Name : serS (MHP168_272) Accession : YP_005888373.1 Strain : Mycoplasma hyopneumoniae 168 Genome accession: NC_017509 Putative virulence/resistance : Unknown Product : seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 320903 - 322144 bp Length : 1242 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATATTCGTTTAATTTTGAATAATAAATCCTTTGTTGAAAAAAAACTCGCGACCCGTGGTTTTGATATTTCAATAAT TAACGAATTATATATAAAAGGTCAAAAAAGAAATATTTTACGTCAGAAAATTGATGCCTTATTAGCAAAAAAAAACTTAA TTAGTAAAGAAATTGGAGCTTTTTCAAGACAAGAAAAGGATTCAAGTTTTCTTAAAAGCCAAGTTAGTAAAATAAAAACT GAGATCGAAACCCTTGAAGCTGAATGATATCAGCTTGATACTTGATTAAATCAAAAAATTTTAGAAATTCCAAATTTACC CGATGATTCAGTGCCTTTTGGAACTTCAGAACTTGATAATCAAGTAATTTCACATTGAGGAATTCCAAAAAAATTTGATC AAAAATGTAAACCACATTATGAATTCGGGATTTCTAATAAAATTTTAGACTTTAAGCGAGCAGTAAAAATTTCCGGTAAT CGCTTTGTAATTTATAAAAATCTTGGAGCTAAATTAGTAAGGTCCTTGATTAATTTTATGATTGATACTCATATTGCAAA CGATTATCAGGAAATTATCCCAAATACTTTAATTCTCTCGGAATCACTTTATGGTACTGGCCAACTACCGAAATTTCATA ATGATTTATACCCATTAAAGGATCCAAATCGCTGGCTAATTCCGACTGCTGAGGTTCCGTTGACTAATTATTTTCGTGAA GAAATAATTGATTTAGCAAAACCAATTTCACTTGTTGGTTATAGTAAATGTTATCGTTCCGAGGCTGGAAGCGGAGGCAG AGACACAAAAGGGCTAATTCGCCTTCATGAATTTCATAAGGTTGAACTAGTAAAAATCACAAAAGAAGCAGATGGTTTAA CTGAATTTGAAAATGTAGTAAAGGATGCTTCGCGAATTTTAAAATTACTGGAAATCCCATTTCGTGTTGTAGTTTTATCA ACTTATGATTTAGGATTTTCATCAAAAAAAACAGTTGATCTTGAAGCCTGACTGCCATCAGAAAATACCTATCGAGAAGT ATCATCAATTAGTTATTGCGGCGATTTTCAAGCAAGAAGAGCAAAAATTCGTTATCGTGAGGGTAAAAACAACCATTATG CACACACAATTAATGGTTCTGGCTTGGCAATTGATCGTCTAGTCGCAATTTTATTAGAGCAATATCAAAATTTAGATGGT TCCTGAACGGTGCCAAAAGTTTTAGAACCTTATTTTCGCTAA Protein sequence : MNIRLILNNKSFVEKKLATRGFDISIINELYIKGQKRNILRQKIDALLAKKNLISKEIGAFSRQEKDSSFLKSQVSKIKT EIETLEAEWYQLDTWLNQKILEIPNLPDDSVPFGTSELDNQVISHWGIPKKFDQKCKPHYEFGISNKILDFKRAVKISGN RFVIYKNLGAKLVRSLINFMIDTHIANDYQEIIPNTLILSESLYGTGQLPKFHNDLYPLKDPNRWLIPTAEVPLTNYFRE EIIDLAKPISLVGYSKCYRSEAGSGGRDTKGLIRLHEFHKVELVKITKEADGLTEFENVVKDASRILKLLEIPFRVVVLS TYDLGFSSKKTVDLEAWLPSENTYREVSSISYCGDFQARRAKIRYREGKNNHYAHTINGSGLAIDRLVAILLEQYQNLDG SWTVPKVLEPYFR |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 6e-83 | 48 |