|
Name : yciC (CVCAS_0270) Accession : YP_005867669.1 Strain : Lactococcus lactis CV56 Genome accession: NC_017486 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 272286 - 274424 bp Length : 2139 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGGAAAATGTTAAAAAAATTGCTGAATTGTTGAATATTAAAAATTCACAAGTTGAAAAAGTATTAGAATTGACGGCAGA GGGGAACACAGTTCCGTTTATTGCTCGTTATCGTAAAGAAGCAACAGGTTCACTTGACGAAGTTGAAATCAAAAAAATTA TTGATGAAGATAATTTACTGACAAAATTATCAGAACGTAAAACGGCTGTTTTGTCAAAAATTGAAGAGCTTGGTAAGTTG ACTGATTCGCTAAAAGCACAAATTTTGGCTGCTGAAAAACTAACAGAAGTTGAAGATTTATATCTGCCTTACAAAGAAAA ACGGCGCACAAAAGCAACGATTGCAAAGGAAAATGGTTTATTTCCTTTGGCTCAATTGATTGTAAAAAATTCAGCGAATC TTGAAGAAGAAGCTGAAAAATTTGTCAATGAGAATTTTACAAGCCCTCAAAAAGCTTTGGAAGGTGCTGTGGATATCTTG TCAGAAGCGATTTCTGAGGATGCACGTTTGCGCTCATGGCTGACCGGTGAAATCAAAAACAATAGTTTACTGACAAGTAG TTTGAAAAAAGATGCCGTTGATGAAAAGCAAGTTTTTCAAATGTATTATGAATTCTCAGAAAAAGTTTCAGAATTACCAA ATTATCGTGTATTGGCTTTAAACCGTGGTGAAAAATTGGGGATTCTGTCAGTAAAATTTGAAAATAACGAAGATAAAATT TTACGTTATTTTGCCGCCCGTTTTGCTGCTCAAAATAATCCAATGATGCAAGTGGCGATTAAAGATGCTGTCAAGAAAAA ATTGATTCCGGCTATGGAACGTAGTATTCGGACTGAATTGACAGAAAAAGCTGAAGCATCTGCCATCGAAGTTTTTGGCG AAAATTTGAAAAATTTATTATTGGTGGCTCCGCTTAAAGGGCGTGTAGTCATGGGATTTGACCCTGCTTACCGTACTGGA GCAAAGCTTGCTATTGTTGATGAGACAGGTAAATTATTGATGACAACGGTCATTTATCCTGTGAAGCCAGCAAATGCAGG TCAAATTGCTCAAGCGAAAAAAGATTTAGCAAAATTCATTCGAGAATATGGTGTGAATATGATTGCGATTGGGAATGGAA CTGCCAGTCGCGAATCTGAAAGTTTTGTTGCAGAAGTACTCAAGGAAAATAATTTTTCTGATGTTTATTATGTGATTGTC AGTGAATCTGGAGCCTCTGTTTATTCAGCGAGCGAGTTGGCACGTGAAGAATTTCCAGAATTGACTGTTGAAAAACGTTC AGCAATTTCGATTGCACGCCGTTTGCAAGATCCATTGGCTGAACTTGTAAAAATCGAACCAAAAGCCATTGGTGTTGGTC AATATCAACATGATGTTTCTGAGAAAAAATTAACAGAAAATCTTGATTTTGTCGTGGAAACAGTAGTTAACCAAGTTGGT GTTAATGTCAATACAGCCAGTCCTAGTTTGCTTTCACACGTAGCTGGCCTTAATAAAAGTTTGGCACAGAATGTAGTAAA ATATCGTGAAGAAAATGGCGCACTCAAAACAAGAGCGGAACTAAAAAAAGTCCCACGTTTGGGAGCTAAAGCATTTGAAC AAGCGGCAGGTTTCTTAAGAATTCCAGAAGGTAAAAATTTCCTTGACAACACCGGTGTTCACCCAGAATCTTATAAAGTG ACGGAACAACTTTTGGCGGAAATTTCCGCTGATAAACCTGTCAGTAACGAAGAATTGCTGACCAAACTTTCATCAGTAAA TATTCCTGAAATGGCTGAAAAACTTGGTCTTGGTCAGGAAACATTGACTGATATTATCAATGATTTACAAAAACCAGGCC GTGATTTGCGTGATAGTTTTGATGCCCCAATTTTAAGACAAGATGTTTTGTCAGCTGGAGATTTACAAATTGGTCAACAA CTTGAAGGTGTAGTTCGTAATGTTGTTGATTTCGGTGCCTTTATTGATATCGGAATTAAAAATGATGGCTTGGCACACGT TTCTGATTTGAGTAAATCTTTTGTCAAAAATCCAAGTGATGTTGTCGCTGTAGGGCAAATCGTAACGGTTTGGGTTAAAT CTCTCGATTTACAAAGAGGGAAAATTAATTTAACCTTAGTGAACCCACGAGAAAAATAA Protein sequence : MENVKKIAELLNIKNSQVEKVLELTAEGNTVPFIARYRKEATGSLDEVEIKKIIDEDNLLTKLSERKTAVLSKIEELGKL TDSLKAQILAAEKLTEVEDLYLPYKEKRRTKATIAKENGLFPLAQLIVKNSANLEEEAEKFVNENFTSPQKALEGAVDIL SEAISEDARLRSWLTGEIKNNSLLTSSLKKDAVDEKQVFQMYYEFSEKVSELPNYRVLALNRGEKLGILSVKFENNEDKI LRYFAARFAAQNNPMMQVAIKDAVKKKLIPAMERSIRTELTEKAEASAIEVFGENLKNLLLVAPLKGRVVMGFDPAYRTG AKLAIVDETGKLLMTTVIYPVKPANAGQIAQAKKDLAKFIREYGVNMIAIGNGTASRESESFVAEVLKENNFSDVYYVIV SESGASVYSASELAREEFPELTVEKRSAISIARRLQDPLAELVKIEPKAIGVGQYQHDVSEKKLTENLDFVVETVVNQVG VNVNTASPSLLSHVAGLNKSLAQNVVKYREENGALKTRAELKKVPRLGAKAFEQAAGFLRIPEGKNFLDNTGVHPESYKV TEQLLAEISADKPVSNEELLTKLSSVNIPEMAEKLGLGQETLTDIINDLQKPGRDLRDSFDAPILRQDVLSAGDLQIGQQ LEGVVRNVVDFGAFIDIGIKNDGLAHVSDLSKSFVKNPSDVVAVGQIVTVWVKSLDLQRGKINLTLVNPREK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 3e-138 | 46 |
