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Name : polA (HN6_00450) Accession : YP_005863519.1 Strain : Lactobacillus salivarius CECT 5713 Genome accession: NC_017481 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.7.7 Position : 537146 - 539824 bp Length : 2679 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGTAGAAGAAAAAAATAAATTATTATTAATAGATGGAAATAGTGTCACATTTAGAGCTTTTTTTGCTTTGCACAATTC TTTAAGTAGATTTGTAAATCATGAAGGATTACATACTAATGCAATTTATGGATTTAAGAATATGTTAGATAGCATCTTAA CTAAGGTTAACCCTACACATATATTAGTAGCATTTGATGCTGGTAAAACTACTTTTAGAACTGAAAAATTCACTGATTAT AAAGGTGGGAGAGCTAAAACTCCTTCAGAATTATCAGAGCAATTTCCAGAAATAAAAAATTTACTAGAAGGATATAGAAT AAAAACTTACGAGCTAAAAAATTATGAGGCTGATGATATTATCGGAACATTAGCTGCAAAAGCTGAAAAGAAAAATTATG ATGTTGTAGTTGTTACAGGAGATAGGGATCTAACGCAATTAACAACTGACAAAATAACAGTTGCTGTAACAGTTAAGGGT GTTAGTGAAATTGAAGAATATACTCCAAGTCATGTTGAAGAAAAAATAGGTTTAATCCCTGAACAAATCGTTGATATGAA AGCTTTAGTGGGGGATACTTCTGATAATTATCCTGGGGTTACAAAAATTGGTGAGAAGACAGCAATTAAATTGTTGAAAC AATATGGTACTTTAGATGGAATCTATAAAAATATAGATGAAATGAAAAAGTCTAAGATGAAAGAAAATTTAATCAGAGAA AAGGAAATTGCTTATTTATGTCAAGATTTAGCAGAAATTAGGAAAGACGCTCCAGTTGAAATAGATTTAGAAGAAACTGA ATGGACTGGGAAAAATATTGAGAAACTAGTAACGTTATATCAAAAATTAGATTTTCGAAAGTTTTTATCACAATTAAAGG CTGAAAGTAGTGAACAATTAGATATTTTTGAATCTAAAAGTAATATAGAATTTACTGAATTAACAGAAGAAAATTTAGAT GATATAAATGTTAGTGATAATGACGAAATAGTATTTAATTTAGAAATAGATGGAGAAAATTATCATACAGCTGAAATTAT TGGTTTTTCTATTAAAATAGGTGATAAATATTTAGTGTCGGATGATATAGATTTACTAAAGAAAAAACAAATCAAGAATT TGTTGGAATCAGATGAAGTTGAAGTAGATTTATTTGATGGCAAAAGACAATATGTTGGCTTAAATAGATTAGGTGTTACT TTATCGAAAATTAATTTTGATTTGTTACTTGTATCATACTTGCTAGATAATAGTGAAAATAGTAATGATCTAGGTCTGTT GGCACAACAGCACGAATATTATGATGTAGAATCTGATGAGCAAATATATGGTAAAGGTGCTAAACATGCTGTGCCAAAAG ATAAAGAAGTTTTATTTGAACATTTAGTGAGAAAAGTAAAAGCGATAAATAATTTAAAAGAAAAATTATTTAATGAGTTA GAAGAAAATCAGCAACTAGATCTATATACAAAAATAGAACGTCCATTGTCGATTGTATTAGCAAATATGGAAATTGCGGG CGTAAAAGTGGATAGTAATAGACTAGAAACTATGCAAAGTGAATTGAAAGAACGATTAAGTGAACTAGAGCAGGAAATAT ATAATGAAGCTGGAGAAGAATTTAACTTAAATTCACCAAAACAATTAGGTGTTATATTGTTTGAAAAATTAAAGTTACCA