Name : LCGL_1869 (LCGL_1869) Accession : YP_005871613.1 Strain : Lactococcus garvieae Lg2 Genome accession: NC_017490 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1849579 - 1852194 bp Length : 2616 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGAAAACAAGAAAAATAAATTACTGCTTATTGATGGATCTTCATTAGCATTTCGGGCTTTTTTTGCCCTCTATAATCA GGTAGATCGTTTTGTGGCTCCAAGTGGCTTACATACCAATGCGATCTATGGTTTTCATCTTATGCTTAATAATTTGGTCG AAAGATTAGAACCTAATCATGTTCTGATTGCATTTGATGCAGGAAAAACAACTTTTAGAACGGAAATGTTCGCTGCTTAC AAAGATGGGCGGGCACGTACACCGGATGAATTCCGTGAACAGCTGCCCTTTATTAAGGAGCTGATTGAAAAGTTAGGCTA TAATCATTATGAGCTTAAAAACTATGAAGCAGATGACATTATTGGTACTTTAGACAAAATGGCTGAACTCCCTGAAGCTG GTGATTATGATGTCACAATCGTAACTGGGGATAAGGATTTGATTCAGTTAGTGGATTCCAATACGACAGTGGAAATTTCG AAGAAAGGCGTCGCTGAGTTTGAAAGCTTCACACCTGCTTATTTAATGGAAAAAACGGGCTTAACCCCACAACAGTTTAT TGATCTTAAAGGTTTGATGGGGGATAGTTCGGATAATTATCCAGGAGTAACAAAAGTCGGTGAAAAGACGGCCTTGAAGT TGCTTCAAGAGTGGGGTTCTATCGATAATCTCTATGAGAATATTAATTCACTTAAGAAAAGTAAGATGAAGGAAAATCTT ATTGCTGACCGTGAAATGGCCTTTTTATCTCGTACTCTTGCAACGATTGATACGAAATCTCCAATTGAAATTGATCTTGC TGATACTTTGATTAAACCTGTGGATGCAGCAGAGTTGATCAAGTTTTATGATGAGATGGGATTTGCGCAATTCAAAGCCA AACTTGAAACGGCAGAGGCTGATGAGGTTACACTTAGCTTTGAAGTTGTGGAAGAAGCAGCAGACATTTTAGTGGACAAA GACGATTTCTTTTATATCGAAATTTTAAATGAAAATTACCACAAAGAAGAAATCATTGGCTTTGCTTGGGGAAATGAAGA AAAAGTTTTTGTCTCGAAGAATACAGAACTCTTAAAGCATTTTGTCTTTCCGGAAAATACATACGATTTTAAGAAAAATA AAGTTTTGCTTCATCGCTTAGGTATTGAACTACCGACAGCCAAGTACGACAGTATGTTAGCTAAATATCTTATTTCTACA ACGGAAGATAATAAGGTTGAAACGATTGGTCGATTATTTGCCAACAAGTATATATCTACAGATGAAGAAGTTTACGGCAA AGGAGCAAAACGTCGTATCCCTGAAGATGAAATTCTATTCAAACATTTGGCAGGAAAAATCCATGTCTTGGCCACAACGA AAGCAGTAATGATTCAAAATCTCGAGGAAAATGAACAGTATCATCTTCTGACGGAAATGGAATTACCCCTGGCCAACGTG CTAGCTAAAATGGAAATAGCAGGAATAGCTGCTGAAGTGAGCACCTTAGAAGAAATTGGTGCGGCAAATCAAAATCTGAT TGCTGATTTAACTGAACAAATTTATGCACTTGCAGGTGAAGAATTTAATATCAACTCACCTAAACAACTTGGAGTCATTC TTTTTGAAAAATTACAGTTGCCGCATGGGAAAAAAACAAAGACAGGCTATTCAACAGCAGCAGATATTTTAGAAAACTTG