|
Name : llh_5545 (llh_5545) Accession : YP_005875708.1 Strain : Lactococcus lactis A76 Genome accession: NC_017492 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycine betaine ABC transporter permease OpuAB/substrate-binding protein OpuAC Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1036201 - 1037922 bp Length : 1722 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATTGATTTAGTGATTGGAAAAATACCATTAGCCAACTGGGTATCGTCAGCAACAGATTGGATTACAAGTACATTTAG TTCGGGTTTTGATGTGATTCAAAAATCAGGAACAGTGTTGATGAACGGAATAACAGGTGCTTTAACTGCAGTTCCATTCT GGCTGATGATTGCTGTTGTTACTATCCTAGCAATTTTGGTTTCAGGTAAAAAGTTTGCCTTCCCATTGTTTACTTTTATT GGTCTTTGTTTAATTGCCAATCAAGGCTTATGGTCAGATTTGATGAGTACGATTACCCTTGTCTTACTTTCAAGTTTGTT ATCAATTATCATAGGGGTCCCTCTAGGAATTTGGATGGCAAAATCTGAACTAGTAGCTAAGATTGTTCAACCTATATTGG ACTTCATGCAAACCATGCCTGGTTTTGTTTATTTGATTCCAGCAGTTGCCTTCTTTGGTATTGGGGTTGTTCCTGGGGTA TTTGCTTCAGTAATCTTTGCTTTGCCACCGACTGTCAGAATGACTAACTTAGGTATTCGCCAAGTTTCAACTGAATTAGT TGAAGCAGCAGATTCATTTGGTTCGACTGCCCGTCAGAAGTTATTTAAATTGGAATTTCCTTTAGCTAAAGGAACAATTA TGGCTGGTGTTAACCAAACAATTATGTTGGCTCTTTCTATGGTCGTTATTTCCTCTATGATTGGTGCACCTGGTTTAGGT CGTGGAGTACTAGCTGCTGTTCAATCAGCTGATATTGGTAAGGGATTTGTAAGTGGGATTTCATTAGTTATTTTGGCTAT TATTATTGACCGCTTTACGCAAAAACTTAATGTTTCTCCTTTAGAAAAACAAGGAAATCCTAAGCTCAAAAAATGGAAAC GTTGGATTGCTATCGTTTCATTGTTAGCCTTAATTGTTGGTGCTTTTTCGGGAATGTCTTTTGGGAAAAAATCTTCTGAT AAAAAAGTGGATTTAGTTTATATGAACTGGGACTCAGAAGTTGCGTCAATCAATGTTTTGACCCAAGCAATGGAAGAACA TAGTTTTGATGTTACAACGACTGCACTTGATAACGCAGTTGCTTGGCAAACTGTGGCTAATAGTCAAGCTGATGGAATGG TTTCTGCTTGGTTGCCAAACACTCATAAGACCCAATGGAAAAAATATGGTAAGTCTGTTGAGTTATTAGGTCCAAATCTT AAAGGCGCTAAAGTAGGATTTGTTGTGCCAAGTTATATGAATGTGAATTCAATTGAAGATTTGACTAATCAGGCCAATAA AACAATCACAGGAATTGAGCCTGGTGCAGGTGTCATGGCTGCCAGTGAAAATACACTTAAGAGCTATAGTAATCTTAAAG ATTGGAAGCTTGTTCCTTCATCATCTGGTGCAATGACTGTTGCTCTTGGTGAAGCCATTAAACAACATAAAGACATTGTA ATCACTGGTTGGTCTCCTCATTGGATGTTCAATAAATATGATTTGAAATACTTAGCTGATCCGAAAGGAACAATGGGGAC TTCAGAAAATATTAATACAATTGTGCGCAAAGGATTGAAAAAAGAAAATCCTGAAGCTTATAAGGTTTTGAATAATTTTA ATTGGACCACTAAAGATATGGAATCTGTTATGCTTGATATTCAAAATGGTAAGACACCAGAAGCAGCTGCAAAAGCTTGG ATTAAAGACCATCAAAAACAAGTTGATAAATGGTTTAAATAA Protein sequence : MIDLVIGKIPLANWVSSATDWITSTFSSGFDVIQKSGTVLMNGITGALTAVPFWLMIAVVTILAILVSGKKFAFPLFTFI GLCLIANQGLWSDLMSTITLVLLSSLLSIIIGVPLGIWMAKSELVAKIVQPILDFMQTMPGFVYLIPAVAFFGIGVVPGV FASVIFALPPTVRMTNLGIRQVSTELVEAADSFGSTARQKLFKLEFPLAKGTIMAGVNQTIMLALSMVVISSMIGAPGLG RGVLAAVQSADIGKGFVSGISLVILAIIIDRFTQKLNVSPLEKQGNPKLKKWKRWIAIVSLLALIVGAFSGMSFGKKSSD KKVDLVYMNWDSEVASINVLTQAMEEHSFDVTTTALDNAVAWQTVANSQADGMVSAWLPNTHKTQWKKYGKSVELLGPNL KGAKVGFVVPSYMNVNSIEDLTNQANKTITGIEPGAGVMAASENTLKSYSNLKDWKLVPSSSGAMTVALGEAIKQHKDIV ITGWSPHWMFNKYDLKYLADPKGTMGTSENINTIVRKGLKKENPEAYKVLNNFNWTTKDMESVMLDIQNGKTPEAAAKAW IKDHQKQVDKWFK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 1e-149 | 58 |
