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Name : llh_1660 (llh_1660) Accession : YP_005874931.1 Strain : Lactococcus lactis A76 Genome accession: NC_017492 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Transcription accessory protein (S1 RNA-binding domain) Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 317730 - 319871 bp Length : 2142 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGGAAAATGTTAAAAAAATTGCTGAATTATTGAATATCAAAAATTCACAAGTTGAAAAAGTATTAGAATTGACGGCTGA GGGGAACACGGTTCCTTTTATTGCTCGTTATCGTAAGGAAGCAACAGGTTCACTTGACGAAGTTGAAATCAAAAAAATTA TTGATGAAGATAATTTACTGACCAAACTTTCAGAACGTAAAACAGCTGTTTTGTCAAAAATTGAGGAGCTTGGCAAGTTA ACTGATTCGCTTAAAACACAAATTTTGGCTGCTGAAAAACTGACAGAAGTTGAAGATTTATATTTGCCTTACAAAGAAAA ACGGCGCACAAAAGCAACGATTGCAAAGGAAAATGGTTTATTTCCTTTGGCACAATTAATTGTAAAAAACGCTGCTAATC TTGAAGAGGAAGCAGAAAAATTTGTAAATGAGAATTTTACGACTGCTCAAAAAGCATTAGAGGGGGCGGTTGATATCCTA TCAGAAGCCATTTCTGAAGATGCGCGGTTGCGTTCATGGCTGACTGGTGAAATCAAAAACAATAGTTTACTGACAAGTAG TTTGAAAAAAGATGCCGTTGATGAAAAGCAAGTTTTTCAAATGTATTATAAATTCTCAGAAAAAGTTTCAGAATTACCAA ATTATCGTGTATTGGCTTTAAACCGTGGTGAAAAATTGGGGATTCTGTCAGTAAAATTTGAAAATAACGAAGACAAAATT TTACGTTATTTTGCCGCCCGTTTTGCTGCTCAAAATAATCCAATGATGCAAGTGGCCATTAAAGATGCCGTCAAGAAAAA ATTGATTCCGGCTATGGAACGTAGTATTCGGACCGAACTGACAGAAAAAGCTGAAGCTTCTGCCATTGAAGTTTTTGGCA AAAATTTGAAAAATCTTTTATTGGTTGCACCGCTTAAAGGCCGTGTAGTCATGGGATTTGACCCTGCTTACCGTACTGGA GCAAAGCTTGCTATTGTTGATGAAACAGGTAAATTATTGATGACAACTGTCATTTATCCTGTCAAACCAGCAAATGCAGG ACAAATTGCTCAGGCGAAAAAAGATTTAGCAAAATTTATTCGTGAATATGGCGTAAATATGATTGCCATTGGGAATGGGA CTGCCAGTCGCGAATCTGAAAGTTTTGTTTCTGAAGTCCTCAAAGAAAATAATTTTTCTGATGTTTATTATGTGATTGTC AGTGAATCTGGGGCCTCTGTTTATTCAGCAAGTGAATTGGCTCGTGAAGAATTTCCAGAATTGACTGTTGAAAAACGGTC AGCAATTTCAATTGCACGTCGTTTGCAAGATCCCTTAGCTGAACTTGTAAAAATTGAACCAAAAGCCATCGGTGTGGGTC AATATCAACATGATGTTTCTGAGAAAAAATTGACAGAAAACCTAGATTTTGTTGTTGAAACAGTCGTTAATCAGGTCGGT GTAAATGTCAATACAGCTAGTCCTAGCCTGCTTTCACACGTTGCGGGCCTTAATAAAAGTTTGGCCCAAAATGTGGTCAA ATATCGTGAAGAAAATGGGGCGCTTAAGACAAGAAACGAACTTAAAAAAGTCCCGCGTTTGGGAGCTAAGGCATTTGAAC AAGCGGCAGGTTTCCTAAGAATTCCAGAAGGAAAAAATTTCCTTGATAATACAGGGGTTCACCCAGAATCTTATAAAGTG ACTGAGCAACTTTTGACCGAAATTGCTGCTGGACCTGCTGTCAGTAATGAAGAATTACTGACCAAACTTTCGTCAGTAAA TATTCCTGAAATGGCTGAAAAACTTGGTCTTGGTCAGGAAACATTGACCGATATTATCAATGATTTGCAAAAACCTGGTC GTGATTTGCGTGAAAGCTTTGATGCACCAATTCTTCGTCAAGATGTCTTGTCGGCTGGAGATTTACAAATTGGTCAGCAA CTTGAAGGCGTGGTCCGTAATGTTGTTGATTTTGGTGCCTTTATTGATATCGGAATTAAAAATGACGGCTTGGCACACGT TTCTGATTTGAGCAAATCATTTGTCAAAAATCCAAGTGATGTGGTCGCTGTTGGACAAATTGTAACGGTTTGGGTCAAAT CTCTTGATTTACAAAGAGGAAAAATTAATTTGACCCTAGTGAATCCCCGCGAAAAAGATTAA Protein sequence : MENVKKIAELLNIKNSQVEKVLELTAEGNTVPFIARYRKEATGSLDEVEIKKIIDEDNLLTKLSERKTAVLSKIEELGKL TDSLKTQILAAEKLTEVEDLYLPYKEKRRTKATIAKENGLFPLAQLIVKNAANLEEEAEKFVNENFTTAQKALEGAVDIL SEAISEDARLRSWLTGEIKNNSLLTSSLKKDAVDEKQVFQMYYKFSEKVSELPNYRVLALNRGEKLGILSVKFENNEDKI LRYFAARFAAQNNPMMQVAIKDAVKKKLIPAMERSIRTELTEKAEASAIEVFGKNLKNLLLVAPLKGRVVMGFDPAYRTG AKLAIVDETGKLLMTTVIYPVKPANAGQIAQAKKDLAKFIREYGVNMIAIGNGTASRESESFVSEVLKENNFSDVYYVIV SESGASVYSASELAREEFPELTVEKRSAISIARRLQDPLAELVKIEPKAIGVGQYQHDVSEKKLTENLDFVVETVVNQVG VNVNTASPSLLSHVAGLNKSLAQNVVKYREENGALKTRNELKKVPRLGAKAFEQAAGFLRIPEGKNFLDNTGVHPESYKV TEQLLTEIAAGPAVSNEELLTKLSSVNIPEMAEKLGLGQETLTDIINDLQKPGRDLRESFDAPILRQDVLSAGDLQIGQQ LEGVVRNVVDFGAFIDIGIKNDGLAHVSDLSKSFVKNPSDVVAVGQIVTVWVKSLDLQRGKINLTLVNPREKD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 2e-136 | 45 |