GCTCAAGATTATGAATTAGTGGCCAAAATACTCGAATATCGTCAAATCTCAAAAATTCAATCCACTTATGTGCAAGGTTT GATTCCGCAAATAGCCGAAGATGGACGTATCCATACACGATATGTACAGGATTTAACCCAAACAGGGCGTCTCTCCTCGA TTGATCCAAATCTGCAGAATATTCCAGTACGCTTAGAAGCCGGACGCTTGATTCGCAAAGCTTTTGTAGCTGCTGAAAAT AACATTCTGTTAAGTTCCGACTATTCACAAATTGAACTTCGGGTTTTGGCACATATGTCTAAAGACGAACATCTTATTGA TGCCTTTAATCATGGCGCTGACATTCATAGCAGTACAGCAATGCGTGTTTTCAACATAGATAAGCCCGAAAATGTTACGC CTAATGATCGTCGCAATGCGAAAGCTGTCAATTTTGGTATCTCCTATGGAGAAACAGAATACGGACTCGCTAAACGCTTG AGTATTTCCAATAAGGAAGCAGCAGAGATGATCCAAGCATACTTTGAACGTTATCCAGGAGTGGCAAATTATATAGCAGA AACAAAACGTGAAGCCAAGGATAAAGGTTACGTAAGCACGATGTTTAACCGCCGGCGTAAACTGCCAGAAATCAATAATC GCAACTTCATGGTGCGTCAGGGTGCAGAACGTCAAGCTATTAATGCCCCAATTCAAGGGTCAGCCGGCGATATCTTGAAA ATTGCCATGATTAACCTCGATGCAGCATTGTCAGAAGGCAAGTTTAAAGCCAAATTGTTGCTGCAAGTTCACGATGAGAT TATTCTTGAAGTACCTAAGGAAGAACTTACGGCGGTTCAAACCTTGGTGAAACAAACCATGGAATCTGCGGTCGAGTTAA ACGTTCCTTTAATTGCAGATGAAAATACGGGCGACAGCTGGTATGAAGCAAAATAA Protein sequence : MENKKNKLLLIDGSSLAFRAFFALYNQVDRFVAPSGLHTNAIYGFHLMLNNLVERLEPNHVLIAFDAGKTTFRTEMFAAY KDGRARTPDEFREQLPFIKELIEKLGYNHYELKNYEADDIIGTLDKMAELPEAGDYDVTIVTGDKDLIQLVDSNTTVEIS KKGVAEFESFTPAYLMEKTGLTPQQFIDLKGLMGDSSDNYPGVTKVGEKTALKLLQEWGSIDNLYENINSLKKSKMKENL IADREMAFLSRTLATIDTKSPIEIDLADTLIKPVDAAELIKFYDEMGFAQFKAKLETAEADEVTLSFEVVEEAADILVDK DDFFYIEILNENYHKEEIIGFAWGNEEKVFVSKNTELLKHFVFPENTYDFKKNKVLLHRLGIELPTAKYDSMLAKYLIST TEDNKVETIGRLFANKYISTDEEVYGKGAKRRIPEDEILFKHLAGKIHVLATTKAVMIQNLEENEQYHLLTEMELPLANV LAKMEIAGIAAEVSTLEEIGAANQNLIADLTEQIYALAGEEFNINSPKQLGVILFEKLQLPHGKKTKTGYSTAADILENL AQDYELVAKILEYRQISKIQSTYVQGLIPQIAEDGRIHTRYVQDLTQTGRLSSIDPNLQNIPVRLEAGRLIRKAFVAAEN NILLSSDYSQIELRVLAHMSKDEHLIDAFNHGADIHSSTAMRVFNIDKPENVTPNDRRNAKAVNFGISYGETEYGLAKRL SISNKEAAEMIQAYFERYPGVANYIAETKREAKDKGYVSTMFNRRRKLPEINNRNFMVRQGAERQAINAPIQGSAGDILK IAMINLDAALSEGKFKAKLLLQVHDEIILEVPKEELTAVQTLVKQTMESAVELNVPLIADENTGDSWYEAK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 65 |