Gene Information

Name : nrdA (HN6_01016)
Accession : YP_005864077.1
Strain : Lactobacillus salivarius CECT 5713
Genome accession: NC_017481
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ribonucleoside-diphosphate reductase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 1.17.4.1
Position : 1265051 - 1267222 bp
Length : 2172 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
TTGAGTCTAAAGGACATTGATATTAGTAAAGTTACTTATTTTGATTTAAATAATGAAATAAATATTCCTATAAATGGTCA
AATCCAATTAGGAAAAGATAAAGAGGCTCTTGAAGCCTTTTTAAATGAAAATGTTAAGCCTAATACTAAACAATTTTCTT
CAATTAAGGAACGAATTAATTATTTAATTCAAAATAACTACTATGAAGAAGAATTTATTTCTAAATATTCATTTGAATTT
ATCGAAAAATTATATGATTACCTAAAAAAAGAAGATTTTCATTTTAAAACTTTTATGGCAGCATATAAATTTTATGCTCA
ATATGCCTTAAAAACTGACGATAATGCCTACTATTTAGAAAACTTTATAGATAGAGTTGCTACTAACGCTCTTTATTTTG
GTGATGGAGATGAAAAATTAGCTTTAGAATTAGCCGATGAATTAATCCATCAAAGATATCAACCTGCTACTCCAAGTTTC
TTGAATGCCGGTCGTAAACGCCGTGGAGAACTGGTATCTTGTTTCTTAATCCAAATGACTGATGACATGAATTCAATCGG
AAGAAATATTAATTCTGCCCTACAATTATCACGTATTGGCGGTGGTGTTGGTATTAATCTTTCTAATTTACGCGGTGCTG
GTGCTCCTATTAAAGGAATTCATGGAGCTGCATCTGGTGTCGTTCCTGTTATGAAATTACTTGAAGATAGCTTTACATAT
TCAAACCAACTTGGTCAACGTCAAGGTGCTGGTGCTGTTTATTTAAATGTCTTCCATCCTGATATAGAAGCATTTTTATC
TGCTAAAAAAGAAAATGCTGATGAAAAAATTCGTGTAAAGACCCTTTCATTAGGATTAGTCGTTCCAGATAAATACTACG
AATTAGTAGCTAAAAATGAAGATATGTATCTTTTTGATCCTTGGGGAGTTGAACGTGTTTACCACAAACCATTTTCTTAT
GTGGATATTACTAAAGAATATGATAATATGGTTGCTAATCCAAATATTCCTAAGAAAGTTATCAAAGCTCGTGATTTGGA
AGAACAAATATCTAAGCTACAACAAGAATCTGGTTATCCTTATGTTATTAACATAGATACTGCTAATAGAGTAAATCCTA
TTTCTGGAAAGATTGTCATGAGTAATCTATGTTCCGAAATTTTACAAGTTCAACGTGCTTCAGTAATTAATAATCGTCAA
GAATATGAAGTTCTGGGGACAGATATTAGCTGTAACTTAGGTTCTACTAATATTGTTAACCTTATGGCATCACCTAACTT
CGGTAAATCTGTTGAAGTTATGACTAGAGCTTTAACTTTTGTTACTGATAAATCAGATATTGATGTTGTTCCATCAATCC
AACACGGAAATCGATTAGCTCATACTATCGGTTTAGGTGCTATGGGGTTACACGCTTACCTTGCTAGGAATCAAATTGAA
TACGGATCACCTGAAGCTCTTGAATTTACTAGTGTATATTTCATGTTACTAAACTATTGGACTTTAGTAGCTTCAAACAA
AATTGCAAAAGAAAGAAAAGTTACTTTTGATAATTTTGAAAATAGTAAATATGCTGACGGTAGTTACTTTGATACTTATT
TAAATCAAGAATTTGCACCAAAAAATGCACGTGTTAAAGAATTATTTGATGGTATCTTTATACCTACAAAATCCGACTGG
ACTAGTCTTAAAGAAAATGTTATGAAGTACGGCTTGTATCATCAAAACAGATTAGCTGTAGCACCTAATGGCTCTATTTC
ATATATTAATGACACAACAGCTAGTCTACATCCTATCATCAATAGAATTGAAGAACGTCAAGAAAGAAAAATTGGAAAGA
TTTACTATCCTGCACCTTACTTGTCAAATGAAACTTTACCATATTACAAGTCAGCATACGATACTGATATGCGTAAAGTT
ATCGATACTTATGCAGCTGCTCAACAACATGTTGATCAAGGTATGAGTCTAACATTATTTATGCGTTCAACAATTCCAAC
AGGTTTATATGAGTGGAAGAATGGAAGAACTGATAAAATGACAACTAGAGATTTATCTATTCTTCGCAATTATGCACACT
ATAAAGGTGTTAAATCTATTTACTATGTACGTACTTTTACTGATGATGCATCTGAAGTTGGTGCAAATGAATGCGAAAGT
TGTTCAATTTAG

Protein sequence :
MSLKDIDISKVTYFDLNNEINIPINGQIQLGKDKEALEAFLNENVKPNTKQFSSIKERINYLIQNNYYEEEFISKYSFEF
IEKLYDYLKKEDFHFKTFMAAYKFYAQYALKTDDNAYYLENFIDRVATNALYFGDGDEKLALELADELIHQRYQPATPSF
LNAGRKRRGELVSCFLIQMTDDMNSIGRNINSALQLSRIGGGVGINLSNLRGAGAPIKGIHGAASGVVPVMKLLEDSFTY
SNQLGQRQGAGAVYLNVFHPDIEAFLSAKKENADEKIRVKTLSLGLVVPDKYYELVAKNEDMYLFDPWGVERVYHKPFSY
VDITKEYDNMVANPNIPKKVIKARDLEEQISKLQQESGYPYVINIDTANRVNPISGKIVMSNLCSEILQVQRASVINNRQ
EYEVLGTDISCNLGSTNIVNLMASPNFGKSVEVMTRALTFVTDKSDIDVVPSIQHGNRLAHTIGLGAMGLHAYLARNQIE
YGSPEALEFTSVYFMLLNYWTLVASNKIAKERKVTFDNFENSKYADGSYFDTYLNQEFAPKNARVKELFDGIFIPTKSDW
TSLKENVMKYGLYHQNRLAVAPNGSISYINDTTASLHPIINRIEERQERKIGKIYYPAPYLSNETLPYYKSAYDTDMRKV
IDTYAAAQQHVDQGMSLTLFMRSTIPTGLYEWKNGRTDKMTTRDLSILRNYAHYKGVKSIYYVRTFTDDASEVGANECES
CSI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1481 YP_001800875.1 ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Not tested Not named Protein 7e-178 54