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Name : busAB (CVCAS_1361) Accession : YP_005868733.1 Strain : Lactococcus lactis CV56 Genome accession: NC_017486 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycine betaine/carnitine/choline ABC transporter, permease and substrate-binding protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1414324 - 1416045 bp Length : 1722 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTGATTTAGCTATTGGACAAGTACCCATAGCAAACTGGGTGTCATCGGCAACAGATTGGATTACTAGTACTTTTAG TTCAGGATTTGATGTGATTCAAAAATCAGGAACGGTATTGATGAACGGTATTACAGGTGCTTTAACTGCTGTTCCATTCT GGTTGATGATTGCTGTTGTTACTATCCTTGCCATTTTGGTTTCAGGTAAAAAAATTGCCTTTCCTTTATTCACTTTCATC GGTCTTTCTTTAATTGCTAACCAGGGCTTATGGTCAGATTTGATGAGTACAATCACACTTGTCTTACTTTCAAGTTTATT GTCAATCATCATTGGAGTTCCTTTAGGGATTTGGATGGCCAAATCTGATTTAGTGGCTAAGATCGTTCAACCGATTTTGG ACTTTATGCAAACGATGCCTGGTTTCGTTTATTTGATTCCAGCGGTTGCATTCTTTGGAATAGGAGTTGTTCCTGGGGTA TTTGCATCTGTTATCTTTGCACTCCCACCAACAGTCAGAATGACTAACTTGGGAATTCGTCAAGTTTCAACGGAATTAGT TGAAGCGGCAGATTCATTTGGTTCAACTGCCCGTCAAAAGCTTTTTAAATTGGAATTTCCTTTGGCTAAAGGAACAATTA TGGCTGGTGTTAACCAAACGATTATGTTAGCTCTTTCTATGGTTGTTATCGCTTCTATGATTGGGGCGCCTGGCTTAGGT CGTGGTGTACTTGCAGCTGTTCAATCGGCTGATATTGGTAAAGGGTTTGTAAGTGGGATTTCATTAGTTATTTTGGCTAT TATTATTGACCGCTTTACACAAAAACTTAATGTTTCTCCTCTTGAAAAACAGGGAAATCCTACAGTTAAAAAATGGAAAC GTGGAATTGCCTTAGTTTCATTGTTAGCTTTAATTATTGGTGCCTTTTCAGGAATGTCTTTTGGGAAAACAGCCTCTGAT AAAAAAGTTGACTTAGTTTATATGAACTGGGATTCAGAAGTTGCATCAATCAATGTTTTGACTCAAGCGATGAAAGAACA CGGCTTTGATGTTAAAACGACAGCTTTAGATAATGCGGTGGCTTGGCAAACAGTAGCCAATGGTCAAGCAGATGGAATGG TTTCTGCTTGGTTACCAAACACGCATAAAACACAATGGCAAAAATATGGTAAATCTGTTGATTTGTTAGGTCCTAACCTT AAAGGGGCTAAAGTTGGGTTTGTTGTTCCAAGTTATATGAATGTTAATTCAATTGAAGATTTAACAAATCAAGCGAATAA AACAATCACAGGTATTGAACCAGGTGCAGGTGTAATGGCTGCTAGTGAAAAAACGCTTAATAGCTATGATAATCTTAAAG ATTGGAAACTTGTTCCTTCATCATCAGGTGCAATGACTGTAGCTCTTGGTGAAGCAATCAAACAACATAAAGATATTGTC ATTACTGGTTGGTCTCCTCATTGGATGTTTAACAAATATGATTTGAAATATTTGGCTGATCCAAAAGGAACAATGGGAAC TTCAGAAAATATTAATACCATTGTTCGTAAAGGTTTGAAGAAAGAAAATCCAGAAGCTTATAAAGTTTTAGATAAATTTA ATTGGACAACTAAGGATATGGAAGCTGTCATGCTTGATATTCAAAATGGTAAAACACCAGAAGAAGCTGCCAAAAATTGG ATTAAAGATCATCAAAAAGAAGTTGATAAATGGTTTAAATAA Protein sequence : MIDLAIGQVPIANWVSSATDWITSTFSSGFDVIQKSGTVLMNGITGALTAVPFWLMIAVVTILAILVSGKKIAFPLFTFI GLSLIANQGLWSDLMSTITLVLLSSLLSIIIGVPLGIWMAKSDLVAKIVQPILDFMQTMPGFVYLIPAVAFFGIGVVPGV FASVIFALPPTVRMTNLGIRQVSTELVEAADSFGSTARQKLFKLEFPLAKGTIMAGVNQTIMLALSMVVIASMIGAPGLG RGVLAAVQSADIGKGFVSGISLVILAIIIDRFTQKLNVSPLEKQGNPTVKKWKRGIALVSLLALIIGAFSGMSFGKTASD KKVDLVYMNWDSEVASINVLTQAMKEHGFDVKTTALDNAVAWQTVANGQADGMVSAWLPNTHKTQWQKYGKSVDLLGPNL KGAKVGFVVPSYMNVNSIEDLTNQANKTITGIEPGAGVMAASEKTLNSYDNLKDWKLVPSSSGAMTVALGEAIKQHKDIV ITGWSPHWMFNKYDLKYLADPKGTMGTSENINTIVRKGLKKENPEAYKVLDKFNWTTKDMEAVMLDIQNGKTPEEAAKNW IKDHQKEVDKWFK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 9e-152 | 60 |
