATTGAGTTATATGTTGCTTATGAAGATATGTTCTTTTTAATGGACTTAACTGAAGAAATTTTTA
GAGTATGTAATTCAGCGGTAAATTCAAGTAGTGTAATAGAATATAACAACGTTAAAATTGATTTATCAAAACCTTTTAAA
AGATTACATATGGTTGATGGAATTAAACAAGTTACGGGTGTTGATTTTTGACAAGAAATGACTGTGGAACAAGCCTTAGA
ACTAGCTAAAAAACATAATGTTTATGTTGAAAAACACCAAGAATCTGTTGGACATATAATTAACTTATTTTATGAAGAAT
TTGTTGAATCAACTATTATTGAACCCACATTCGTTTATGGGCATCCAAAAGAAATTTCTCCATTAGCAAAATCAAATCCA
AATGATCCAAGATTTACTGATAGATTTGAATTATTTATTATTGGTAGAGAATATGCTAATGCTTTTAGTGAATTAAATGA
TCCAATTGATCAGTATGAGAGATTTAAGGCTCAACTAGAAGAAGAATCTAAAGGAAATGACGAAGCAAATGATATGGATA
TTGATTTTGTTGAAGCTTTAGAACATGCGATGCCACCAACTGCGGGTATTGGTATTGGAATTGATAGATTAGTTATGCTT
TTAACTAATTCTGACTCTATTAAAGACGTTTTGTTATTTCCACAAATGAAACCAAAAGAATAA

Protein sequence :
MLDDRKFSEQELVRRNKYKNLVDQNKDPYKITNWKRNTTLLKLNEKYKDYSKEELLNLTQELVIVAGRIKLYREAGKKAA
FVNIDDQDSSIQLYVRLDEIGQEAFEDFRDLDLGDIIGVKGIMMRTDHGELSIRCKEVVLLSKALRPLPDKHAGIQDIEE
KYRRRYVDLIMNHDVRKTFQARTKIIRTMQNFLDNRGYMEVETPILHSLKGGASAKPFVTHYNVLNTDVYLRIATELHLK
RLIVGGFEGVYEIGRIFRNEGMSTRHNPEFTSIELYVAYEDMFFLMDLTEEIFRVCNSAVNSSSVIEYNNVKIDLSKPFK
RLHMVDGIKQVTGVDFWQEMTVEQALELAKKHNVYVEKHQESVGHIINLFYEEFVESTIIEPTFVYGHPKEISPLAKSNP
NDPRFTDRFELFIIGREYANAFSELNDPIDQYERFKAQLEEESKGNDEANDMDIDFVEALEHAMPPTAGIGIGIDRLVML
LTNSDSIKDVLLFPQMKPKE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed CAD66193.1 putative lysil-tRNA synthetase LysU Not tested PAI III 536 Protein 5e-101 46

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
lysS YP_005907731.1 lysyl-tRNA synthetase VFG1668 Protein 3e-101 46