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Name : HN6_00820 (HN6_00820) Accession : YP_005863883.1 Strain : Lactobacillus salivarius CECT 5713 Genome accession: NC_017481 Putative virulence/resistance : Virulence Product : UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase / UDP-D-quinovosamine 4-dehydrogenase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.1.1.- Position : 1013194 - 1015083 bp Length : 1890 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGATTCTATTAACAAGATAAAATCACTTCCTCAATGGGTGTTTCGAGCATTCTATCTATCTTTGTATGACTTGATAAC AGTCAATTTCGCTTATTTTATAGTGTTATGGTTACACTATAACTTGAGATATACAACTATCCCCTTAAAGTATTTACAAG CATATTTAAGTTTTGTACCAGTATACTCTTTATTTACTTTGAGTGTTTTTTATTTTTTGAAATTATATAAGAGTATTTGG AAATACGTTAGTCTAAGTGAAATGAACCGAATATTATTAGCGACAATTGTAACAGCGATTTTTCATGGAATCGGTATTAC CGTTTTATGCACAAAAATGCCTATTTCCTATTATTTAATGGGACCGCTATTTCAATTTATGTTTACCGTGAGTGTAAGGT TTGCATATCGTTTTATTAATTTAGTGAGAAGACGAAAACAAAGAAATGAAAATGCTAAATATAATTCTTTAATTATTGGA GCTGGTTCAGCAGGTCAAATTATTATCAAAGAACTGGAAAATTCATCAGTAGTACAATCTGTTCCTAAATGTGTAATTGA TGATGATCCAAACAAATGGGGWAGAATGTTGAAAAATATTCCAATTATAGGTGGACGTGAGAAAATCATTGAAGCAGTTC AAAAATTTGATATCACACAAATTATTTTTACAATACCTTCTGCAAGTGCTAAAGATAAAAGAGAGATTTTGAATATCTGT AAGGAAACAGACTGTAAGTTATTGACATTACCAGGGGTATATCAATTATTAAACGAGAAAGTTTTCTTACAACATTTAAA GCCAGTAGCGGTTGAAGATTTATTAGGAAGAGAACCAATAAAGGCAGATTTAGGCCAAATCAAGCAACAAATTCAAGGTA AAGTTGTATTGATAACTGGTGGTGGAGGCTCAATTGGTTCAGAGCTTTGTCGCCAGATTGCGACCTATGATCCTGAGCAA TTAATTGTCTTTGATATTTATGAGAATAATGCTTATAGTATTGAACAAGAATTAAAAAGAAACTATCCTAATTTGAATTT GAAAGTTTTAATTGGATCAGTTCGAGATCAAAAAAGAGTAGATGATATTTTTTCGAGTTATCGACCAGATATTGTTTATC ACGCTGCTGCCCATAAGCATGTGCCATTAATGGAAGGCAGTCCTAATGAAGCAGTTAAAAACAATGTTGTTGGTACTTAT AACACTTCTAAAGCAGCCTTAAAGCACAATGCTGAACGATTTGTACTAATTAGTACAGATAAGGCAGTTAATCCAACAAA TGCAATGGGAGCTAGCAAGCGTATTTGTGAGATGATTATTCAAATGATGGATAAAGACAGTCGTAATAGCAAGAAGCGAA CACAGTTTGTAGCAGTTAGATTTGGAAATGTTCTAGGAAGTAATGGTTCTGTGATTCCTTTATTCAAGAAACAAATTGCA GCCGGTGGTCCAGTTACAGTAACTCATCCTGATATTATTCGATATTTCATGACGATTTCAGAAGCAGTTGGGTTGGTTTT GCAAGCTGGAGCATATGCGGCTGGTGGAGAAATATTTGTTTTAGATATGGGACAACCAATTAAAATTGATACTTTAGCAC GAAACTTAATTAAGTTATCAGGATTGCATCCAGATGAAGATATCAAAATTAAATATATTGGTTTGCGTCCAGGAGAAAAA CTATATGAAGAAAAGTTAATGGCCGAAGAAGGATTACAAAAGACAGAAAATCAACTTATCTATATTGGAAAACCAATTCC ATTTGATGAGAAAAAATTCTTAAAAGATTTACAGAGTCTAATTCAAAATAGTCAAGAGAATCCTAAGAATATTGAAGCTC AGATGCAACAAATTGTACCTAACTTTAAGTTCCAGGAGGTGGTAGGATGA Protein sequence : MDSINKIKSLPQWVFRAFYLSLYDLITVNFAYFIVLWLHYNLRYTTIPLKYLQAYLSFVPVYSLFTLSVFYFLKLYKSIW KYVSLSEMNRILLATIVTAIFHGIGITVLCTKMPISYYLMGPLFQFMFTVSVRFAYRFINLVRRRKQRNENAKYNSLIIG AGSAGQIIIKELENSSVVQSVPKCVIDDDPNKWGRMLKNIPIIGGREKIIEAVQKFDITQIIFTIPSASAKDKREILNIC KETDCKLLTLPGVYQLLNEKVFLQHLKPVAVEDLLGREPIKADLGQIKQQIQGKVVLITGGGGSIGSELCRQIATYDPEQ LIVFDIYENNAYSIEQELKRNYPNLNLKVLIGSVRDQKRVDDIFSSYRPDIVYHAAAHKHVPLMEGSPNEAVKNNVVGTY NTSKAALKHNAERFVLISTDKAVNPTNAMGASKRICEMIIQMMDKDSRNSKKRTQFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIA AGGPVTVTHPDIIRYFMTISEAVGLVLQAGAYAAGGEIFVLDMGQPIKIDTLARNLIKLSGLHPDEDIKIKYIGLRPGEK LYEEKLMAEEGLQKTENQLIYIGKPIPFDEKKFLKDLQSLIQNSQENPKNIEAQMQQIVPNFKFQEVVG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cap1D | AAA64643.1 | type 1 capsule synthesis gene | Virulence | SCCcap1 | Protein | 8e-87 | 45 |
| SSP0063 | YP_300153.1 | capsular polysaccharide biosynthesis protein | Not tested | SCC15305cap | Protein | 2e-86 | 45 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| HN6_00820 | YP_005863883.1 | UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase / UDP-D-quinovosamine 4-dehydrogenase | VFG1300 | Protein | 2e-89 | 42 |
