|
Name : recG (CVCAS_2330) Accession : YP_005869681.1 Strain : Lactococcus lactis CV56 Genome accession: NC_017486 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.6.1.- Position : 2363803 - 2365803 bp Length : 2001 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAAATTAACAGATTCAGTGCAATTTTTAAAAGGTGTGGGACCGAAATCTGTGGAAAATTTCCATAAGTTAGGAATTTT CACGGTTCAAGATTTATTGCTTTATTTCCCTTTTCGTTATGAAGATTTCGCAAGTCGTTCGGTTTTTGAACTTGTTGACG GAGAAAAAGCAACAATTATTGGAACGGTAGTGACACCAGCTAATGTCCAGTATTACGGATTTAAACGTAATCGACTTTCA TTTAAAATTAAAGAAGGTGAGGCCGTGGTTGCTGTCAGCTTTTTTAATCAACCTTATTTGGCTGACAAAGTGGAAGTTGG TAAGGAAATTGCAGTTTACGGAAAATGGGAGCAGGCAAAGCAACAACTGATGGGGATGAAAGTTGTGGCTCAGGTGGACG ATGGCTTAGAACCTGTTTATCATTTGACAGCTGGTATGAAACAAAGTCAATTGGTCAAAGTAATTCATCAGGTTTTTGAA TCAGATCTTCTATCAGAATTACCTGAGAACTTACCAGAATTTTTGATTAAAAAATATCGTCTGATGAACCGGCAAGAAGC CGTTTTGGCTATGCATTTTCCTGAAGATATGGAAGCTCATAAGCAGGCTTTACGTCGTGTAAAATTTGAAGAATTATTCA TGTTTCAGTTGAAATTACAGGCGTTAAAAAATAAAGAAAAATCGGGCCGAGCAGGATTAGAAGTTGTTTTTGAGCAAGGA GAAATTGATCAGAAGATTTCTGAATTACCTTTTGAACTGACAGGTGCTCAATTAAGCGCTTTGTCAGAGATTCTGACGGA TATGAAATCTCCTTATCACATGAATCGACTTTTGCAAGGTGATGTGGGTTCTGGTAAAACAGTTGTTGCTTCCCTTGCCA TGTACGCGGCTTGTTTGGCGAATTTTCAAGCAGCAATTATGGTACCAACGGAAATCCTTGCCCGTCAGCATTTTGCAAAC TTGAAAGCTCTTTTTCCAGAATTGCAAATTTCACTTTTGGTTTCGGGTTTGAAAGTGGCAGAGCGCCGCGAGATTTTGGC TGATTTAGTTAGTGGTCATACACATATGGTAGTTGGAACTCATGCACTAATTCAAGAAGGGGTAGATTTTTATAATTTGG GTCTTGTGATTACAGATGAACAACACCGTTTCGGAGTTAATCAGCGAAAAATTTTACGAGAAAAAGGGCAAAATCCAGAT GTTCTAATGATGACAGCTACACCCATTCCAAGAACGCTTGCGATTACGGCTTTTGGGGATATGGATGTTTCAATTATTGA TGAACTACCCAAGGGACGTCAACCCATTACTACAAGGTGGGTCAAACATGAACAATTTTCCGAAGTTTTAAGTTGGATAA AAGCAGAGGTTGCTAAAGATTCACAGGTTTATTTTATTTCACCTTTAATTGAGGAAAGTGAAACGTTGGACCTGAAAAAC GCAGAAGCTCTTTTTGCGGAATTAAATGAATACTTTGGATTATTTGCCAAAATTGGTCTTTTACATGGAAAAATGAAAAA TGATGAAAAAGACCAAATCATGCAAGAATTTAAGGCTAAAAAATTAGATATTTTGGTTTCAACAACAGTGATTGAAGTGG GAGTTGACGTTCCTAATGCTACCATTATGGTGATTATGGATGCTGACCGCTTTGGACTTTCGCAGCTTCACCAATTGCGT GGTCGTGTTGGTCGGGGAACAAAAAAATCTTATGCCATTTTAGTAGCAAATCCTAAGTCCGATTCAGGAAAACAACGGAT GAAAATTATGACAGAAACACAAAATGGTTTTATTTTAGCCGAAGAAGATTTGAAAATGCGTGGTTCTGGAGAGATTTTTG GACTTCGTCAGTCAGGACTTCCAGAATTTATTGCGGCTGATTTAGTCAATGATTATAATATTTTAGAAGTGGCTAGAAAA GAAGCAGTTGAAATTTTTAAAAATGCAGATGAGTTTCCTGATTTGATTGCTCAAGTTAATGTTGACGGGGGCTTTGATTG A Protein sequence : MKLTDSVQFLKGVGPKSVENFHKLGIFTVQDLLLYFPFRYEDFASRSVFELVDGEKATIIGTVVTPANVQYYGFKRNRLS FKIKEGEAVVAVSFFNQPYLADKVEVGKEIAVYGKWEQAKQQLMGMKVVAQVDDGLEPVYHLTAGMKQSQLVKVIHQVFE SDLLSELPENLPEFLIKKYRLMNRQEAVLAMHFPEDMEAHKQALRRVKFEELFMFQLKLQALKNKEKSGRAGLEVVFEQG EIDQKISELPFELTGAQLSALSEILTDMKSPYHMNRLLQGDVGSGKTVVASLAMYAACLANFQAAIMVPTEILARQHFAN LKALFPELQISLLVSGLKVAERREILADLVSGHTHMVVGTHALIQEGVDFYNLGLVITDEQHRFGVNQRKILREKGQNPD VLMMTATPIPRTLAITAFGDMDVSIIDELPKGRQPITTRWVKHEQFSEVLSWIKAEVAKDSQVYFISPLIEESETLDLKN AEALFAELNEYFGLFAKIGLLHGKMKNDEKDQIMQEFKAKKLDILVSTTVIEVGVDVPNATIMVIMDADRFGLSQLHQLR GRVGRGTKKSYAILVANPKSDSGKQRMKIMTETQNGFILAEEDLKMRGSGEIFGLRQSGLPEFIAADLVNDYNILEVARK EAVEIFKNADEFPDLIAQVNVDGGFD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 7e-102 | 45 |
