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Name : polA (CVCAS_2176) Accession : YP_005869529.1 Strain : Lactococcus lactis CV56 Genome accession: NC_017486 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.7.7 Position : 2203278 - 2205911 bp Length : 2634 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGAGAACAAGGACAGACTTTTACTAATTGATGGGTCATCGGTTGCCTTTCGGGCCTTTTTTGCGCTATATAATCAGAT AGATCGCTTTAAAGCGCCAAATGGGTTACATACTAATGCTATTTTTGCATTTCATACAATGCTTTCTTCATTGATGGAAC GGATTGAGCCCACACATGTTTTGATTGCATTTGATGCAGGAAAAACAACTTTTCGTACGGAAATGTTTGCTGACTATAAA GGTGGACGTTCAAAAACACCAGATGAATTTCGTGAGCAATTACCTTTTATCAAGGAAATGATTGAGAAATTGGGAATTCG TCATTATGAGTTAGCTAACTACGAGGCTGATGATATTATTGGGACTTTGGACAAAATGGCGGAAGCCCCAATTGTTAATT TTGATGTTACTATTGTGACGGGTGATAAGGATATGATTCAGCTTGTGGATGGAAATACGCGAGTTGAAATTTCTAAGAAG GGTGTTGCTGAGTTTGAGGAGTTTACACCTGATTATCTTTTAGAAAAAATGGGATTGACTCCAGCCCAATTTATTGATTT AAAAGCATTAATGGGCGATTCTTCTGATAACTACCCTGGCGTGACAAAAGTTGGCGAAAAAACTGGTCTTAAACTTTTAC AAGAGTTTGGATCGCTTGAAAATCTTTATGAAAATGTTGATTCTTTGAAAGCCAGCAAAATGAAAGAAAATCTAATTGCT GACAAAGAAATGGCCTTTTTGTCACAACAATTGGCAACGATAAATACGAAAGCTCCAATTGAAATTGGCTTAGATGATAC GCTTTTAAAAGGTAAAAAGGTTGATGAACTTAGTCAATTTTATGATGAAATGGGATTTGCTCAATTCAAAAGTAAATTAT TGGCTGAGGCTGGTGGAGAAGTTACTGACGAAAAAGTTGTTGACGAAATTGATTTTGAAATAGTTACTGATGGCTCTATC AGTGAAAAGGTAAATGCTGATGATTTCTTCTATTTGGAAACTTTAGGGGAAAATTATCATCGTGAGCAAATTGTGGCTTT TGCCTGGGGAAATGCTGAGAAAATTTATGTTTCTAAAAATATAGATTTACTGACAAAAATGAAGTTCCCTGAAAATACTT ATGATTTCAAGAAAAATCGGGTACTTTTGAGTCACTTGGATATCGAATTACCTTTGGTCAAATTTGATGCAATGCTTGCA AAATATCTAATTTCAACAACAGAAGATAATAAAATTTCGACGATTGCAAGACTTTTCAATAGCGGACATTTGGCAACGGA TGAAGAAATTTTTGGCAAAGGTACAAAAATTGCTTTACCTGATGATGCGGTTTTATTTGAACATTTAGCTCGTAAAATTA AAGTGCTTGCCTTGGCCAAAGAAAAAATGATGGCTGAATTGCTTGAAAATGAACAAGAGCATCTTTTATCTGACATGGAA TTACCATTAGCAGAAGTTTTAGCAAAAATGGAAATTACAGGGATTGCTGTCAGCCAAAATACACTGGAAGAAATTGGTGC GGAAAATGAAGAAAAATTGGCTTCTTTGACGCGTGAAATTTACGACTTGGCTGGTGAAGAATTTAATATTAATTCACCAA