Gene Information

Name : nifJ (CVCAS_0406)
Accession : YP_005867804.1
Strain : Lactococcus lactis CV56
Genome accession: NC_017486
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : pyruvate dehydrogenase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 1.2.7.-
Position : 414410 - 417991 bp
Length : 3582 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
TTGAAAAAAATGAAAAAAACAATGGACGGAAACATGGCGGCAGCACATATTGCTTACGCCTTTTCAGAAATTGCCGTAAT
TTATCCAATTACCCCAAGTTCACCAATGGCAGATTATACTGACGCGTGGTCAGTTGCTGGTCGTAAAAATATCTGGGGCT
CAACAGTAAAAATTACAGAACTACAATCAGAAGCCGGTGCAGCAGGTGCCATGCACGGTGTTCTTAAAGCAGGAGGGCTT
GCGACAACTTATACCGCTTCGCAAGGGCTCCTTTTAATGCTTCCAAATATGTATAAAATGGCTGGTGAACTTTTGCCAGC
AGTTATTCATGTCGCAGCTCGTGCCGTAGCGGCTGGGGCGCTTAATATTTTTGGAGACCAGTCTGACGTGATGTCAGCCA
GAACAACTGGGTTTGCCATGTTAGCAGAGTCATCTGTTCAAGAAGTGATGGACTTGTCAGCAGTTGCCCACTTAGCAACA
CTTGAAGGTTCAGTTCCTTTCTTGAATTTCTTTGACGGTTTTAGAACTTCTCATGAAATTCAAAAAATTGATGTTATTGA
TTATCAAGATTTATTACCAATGGTTAATCAAGAAAAATTAGCTGATTTTCGTGACCGTGCAATGAACCCTGATCATCCTA
CAGTTTCAGGGACAAATCAAAATGCAGATATCTATTTCCAACAAAGGGAAACGGTCAATTCTTACTATGAAGCTCTTCCT
GAAATCGTTCAAAAGTACATGGGAAAAATCAATAAACTTCGTGGGACAGATTATGATTTAGTCAATTATTATGGCGCACC
TGATGCGACAGAAGTCATTGTTTCTATGGGTTCTGTTGCTGGGACAATTGAGCAAACAGTTGATTATTTAAATGAACAAG
GCCGAAAAGTTGGTTTTATCAATGTTCACTTATATCGTCCATTTCCATTGGAAAACTTTCTTGAAAAATTACCAAAGACA
GTCAAATCAGTAGCGGTCTTAGACCGTACAAAAGAATCGGGTTCAAATGGAGAACCTCTTTTCCTTGACGTTCAATCAGC
GCTTTTCAATTCTAATGTTAAACAAGTGATTGGTGGCCGCTATGGAATTGGTGGAAAAGATACTCGTCCAGAACACATCG
TCAGTGTTTTTGATGAATTAGTCAAAGCACAACCAAAACGTATGTTTACAATCGGAATTAATGATGATGTTACAAACTTG
TCTCTGACAAATTCAAGAGTCCTTGATTTAACACCAGCAGATACATTTCAAGCAAAATTCTGGGGCTTTGGTTCAGATGG
AACAGTTGGTGCCAATAAAGCAGCAATCAAAATTATTGGTGACCATACTGATAAATATGTTCAAGCCGCTTTTGAATATG
ATTCAAAAAAATCAGGTGGATTAACCATTTCACATTTACGTTTTGGTGATTCGCCAATTACTTCTGAATATATGACAGCT
ACACTTGATTTTGTTGCTTGTCACAACATGACTTATGTACGTAAATATAACTTGACCAAAGGCTTGAAAGCTGGAGGCCT
ATTTCTATTAAACACAAGTTGGAATCTAGAACAACTTTCAAAAAATCTTCCGAATGAAATGAAGAAATTCATTGCCGAAA
ATCAAATTCGATTTTATACGATTGATGCCATGAAAATTGCTCATGAAACCGGAATGGAACGCAGAATTAATACGATTATG
CAGGTCGCCTTTTTCAAATTGGCTCATGTTATGCCTTTTGATGAAGCCTATGAGATTCTGAAAAAAGATGCTCAAAAATA
TGCAAAGAAATCACCAACCATTGTTGAACAAAATTTGAATGCAATGGCACTTGCTTTGAACGGCTTGCATGAAGTAAAGA
TTCCAGAAAGCTGGGCTGAAACTCAAGAAGAAAAAACGAAAGTTCTTACGACAGAAAGTTCTCGTAAAAAATATGTTTTT
GAAATTGTAAATAAAACCAATGCCTTTGAAGGTGATGAACTTTCGGTACAAACCTTAGTCGATAACAAAATGACTTTTGG
AGATGAACCATTGGGAACAAGTGCTTCTGAAAAAAGGGTAATTGCCTTAGAAATTCCTGAATGGAATGCCCAAGCTTGTA
TTCAATGTAATGAATGTTCATTTGTTTGTCCACATGCTGCAATCAGACCATTTTTAGTCGACGAAGACGAATGGAATCAA
GCGCCAGAAGGTTTCCATGTTATGGATTATAAAGGAGCTGATGGCTTAAAATATCGGATTCAGGTCTCTGTTGAAGACTG