GTTATTAAAAAGACAAAAACAGGATATTCAACAGCAGTAGGTGTATTAGAGCAACTTAGAGGTATGTCCCCAATTGTTGA TAATATCTTACAATATCGTCAATTAGCTAAAATACAATCTACATATATTGAGGGATTGTTAAAAGTAGTTTCTAAGAAAG ATGGGAAGGCCCATACAAGATATACTCAAACCTTAACTTCAACGGGAAGACTATCTTCAGTTGATCCAAATTTACAAAAT ATTCCAGTTCGTTTAGAAGAAGGTCGAAAAATACGTCAAGCTTTTGTTCCAAGTCATCCAGGATGGGAAATATTTTCTTC TGATTATTCACAGATTGAATTACGTGTATTGGCACATATTTCAAAAGACAAAAATATGCAAGAGGCTTTTAAGGAAGGCA TGGATATTCACGCAAGTACAGCGATGAGAATTTTTAATGTAGATAGTCCAGATGAAGTAACTCCTAATATGAGAAGACAA GCTAAAGCTGTTAATTTTGGAATTGTATATGGTATTAGCGATTACGGTTTATCACAAAATATAGGAATATCAAGAAAACA GGCTAAACAATTTATAGATACCTATTTAGATACATTTTCAGGTGTAAAAGATTATATGGAAAAAATTGTTGAATTTGCTA AAGAAAATGGATATGTAGAAACTATTTTTAACAGAAGAAGATATCTACCTGATATAAAGAGTCGTAATTTTAATTTACGC TCTTTTGCTGAAAGAACAGCTATGAATTCACCAATTCAGGGTAGCGCGGCTGATATTATTAAGGTTGCGATGATTAATAT GCAAGAAATGTTAAAAGAAAAGAATTTGCAAGCAAAAATGCTACTTCAAGTACATGACGAATTAATCTTTGAAGCACCAA CAAAAGAAATTCCATTATTAGAGGATATGGTTCCAAAAGTTATGGATTCAGCAGTTAAGCTAGATGTACCGTTAAAAGTT GAAAGTAAGCATGGACAAACTTGGTTTGATACGAAGTAG Protein sequence : MVEEKNKLLLIDGNSVTFRAFFALHNSLSRFVNHEGLHTNAIYGFKNMLDSILTKVNPTHILVAFDAGKTTFRTEKFTDY KGGRAKTPSELSEQFPEIKNLLEGYRIKTYELKNYEADDIIGTLAAKAEKKNYDVVVVTGDRDLTQLTTDKITVAVTVKG VSEIEEYTPSHVEEKIGLIPEQIVDMKALVGDTSDNYPGVTKIGEKTAIKLLKQYGTLDGIYKNIDEMKKSKMKENLIRE KEIAYLCQDLAEIRKDAPVEIDLEETEWTGKNIEKLVTLYQKLDFRKFLSQLKAESSEQLDIFESKSNIEFTELTEENLD DINVSDNDEIVFNLEIDGENYHTAEIIGFSIKIGDKYLVSDDIDLLKKKQIKNLLESDEVEVDLFDGKRQYVGLNRLGVT LSKINFDLLLVSYLLDNSENSNDLGLLAQQHEYYDVESDEQIYGKGAKHAVPKDKEVLFEHLVRKVKAINNLKEKLFNEL EENQQLDLYTKIERPLSIVLANMEIAGVKVDSNRLETMQSELKERLSELEQEIYNEAGEEFNLNSPKQLGVILFEKLKLP VIKKTKTGYSTAVGVLEQLRGMSPIVDNILQYRQLAKIQSTYIEGLLKVVSKKDGKAHTRYTQTLTSTGRLSSVDPNLQN IPVRLEEGRKIRQAFVPSHPGWEIFSSDYSQIELRVLAHISKDKNMQEAFKEGMDIHASTAMRIFNVDSPDEVTPNMRRQ AKAVNFGIVYGISDYGLSQNIGISRKQAKQFIDTYLDTFSGVKDYMEKIVEFAKENGYVETIFNRRRYLPDIKSRNFNLR SFAERTAMNSPIQGSAADIIKVAMINMQEMLKEKNLQAKMLLQVHDELIFEAPTKEIPLLEDMVPKVMDSAVKLDVPLKV ESKHGQTWFDTK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 54 |
