Name : nifJ (CVCAS_0406) Accession : YP_005867804.1 Strain : Lactococcus lactis CV56 Genome accession: NC_017486 Putative virulence/resistance : Virulence Product : pyruvate dehydrogenase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.2.7.- Position : 414410 - 417991 bp Length : 3582 bp Strand : + Note : - DNA sequence : TTGAAAAAAATGAAAAAAACAATGGACGGAAACATGGCGGCAGCACATATTGCTTACGCCTTTTCAGAAATTGCCGTAAT TTATCCAATTACCCCAAGTTCACCAATGGCAGATTATACTGACGCGTGGTCAGTTGCTGGTCGTAAAAATATCTGGGGCT CAACAGTAAAAATTACAGAACTACAATCAGAAGCCGGTGCAGCAGGTGCCATGCACGGTGTTCTTAAAGCAGGAGGGCTT GCGACAACTTATACCGCTTCGCAAGGGCTCCTTTTAATGCTTCCAAATATGTATAAAATGGCTGGTGAACTTTTGCCAGC AGTTATTCATGTCGCAGCTCGTGCCGTAGCGGCTGGGGCGCTTAATATTTTTGGAGACCAGTCTGACGTGATGTCAGCCA GAACAACTGGGTTTGCCATGTTAGCAGAGTCATCTGTTCAAGAAGTGATGGACTTGTCAGCAGTTGCCCACTTAGCAACA CTTGAAGGTTCAGTTCCTTTCTTGAATTTCTTTGACGGTTTTAGAACTTCTCATGAAATTCAAAAAATTGATGTTATTGA TTATCAAGATTTATTACCAATGGTTAATCAAGAAAAATTAGCTGATTTTCGTGACCGTGCAATGAACCCTGATCATCCTA CAGTTTCAGGGACAAATCAAAATGCAGATATCTATTTCCAACAAAGGGAAACGGTCAATTCTTACTATGAAGCTCTTCCT GAAATCGTTCAAAAGTACATGGGAAAAATCAATAAACTTCGTGGGACAGATTATGATTTAGTCAATTATTATGGCGCACC TGATGCGACAGAAGTCATTGTTTCTATGGGTTCTGTTGCTGGGACAATTGAGCAAACAGTTGATTATTTAAATGAACAAG GCCGAAAAGTTGGTTTTATCAATGTTCACTTATATCGTCCATTTCCATTGGAAAACTTTCTTGAAAAATTACCAAAGACA GTCAAATCAGTAGCGGTCTTAGACCGTACAAAAGAATCGGGTTCAAATGGAGAACCTCTTTTCCTTGACGTTCAATCAGC GCTTTTCAATTCTAATGTTAAACAAGTGATTGGTGGCCGCTATGGAATTGGTGGAAAAGATACTCGTCCAGAACACATCG TCAGTGTTTTTGATGAATTAGTCAAAGCACAACCAAAACGTATGTTTACAATCGGAATTAATGATGATGTTACAAACTTG TCTCTGACAAATTCAAGAGTCCTTGATTTAACACCAGCAGATACATTTCAAGCAAAATTCTGGGGCTTTGGTTCAGATGG AACAGTTGGTGCCAATAAAGCAGCAATCAAAATTATTGGTGACCATACTGATAAATATGTTCAAGCCGCTTTTGAATATG ATTCAAAAAAATCAGGTGGATTAACCATTTCACATTTACGTTTTGGTGATTCGCCAATTACTTCTGAATATATGACAGCT ACACTTGATTTTGTTGCTTGTCACAACATGACTTATGTACGTAAATATAACTTGACCAAAGGCTTGAAAGCTGGAGGCCT ATTTCTATTAAACACAAGTTGGAATCTAGAACAACTTTCAAAAAATCTTCCGAATGAAATGAAGAAATTCATTGCCGAAA ATCAAATTCGATTTTATACGATTGATGCCATGAAAATTGCTCATGAAACCGGAATGGAACGCAGAATTAATACGATTATG CAGGTCGCCTTTTTCAAATTGGCTCATGTTATGCCTTTTGATGAAGCCTATGAGATTCTGAAAAAAGATGCTCAAAAATA TGCAAAGAAATCACCAACCATTGTTGAACAAAATTTGAATGCAATGGCACTTGCTTTGAACGGCTTGCATGAAGTAAAGA TTCCAGAAAGCTGGGCTGAAACTCAAGAAGAAAAAACGAAAGTTCTTACGACAGAAAGTTCTCGTAAAAAATATGTTTTT GAAATTGTAAATAAAACCAATGCCTTTGAAGGTGATGAACTTTCGGTACAAACCTTAGTCGATAACAAAATGACTTTTGG AGATGAACCATTGGGAACAAGTGCTTCTGAAAAAAGGGTAATTGCCTTAGAAATTCCTGAATGGAATGCCCAAGCTTGTA TTCAATGTAATGAATGTTCATTTGTTTGTCCACATGCTGCAATCAGACCATTTTTAGTCGACGAAGACGAATGGAATCAA GCGCCAGAAGGTTTCCATGTTATGGATTATAAAGGAGCTGATGGCTTAAAATATCGGATTCAGGTCTCTGTTGAAGACTG TACAGGTTGTGGATTATGTGTTGAAGCTTGTCCTAAAAAGGGTGAAGCTTTAAAAATGATTCCTTATGAGGGACAAGAAA