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Name : LCGL_1067 (LCGL_1067) Accession : YP_005870811.1 Strain : Lactococcus garvieae Lg2 Genome accession: NC_017490 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycine betaine ABC transporter permease and substrate-binding component Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1086561 - 1088285 bp Length : 1725 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATTGAGTTAGCAATAGGTAAGATACCCTTAGCAGATTGGGTTTCGACTGCAACAGATTGGATTACAAGTAATTTAAG TGCTGGTTTTGATATTATTCAAAAATCCGGTACAGCAATTATGGATACAGTAACTGCAGGACTTACAGCTGTACCCTTTT GGTTAATGATTATTGTGGTTACATTCTTGGCAGTTTTAGTTTCAGGACGTAAAATTGCCTTCCCTATCTTTACATTCTTA GGTTTAGTTCTTATTGCCAATCAAGGTTTATGGACAGACTTGATGAATACAGTAACATTGGTCTTGCTCTCTAGTTTAGT TTCTATTATTATCGGTATTCCTTTAGGTATATGGATGGCTAAGTCCGAACTTGTTGCTAAGATTGTACAACCAATATTGG ACTTCATGCAAACCATGCCCGGTTTCGTTTACTTGATTCCGGCCGTTGCTTTCTTTGGTATCGGTGTGGTTCCTGGTGTA TTTGCCTCTGTTATCTTTGCTTTGCCTCCAACAGTTCGTATGACAAACTTGGGTATTCGTCAAGTTTCAACTGAATTGGT CGAAGCAGCAGATTCTTTTGGTTCAACACCAAGACAAAAGCTCTTTAAGTTAGAGTTTCCTTTGGCAAAAGGAACAATTT TAGCAGGTGTTAACCAAACAATTATGTTGGCACTCTCAATGGTTGTTATTGCTTCAATGATCGGTGCACCTGGACTTGGA CGCGGTGTCTTAGCGGCTGTTCAATCTGCGGATATCGGTAAAGGTTTTGTAAACGGTATTGCTTTGGTTATTTTAGCTAT TATCATTGACCGTTTCACTCAAAAACTTAACGTTGCCCCAACTGAAAAGCAAGGCAATCCACAGCTTAAAAAATGGAAGA AAAGAGGAGCGCTGGTAGCTCTTATCGTTCTGATCATTGGTGGAATTTCTGGTGTTACACTTAAGAAAACAGCAGCAGAT AAAAATGTTGAGCTTGTCTATATGAACTGGGATTCAGAAGTTGCATCTATTAACGTATTGAGTCAAGCTATGGAGCAACA TGGGTTTGATGTTAAGAAGACAGCTTTAGATAATACAGTTGCTTGGCAAACTGTAGCGAACGGTCAAGCTGACGGTATGG TTTCTGCTTGGCTGCCAAACACCCATGAAACACAATGGAAAAAATTCAGCAAATCTGTTGAATTGCTTGGCCCTAACCTT AAAGGAGCTAAAGTTGGTCTTGTTGTTCCAAGCTACATGAAAGCAAACTCTATTGAAGACCTTAAAGACCAAGCGGATAA ATCTATTATCGGTATTGAACCTGGTGCTGGTGTTATGGCCGCAACAGAAAAAGCCCTGAAAGATTATGATAACTTGAAAG ATTGGAACTTGGTACCATCGTCTTCAGGTGCGATGACTGTTGCCCTTGGTGAAGCTATCAAACAACATAAAGATATCGTA ATCACAGGTTGGTCACCACACTGGATGTTTAATAAATATGATTTGAAATATTTAGAAGATCCTAAAAACTCAATGGGTAA AGCTGAAGACATCAACACTATTGTACGTAAAGGACTTAAAGAAGATAATCCTGAAGCTTATAAAGTATTAGACAAGTTTA ACTGGTCTCAAAAAGATATGGAATCTGTAATGCTTGATGTTCAAAATGGTAAAACACCAGAACAAGCAGCAGCAACATGG ATTAAATCTCATAAAGAACAAGTTGATAAATGGTTTGAAGACTAA Protein sequence : MIELAIGKIPLADWVSTATDWITSNLSAGFDIIQKSGTAIMDTVTAGLTAVPFWLMIIVVTFLAVLVSGRKIAFPIFTFL GLVLIANQGLWTDLMNTVTLVLLSSLVSIIIGIPLGIWMAKSELVAKIVQPILDFMQTMPGFVYLIPAVAFFGIGVVPGV FASVIFALPPTVRMTNLGIRQVSTELVEAADSFGSTPRQKLFKLEFPLAKGTILAGVNQTIMLALSMVVIASMIGAPGLG RGVLAAVQSADIGKGFVNGIALVILAIIIDRFTQKLNVAPTEKQGNPQLKKWKKRGALVALIVLIIGGISGVTLKKTAAD KNVELVYMNWDSEVASINVLSQAMEQHGFDVKKTALDNTVAWQTVANGQADGMVSAWLPNTHETQWKKFSKSVELLGPNL KGAKVGLVVPSYMKANSIEDLKDQADKSIIGIEPGAGVMAATEKALKDYDNLKDWNLVPSSSGAMTVALGEAIKQHKDIV ITGWSPHWMFNKYDLKYLEDPKNSMGKAEDINTIVRKGLKEDNPEAYKVLDKFNWSQKDMESVMLDVQNGKTPEQAAATW IKSHKEQVDKWFED |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 5e-146 | 59 |