TACAGGTTGTGGATTATGTGTTGAAGCTTGTCCTAAAAAGGGTGAAGCTTTAAAAATGATTCCTTATGAGGGACAAGAAA
AAGAATCTGTCAATTGGGCTTTTGCGCAAACCCTTAAAACAAAAGAAAATCCAGCTCGTCCAGGTACAATTGCCGCTAGT
CAATTTGAAAAACCACTTTTTGAATTTTCAGGAGCATGCTCAGGCTGTGGTGAAACACCATATATTAAATTATTGACACA
AATGTTTGGTGACCGAATGATGATTTCCAATGCAACTGGCTGTTCAGCCATTTATGGTGGAACACAAGCAACACCATATA
CAACAAATGAGTTTGAACAAGGCCCTGCATGGTCAAACTCACTCTTTGAGGATAATGCGGAATACGGATATGGAATGTGG
CTAGCTTCTCAAACCAGACGTCAAAAATTAGCAGCCCAAGTCCTTGAAGCCTTGCCAGAAATGTCAGATGATTTGCAAAA
ATTGGCGAAAGACTGGGTAGAACACTTAGAAGATTCAGAAGGAACACGAGCAAGAGCCGAAAAAATGAAGGGAATGCTTG
CTTCTGAACACTTCAACTCAGCTAAGTTGGATGAAATATATAAACAAAAAGATCAATTTGTAAAACCAACCCAATGGATA
TTTGGTGGAGATGGTTGGGCCTATGATATTGGTTTTGGCGGTTTAGACCATATCGTGGCTTCAGGTGCTGATGTTAATAT
CTTAGTTATGGACAACGAAGTCTATGCCAATACTGGGGGACAAGTTTCTAAAGCAACTCCAGCTTCAGCAATTGCACAAT
TTGCTGCTGGCGGTAAATCTAATACGAAAAAAGATTTAGGAGCGATGCTAATGACCTACGGAGATGTTTATGTGGCTCAG
ATTGCTTCTGGAGCAAACATGATGCAAACAATCCGTACCTTTGATGAAGCTGAAAAATTTAAAGGTCCATCAGTCATTAT
TGCTTATACTCCATGTATTTCACATGGTTTATATGGAGGAATACATTTAGCACTTGATGAAGCAAAAGAAGCCGTGAATT
CTGGTTACTGGCAACTTTATCGCTATAATCCTCTTCTTGAAGATTTGGGTAAAAATCCGATGATTCTTGATTTCAAAAAA
CCTGATTTTAGTAAAGTTAGAGATTTCTTATTGACACAATCTCGTTTTGGTAATCTATTAAAAGTTGATGCTGAACATGC
AGAAAGTTTGTATGCTAAAGCTGCCAAAGATTCTCGTAAACGATTTATGCGTTATGCTAGAACATCAGGAGATTTAGATA
AGTATTTAGAACGTGAAGCAAAAGCACTGGCGAAAAAAATCCTGAATCAGAGGGGACTATAG

Protein sequence :
MKKMKKTMDGNMAAAHIAYAFSEIAVIYPITPSSPMADYTDAWSVAGRKNIWGSTVKITELQSEAGAAGAMHGVLKAGGL
ATTYTASQGLLLMLPNMYKMAGELLPAVIHVAARAVAAGALNIFGDQSDVMSARTTGFAMLAESSVQEVMDLSAVAHLAT
LEGSVPFLNFFDGFRTSHEIQKIDVIDYQDLLPMVNQEKLADFRDRAMNPDHPTVSGTNQNADIYFQQRETVNSYYEALP
EIVQKYMGKINKLRGTDYDLVNYYGAPDATEVIVSMGSVAGTIEQTVDYLNEQGRKVGFINVHLYRPFPLENFLEKLPKT
VKSVAVLDRTKESGSNGEPLFLDVQSALFNSNVKQVIGGRYGIGGKDTRPEHIVSVFDELVKAQPKRMFTIGINDDVTNL
SLTNSRVLDLTPADTFQAKFWGFGSDGTVGANKAAIKIIGDHTDKYVQAAFEYDSKKSGGLTISHLRFGDSPITSEYMTA
TLDFVACHNMTYVRKYNLTKGLKAGGLFLLNTSWNLEQLSKNLPNEMKKFIAENQIRFYTIDAMKIAHETGMERRINTIM
QVAFFKLAHVMPFDEAYEILKKDAQKYAKKSPTIVEQNLNAMALALNGLHEVKIPESWAETQEEKTKVLTTESSRKKYVF
EIVNKTNAFEGDELSVQTLVDNKMTFGDEPLGTSASEKRVIALEIPEWNAQACIQCNECSFVCPHAAIRPFLVDEDEWNQ
APEGFHVMDYKGADGLKYRIQVSVEDCTGCGLCVEACPKKGEALKMIPYEGQEKESVNWAFAQTLKTKENPARPGTIAAS
QFEKPLFEFSGACSGCGETPYIKLLTQMFGDRMMISNATGCSAIYGGTQATPYTTNEFEQGPAWSNSLFEDNAEYGYGMW
LASQTRRQKLAAQVLEALPEMSDDLQKLAKDWVEHLEDSEGTRARAEKMKGMLASEHFNSAKLDEIYKQKDQFVKPTQWI
FGGDGWAYDIGFGGLDHIVASGADVNILVMDNEVYANTGGQVSKATPASAIAQFAAGGKSNTKKDLGAMLMTYGDVYVAQ
IASGANMMQTIRTFDEAEKFKGPSVIIAYTPCISHGLYGGIHLALDEAKEAVNSGYWQLYRYNPLLEDLGKNPMILDFKK
PDFSKVRDFLLTQSRFGNLLKVDAEHAESLYAKAAKDSRKRFMRYARTSGDLDKYLEREAKALAKKILNQRGL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed AFJ97267.1 pyruvate ferredoxin Virulence Not named Protein 0.0 49