AAGAATCTGTCAATTGGGCTTTTGCGCAAACCCTTAAAACAAAAGAAAATCCAGCTCGTCCAGGTACAATTGCCGCTAGT CAATTTGAAAAACCACTTTTTGAATTTTCAGGAGCATGCTCAGGCTGTGGTGAAACACCATATATTAAATTATTGACACA AATGTTTGGTGACCGAATGATGATTTCCAATGCAACTGGCTGTTCAGCCATTTATGGTGGAACACAAGCAACACCATATA CAACAAATGAGTTTGAACAAGGCCCTGCATGGTCAAACTCACTCTTTGAGGATAATGCGGAATACGGATATGGAATGTGG CTAGCTTCTCAAACCAGACGTCAAAAATTAGCAGCCCAAGTCCTTGAAGCCTTGCCAGAAATGTCAGATGATTTGCAAAA ATTGGCGAAAGACTGGGTAGAACACTTAGAAGATTCAGAAGGAACACGAGCAAGAGCCGAAAAAATGAAGGGAATGCTTG CTTCTGAACACTTCAACTCAGCTAAGTTGGATGAAATATATAAACAAAAAGATCAATTTGTAAAACCAACCCAATGGATA TTTGGTGGAGATGGTTGGGCCTATGATATTGGTTTTGGCGGTTTAGACCATATCGTGGCTTCAGGTGCTGATGTTAATAT CTTAGTTATGGACAACGAAGTCTATGCCAATACTGGGGGACAAGTTTCTAAAGCAACTCCAGCTTCAGCAATTGCACAAT TTGCTGCTGGCGGTAAATCTAATACGAAAAAAGATTTAGGAGCGATGCTAATGACCTACGGAGATGTTTATGTGGCTCAG ATTGCTTCTGGAGCAAACATGATGCAAACAATCCGTACCTTTGATGAAGCTGAAAAATTTAAAGGTCCATCAGTCATTAT TGCTTATACTCCATGTATTTCACATGGTTTATATGGAGGAATACATTTAGCACTTGATGAAGCAAAAGAAGCCGTGAATT CTGGTTACTGGCAACTTTATCGCTATAATCCTCTTCTTGAAGATTTGGGTAAAAATCCGATGATTCTTGATTTCAAAAAA CCTGATTTTAGTAAAGTTAGAGATTTCTTATTGACACAATCTCGTTTTGGTAATCTATTAAAAGTTGATGCTGAACATGC AGAAAGTTTGTATGCTAAAGCTGCCAAAGATTCTCGTAAACGATTTATGCGTTATGCTAGAACATCAGGAGATTTAGATA AGTATTTAGAACGTGAAGCAAAAGCACTGGCGAAAAAAATCCTGAATCAGAGGGGACTATAG Protein sequence : MKKMKKTMDGNMAAAHIAYAFSEIAVIYPITPSSPMADYTDAWSVAGRKNIWGSTVKITELQSEAGAAGAMHGVLKAGGL ATTYTASQGLLLMLPNMYKMAGELLPAVIHVAARAVAAGALNIFGDQSDVMSARTTGFAMLAESSVQEVMDLSAVAHLAT LEGSVPFLNFFDGFRTSHEIQKIDVIDYQDLLPMVNQEKLADFRDRAMNPDHPTVSGTNQNADIYFQQRETVNSYYEALP EIVQKYMGKINKLRGTDYDLVNYYGAPDATEVIVSMGSVAGTIEQTVDYLNEQGRKVGFINVHLYRPFPLENFLEKLPKT VKSVAVLDRTKESGSNGEPLFLDVQSALFNSNVKQVIGGRYGIGGKDTRPEHIVSVFDELVKAQPKRMFTIGINDDVTNL SLTNSRVLDLTPADTFQAKFWGFGSDGTVGANKAAIKIIGDHTDKYVQAAFEYDSKKSGGLTISHLRFGDSPITSEYMTA TLDFVACHNMTYVRKYNLTKGLKAGGLFLLNTSWNLEQLSKNLPNEMKKFIAENQIRFYTIDAMKIAHETGMERRINTIM QVAFFKLAHVMPFDEAYEILKKDAQKYAKKSPTIVEQNLNAMALALNGLHEVKIPESWAETQEEKTKVLTTESSRKKYVF EIVNKTNAFEGDELSVQTLVDNKMTFGDEPLGTSASEKRVIALEIPEWNAQACIQCNECSFVCPHAAIRPFLVDEDEWNQ APEGFHVMDYKGADGLKYRIQVSVEDCTGCGLCVEACPKKGEALKMIPYEGQEKESVNWAFAQTLKTKENPARPGTIAAS QFEKPLFEFSGACSGCGETPYIKLLTQMFGDRMMISNATGCSAIYGGTQATPYTTNEFEQGPAWSNSLFEDNAEYGYGMW LASQTRRQKLAAQVLEALPEMSDDLQKLAKDWVEHLEDSEGTRARAEKMKGMLASEHFNSAKLDEIYKQKDQFVKPTQWI FGGDGWAYDIGFGGLDHIVASGADVNILVMDNEVYANTGGQVSKATPASAIAQFAAGGKSNTKKDLGAMLMTYGDVYVAQ IASGANMMQTIRTFDEAEKFKGPSVIIAYTPCISHGLYGGIHLALDEAKEAVNSGYWQLYRYNPLLEDLGKNPMILDFKK PDFSKVRDFLLTQSRFGNLLKVDAEHAESLYAKAAKDSRKRFMRYARTSGDLDKYLEREAKALAKKILNQRGL |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
unnamed | AFJ97267.1 | pyruvate ferredoxin | Virulence | Not named | Protein | 0.0 | 49 |