AACAGTTGGGTGTGATTTTATTTGAAAAATTACAGCTACCGGTTGGAAAGAAAACAAAAACAGGCTATTCAACGGCAGTG GATGTTTTAGAAGACTTAGCTGCTTTATCTCCCGTTGTAGCAAAAATTTTGGAATATCGTCAAATCAATAAAGTACAATC AACTTATGTGAAAGGTCTGATTCCTCAAATTGCAGATGATGGAAAAATTCATACACGTTATGTTCAAGATTTGACTCAAA CTGGACGTTTGAGCTCAGTTGACCCGAATTTACAAAATATTCCTGTTCGACTTGAGGAGGGACGAAAAATTCGTAAAGCT TTTGTCCCAAGCAAAGATTCACTTTTATTGAGTTCTGACTATTCACAAATTGAATTGCGGGTTTTGGCACATATTTCCGG GGATGAACATTTGATTGATGCCTTTAAACATGGAGCTGATATCCATACTTCAACGGCTATGCGTGTTTTCGGCATTGAAA AAGCAGAAGATGTGACTGCTAATGATCGTAGAAATGCTAAAGCAGTCAATTTTGGAGTAGTCTATGGAATTTCCGATTTT GGTTTAGCAAGAAATCTTGGAATTACAAGAAAAGATGCTAAAAATTACATTGAAACTTATTTTGAACGTTATCCTGGGAT TAAAACCTATATGGAAAATATTGTTCGCGAGGCACGAGACAAAGGTTTTGTTGAAACAATGAGTCACCGTCGTCGTAAGA TTCCAGATATTAATGCTCGTAATTTTAATGTTCGTGGTTTTGCAGAACGGACGGCTATTAATTCACCAATTCAAGGTTCG GCAGCTGATATCTTAAAAATTGCGATGATTAATTTGGATAAAGCTTTGAGTGCTCGTGATTTTAAATCAAAATTATTATT GCAAGTACACGATGAAATTATCCTTGATGTTCCTTTAGAGGAATTAGATGAAATTAAGGCCTTGGTAAAACAAACGATGG AAGAAGCGATTGAACTTGCTGTCCCATTAAAAGTGGATGAAAATACTGGTAAGACTTGGTATGAAGCTAAATAA Protein sequence : MENKDRLLLIDGSSVAFRAFFALYNQIDRFKAPNGLHTNAIFAFHTMLSSLMERIEPTHVLIAFDAGKTTFRTEMFADYK GGRSKTPDEFREQLPFIKEMIEKLGIRHYELANYEADDIIGTLDKMAEAPIVNFDVTIVTGDKDMIQLVDGNTRVEISKK GVAEFEEFTPDYLLEKMGLTPAQFIDLKALMGDSSDNYPGVTKVGEKTGLKLLQEFGSLENLYENVDSLKASKMKENLIA DKEMAFLSQQLATINTKAPIEIGLDDTLLKGKKVDELSQFYDEMGFAQFKSKLLAEAGGEVTDEKVVDEIDFEIVTDGSI SEKVNADDFFYLETLGENYHREQIVAFAWGNAEKIYVSKNIDLLTKMKFPENTYDFKKNRVLLSHLDIELPLVKFDAMLA KYLISTTEDNKISTIARLFNSGHLATDEEIFGKGTKIALPDDAVLFEHLARKIKVLALAKEKMMAELLENEQEHLLSDME LPLAEVLAKMEITGIAVSQNTLEEIGAENEEKLASLTREIYDLAGEEFNINSPKQLGVILFEKLQLPVGKKTKTGYSTAV DVLEDLAALSPVVAKILEYRQINKVQSTYVKGLIPQIADDGKIHTRYVQDLTQTGRLSSVDPNLQNIPVRLEEGRKIRKA FVPSKDSLLLSSDYSQIELRVLAHISGDEHLIDAFKHGADIHTSTAMRVFGIEKAEDVTANDRRNAKAVNFGVVYGISDF GLARNLGITRKDAKNYIETYFERYPGIKTYMENIVREARDKGFVETMSHRRRKIPDINARNFNVRGFAERTAINSPIQGS AADILKIAMINLDKALSARDFKSKLLLQVHDEIILDVPLEELDEIKALVKQTMEEAIELAVPLKVDENTGKTWYEAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 70 |
