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Name : amtB (CVCAS_1500) Accession : YP_005868863.1 Strain : Lactococcus lactis CV56 Genome accession: NC_017486 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ammonium transporter, Amt family Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1564413 - 1565654 bp Length : 1242 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGACACAGGCTCAATTGCATTTATTTTAATTTGTGCGGCATTGGTTTTTTTGATGACGCCTGCACTAGCATTTTTTTA TGGAGGGCTTGGACGCCGAAAAAATGTGTTAAACACAATGATGATGTCTCTCGCACCAATGGCTCTGGCTTCTATTTTAT GGATAATTATTGGCTTCTCATTTTCATTTTCAGGAAGCAATAGTTGGATTGGTGATTTCCACCATTTGTTTATGAATGGT GTGGATATGGCTAAAAATTCACTTTTCCCTGCTAATCATATTCCAGATGGCCTTTTTTCTGGTTTTCAAATGATGTTCTC GATTATCACAGTAGCTCTAATTACGGGATCTGTTGTTGGAAGAATGAGATTTACACCAATTTTGATTTTTATGACTGCTT GGTTAATTTTAGTTTATTATCCTTTGGCTCATATGGTTTGGGGCGGTGGATTTTTGGCTCAAATTCATGCGATTGACTTT GCGGGTGGAGATGTTGTTCATATTTCAAGTGGGGTGACAGGACTTGTACTTGCGTTAGTACTTGGAAAACGTCGAGATTA CGAACGTTTAGATTATCGTCCACATAATATTCCTTTTGTTGTTTTGGGCGCTGGTCTCCTATGGTTTGGTTGGTTCGGCT TTAATGCTGGGTCAGCGCTTGCTGCCAATGGTGTGGCAATTAACGCTTTTATGACGACTAATACAGCGGCAGCAGCAGCA ATGTTTTCATGGATGATTGTTGAAAAAATATTGATTGGTAAACCTTCAATTGTTGGTGCTTGTTCTGGTGCGGTAGTTGG TTTGGTGGCCATCACTCCAGGCGCTGGTTTTGTTTCTTTATGGTCGTCATTGATTATTGGTCTTTTGGTCAGTCCTTTGT CATACTTTATGATTTCTGTAGTAAAAAAGAAATTGGGATATGATGATGCTTTAGATGCTTTTGGTTGTCACGGTATTGGC GGGATGTTTGGCGGAATTATGACAGGAATTTTTGCAACGCCGGCTTTGGCACCAGAAAAAGGCTACGCTGGTTTAATCTA TGGCTCTGGGAAATTACTTTTGGCTAATGTGTCTGCGGTTGTCTTCACAGTTATTTTCACTGCTCTTGTGAGTTGGATCA TTATTAAAGTAATTGCCTTGTTTATGCCAATTCGTGTATCTGACCGTGCTGAAGCTATTGGACTTGACGAAAGTGAGCAC GAAGAAACTGCTTATCCAACCTTCTTAGGTTTGGATTCTTAA Protein sequence : MDTGSIAFILICAALVFLMTPALAFFYGGLGRRKNVLNTMMMSLAPMALASILWIIIGFSFSFSGSNSWIGDFHHLFMNG VDMAKNSLFPANHIPDGLFSGFQMMFSIITVALITGSVVGRMRFTPILIFMTAWLILVYYPLAHMVWGGGFLAQIHAIDF AGGDVVHISSGVTGLVLALVLGKRRDYERLDYRPHNIPFVVLGAGLLWFGWFGFNAGSALAANGVAINAFMTTNTAAAAA MFSWMIVEKILIGKPSIVGACSGAVVGLVAITPGAGFVSLWSSLIIGLLVSPLSYFMISVVKKKLGYDDALDAFGCHGIG GMFGGIMTGIFATPALAPEKGYAGLIYGSGKLLLANVSAVVFTVIFTALVSWIIIKVIALFMPIRVSDRAEAIGLDESEH EETAYPTFLGLDS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| BJAB0868_00291 | YP_008211617.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR26 | Protein | 9e-37 | 46 |
| BJAB07104_00287 | YP_008207752.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR25 | Protein | 9e-37 | 46 |
