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Name : treC (HN6_01260) Accession : YP_005864300.1 Strain : Lactobacillus salivarius CECT 5713 Genome accession: NC_017481 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose-6-phosphate hydrolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.2.1.93 Position : 1571523 - 1573184 bp Length : 1662 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATAAAACTTGGTCAAAAAGTAATTTATCAAATTTATCCTAAGTCATTTTACGATTCTAATAATGATGGTTTTGGAGA TTTGAAAGGAATTATTGCTAAGATTGACTATTTGAAGAAACTTAATATTGATATGATTTGGTTCAATCCTTTTTATGTTT CTCCGCAAAATGATAATGGATATGATATCGCTGATTACTATAAGATAGATGAACGTTTTGGTACTATGGAAGATTTTGAA GAAATGGTAGCCAAGCTAAAAGAAGCTAACATTGGTGTAATGTTGGATATGGTGTTAAATCACTGTTCCACTGAACATGA ATGGTTCCAAAAAGCTTTGGCTGGCGATGAAAAGTATCAAAAATATTTCTACCTTCGTCCTGCTAAAGAAGATGGTTCAT TACCAACTAACTGGCAATCTAAATTTGGTGGTCCTGCATGGGAAAAATTTGGCGATACAGATTTATACTATCTTCATTTA TATGATAAGACTCAAGCTGATTTAGACTGGCACAATCCAGACGTACGTGCTGAAGCAGCTAAAATCGTCAACTTCTGGAA AGAAAAAGGTGTTGCTGGCTTTAGATTTGACGTGCTTAATGTAATTGGAAAAGATGAAGTATTGGTAGATTCTGTAGATC CAGATCATGAAAAACCTCTATATACTGATACTCCAGTTGTTCATAAGTATATCAAAGAACTTAACCGTAATACTTTTGGA ACAGATCCTGAAATCGTAACTGTTGGGGAAATGTCATCAACAACTATCCCTAACTCGATTGAATATACAAATCCAGATGA ACATGAATTATCTATGGTCTTCACTTTCCATCATTTGAAAGTTGATTACGATAACGGTGAAAAATGGAGCAAGGTTCCAT TTAACTTTATGGAATTAAAATCCCTATTATCTACTTGGCAAACAGAAATGGATAAAGGCAATGGCTGGAATGCATTATTC TGGAACAATCATGATCAACCTTGGGCCTTGAATCGTTTTGGTGATCCCGTAAACTACCGTGAAAAGTCAGCTGAAATGCT AGCATCTGCCCTACATTTACTTCGTGGTACTCCTTATATCTACATGGGTGAAGAATTAGGTATGATGGATCCTCATTATA AGTCTATTGACGACTATGTTGACGTTGAAGCTTTAAACGGCTATCAAATGTTACTTGATAAGGGTGTAGACAAGGATCGT GCTTTTGAAATTGTTGTTTCCAAGTCACGTGATAACTCTCGTGTGCCTATGCATTGGGATGATAGTAAATATGCTGGCTT TAGTGAAGCAAAACCTTGGTTAATGCCTACTGATCAAGATGAAATTAATGTAGAAAAAGAATTAGCTAGTGGCGAAATCT TTAATCACTATCAAGAATTGATTAAATTAAGAAAAACCGAACCACTTATCTACGCTGGTCATTTCAAAGAATTATTGGCA GATGATAAACAAGTCTTTGCTTATGAACGTTATCTAGATGATTCATCTGAGAAATTAGTTGTTTTCAATAACTTCTATGG CACTGAAGTTACAGTTGATTTACCAGCTGAATATCAAGATAAAGAATGCACAACACTTATTGATAATTACCAAAATGAGA TTCAAAAGACTGCAAAACAAATTACACTACAACCTTATGAATCTTTAGCAATTAAAATTTAA Protein sequence : MIKLGQKVIYQIYPKSFYDSNNDGFGDLKGIIAKIDYLKKLNIDMIWFNPFYVSPQNDNGYDIADYYKIDERFGTMEDFE EMVAKLKEANIGVMLDMVLNHCSTEHEWFQKALAGDEKYQKYFYLRPAKEDGSLPTNWQSKFGGPAWEKFGDTDLYYLHL YDKTQADLDWHNPDVRAEAAKIVNFWKEKGVAGFRFDVLNVIGKDEVLVDSVDPDHEKPLYTDTPVVHKYIKELNRNTFG TDPEIVTVGEMSSTTIPNSIEYTNPDEHELSMVFTFHHLKVDYDNGEKWSKVPFNFMELKSLLSTWQTEMDKGNGWNALF WNNHDQPWALNRFGDPVNYREKSAEMLASALHLLRGTPYIYMGEELGMMDPHYKSIDDYVDVEALNGYQMLLDKGVDKDR AFEIVVSKSRDNSRVPMHWDDSKYAGFSEAKPWLMPTDQDEINVEKELASGEIFNHYQELIKLRKTEPLIYAGHFKELLA DDKQVFAYERYLDDSSEKLVVFNNFYGTEVTVDLPAEYQDKECTTLIDNYQNEIQKTAKQITLQPYESLAIKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-106 | 43 |
