Name : nrdA (HN6_01016) Accession : YP_005864077.1 Strain : Lactobacillus salivarius CECT 5713 Genome accession: NC_017481 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleoside-diphosphate reductase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.17.4.1 Position : 1265051 - 1267222 bp Length : 2172 bp Strand : + Note : - DNA sequence : TTGAGTCTAAAGGACATTGATATTAGTAAAGTTACTTATTTTGATTTAAATAATGAAATAAATATTCCTATAAATGGTCA AATCCAATTAGGAAAAGATAAAGAGGCTCTTGAAGCCTTTTTAAATGAAAATGTTAAGCCTAATACTAAACAATTTTCTT CAATTAAGGAACGAATTAATTATTTAATTCAAAATAACTACTATGAAGAAGAATTTATTTCTAAATATTCATTTGAATTT ATCGAAAAATTATATGATTACCTAAAAAAAGAAGATTTTCATTTTAAAACTTTTATGGCAGCATATAAATTTTATGCTCA ATATGCCTTAAAAACTGACGATAATGCCTACTATTTAGAAAACTTTATAGATAGAGTTGCTACTAACGCTCTTTATTTTG GTGATGGAGATGAAAAATTAGCTTTAGAATTAGCCGATGAATTAATCCATCAAAGATATCAACCTGCTACTCCAAGTTTC TTGAATGCCGGTCGTAAACGCCGTGGAGAACTGGTATCTTGTTTCTTAATCCAAATGACTGATGACATGAATTCAATCGG AAGAAATATTAATTCTGCCCTACAATTATCACGTATTGGCGGTGGTGTTGGTATTAATCTTTCTAATTTACGCGGTGCTG GTGCTCCTATTAAAGGAATTCATGGAGCTGCATCTGGTGTCGTTCCTGTTATGAAATTACTTGAAGATAGCTTTACATAT TCAAACCAACTTGGTCAACGTCAAGGTGCTGGTGCTGTTTATTTAAATGTCTTCCATCCTGATATAGAAGCATTTTTATC TGCTAAAAAAGAAAATGCTGATGAAAAAATTCGTGTAAAGACCCTTTCATTAGGATTAGTCGTTCCAGATAAATACTACG AATTAGTAGCTAAAAATGAAGATATGTATCTTTTTGATCCTTGGGGAGTTGAACGTGTTTACCACAAACCATTTTCTTAT GTGGATATTACTAAAGAATATGATAATATGGTTGCTAATCCAAATATTCCTAAGAAAGTTATCAAAGCTCGTGATTTGGA AGAACAAATATCTAAGCTACAACAAGAATCTGGTTATCCTTATGTTATTAACATAGATACTGCTAATAGAGTAAATCCTA TTTCTGGAAAGATTGTCATGAGTAATCTATGTTCCGAAATTTTACAAGTTCAACGTGCTTCAGTAATTAATAATCGTCAA GAATATGAAGTTCTGGGGACAGATATTAGCTGTAACTTAGGTTCTACTAATATTGTTAACCTTATGGCATCACCTAACTT CGGTAAATCTGTTGAAGTTATGACTAGAGCTTTAACTTTTGTTACTGATAAATCAGATATTGATGTTGTTCCATCAATCC AACACGGAAATCGATTAGCTCATACTATCGGTTTAGGTGCTATGGGGTTACACGCTTACCTTGCTAGGAATCAAATTGAA TACGGATCACCTGAAGCTCTTGAATTTACTAGTGTATATTTCATGTTACTAAACTATTGGACTTTAGTAGCTTCAAACAA AATTGCAAAAGAAAGAAAAGTTACTTTTGATAATTTTGAAAATAGTAAATATGCTGACGGTAGTTACTTTGATACTTATT TAAATCAAGAATTTGCACCAAAAAATGCACGTGTTAAAGAATTATTTGATGGTATCTTTATACCTACAAAATCCGACTGG ACTAGTCTTAAAGAAAATGTTATGAAGTACGGCTTGTATCATCAAAACAGATTAGCTGTAGCACCTAATGGCTCTATTTC ATATATTAATGACACAACAGCTAGTCTACATCCTATCATCAATAGAATTGAAGAACGTCAAGAAAGAAAAATTGGAAAGA TTTACTATCCTGCACCTTACTTGTCAAATGAAACTTTACCATATTACAAGTCAGCATACGATACTGATATGCGTAAAGTT ATCGATACTTATGCAGCTGCTCAACAACATGTTGATCAAGGTATGAGTCTAACATTATTTATGCGTTCAACAATTCCAAC AGGTTTATATGAGTGGAAGAATGGAAGAACTGATAAAATGACAACTAGAGATTTATCTATTCTTCGCAATTATGCACACT ATAAAGGTGTTAAATCTATTTACTATGTACGTACTTTTACTGATGATGCATCTGAAGTTGGTGCAAATGAATGCGAAAGT TGTTCAATTTAG Protein sequence : MSLKDIDISKVTYFDLNNEINIPINGQIQLGKDKEALEAFLNENVKPNTKQFSSIKERINYLIQNNYYEEEFISKYSFEF IEKLYDYLKKEDFHFKTFMAAYKFYAQYALKTDDNAYYLENFIDRVATNALYFGDGDEKLALELADELIHQRYQPATPSF LNAGRKRRGELVSCFLIQMTDDMNSIGRNINSALQLSRIGGGVGINLSNLRGAGAPIKGIHGAASGVVPVMKLLEDSFTY SNQLGQRQGAGAVYLNVFHPDIEAFLSAKKENADEKIRVKTLSLGLVVPDKYYELVAKNEDMYLFDPWGVERVYHKPFSY VDITKEYDNMVANPNIPKKVIKARDLEEQISKLQQESGYPYVINIDTANRVNPISGKIVMSNLCSEILQVQRASVINNRQ EYEVLGTDISCNLGSTNIVNLMASPNFGKSVEVMTRALTFVTDKSDIDVVPSIQHGNRLAHTIGLGAMGLHAYLARNQIE YGSPEALEFTSVYFMLLNYWTLVASNKIAKERKVTFDNFENSKYADGSYFDTYLNQEFAPKNARVKELFDGIFIPTKSDW TSLKENVMKYGLYHQNRLAVAPNGSISYINDTTASLHPIINRIEERQERKIGKIYYPAPYLSNETLPYYKSAYDTDMRKV IDTYAAAQQHVDQGMSLTLFMRSTIPTGLYEWKNGRTDKMTTRDLSILRNYAHYKGVKSIYYVRTFTDDASEVGANECES CSI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 7e-178 | 54 |