Gene Information

Name : LJP_0602 (LJP_0602)
Accession : YP_005861883.1
Strain : Lactobacillus johnsonii DPC 6026
Genome accession: NC_017477
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 662266 - 663804 bp
Length : 1539 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGAGCGATACAGTACAAAAAAAGAAGAAACATCAATTTCCAACAGCGTATACAGTTATTATTATCGTTTTATTATTGGT
GCAAATTTTAACGTTTTTTATACCATCGGGTAATTATGCAACGCTTGAATATGATCAACCAAGTAAAGAGTTTGTAATTA
CGAAACCAAATGGTAGCAAGCATAAAGAAGCAGCAACCCAAAAAACTTTAGACAAATATAAAGTTAAGATCGATGTTAAA
AAGTTTACTAGTGGAACGATCTATAAACCCGTAGCTATTCCTGATTCCTATGAAAAAATTAATCAGAAAAAGCCAGGACT
TGGTGGAGCGATTTATCAATTCCTTTCTTCTCAGGTAAACGGGATTGCTCAAAGTATTGATATTATTGCTTTCGTTTTGA
TTCTAGGTGGTTGTATTGGAGTTGTTCATGCAAATGGTGCAATTGATGCCGGAATGCAGGCACTTTCTAAAAAGATTAAG
GGTAAGCAAGTTTTATTGATTGTTTTAGTAATGGGATTGATCGCCATTGGTGGAACAACCTTTGGTTTAGCTGAAGAAAC
AATGGCTTTTTATCCTATCTTAATTCCAGTCTTCTTATTAGCAGGCTTTGATAGGATGACAGTTGTTGCGACGATCTTTT
TAGGTACAAGTATTGGGACGATGGCATCAACTATTAACCCATTTTCAACGGTAATTGCCTCTAATACTGCTGGGGTCAAT
TTTACAGATGCACTGCCACTTAGGATTTGTATGTGGGCAACTTGTGTTATTGTAGGGATGATTTATGTGATTCTTTATGC
TAAAAAAGTGCAAAAGAATCCTAAAGCTTCATATGTTTATAATGACTTTGCTAAAGAAGATCAAGAATATATGAATCAAA
ATGAAACTGTACAAGAAAGTGAATTTACTTGGCGTCAAAAATTAACTTTACTTGTCTTTGCGATTGCCTTTATCGTAATG
ATTTGGGGTGTTCAACAAAAGGGATGGTACTTTACCGAAATTGCCGTTGTCTTCCTAGCAACGGGCTATATTTTCGCCTT
TATCTCAGGCTTAAGTGAGCATAAATTTGTCGAGAGCTTTGTAAATGGTGCGGCAGATTTATTGGGTGTAGCTTTAACAA
TTGGCCTAGCACGTGCTGTTTCAATTGTGATGGAAGAAAGTCATACAAGTGATACAATTATGAATTTCTTTAGTCAGCAA
GTTTCTGGAATGCCACCATTATTGTTTATTTGGTTTATGTTCCTGGTCTACATTGTTCTTGGTTTCTTTATTCAGTCATC
ATCTGGCTTAGCAGTGCTTTCAATGCCAATTATGGCACCCCTAGCTAACGTGGTTGGCATTGATCGCGCAAGCATTATTG
ATGCCTATAATTGGGGTCAAGGATTTATTAGTTTAATTGCACCAACTGGATTAATTTTAATGAGCTTAATGATGGTAAAT
ATTGGGTTCAATAAATGGTTTAAGTTTTGTTGGAAACTGTTAGTTATTGAATTTGGAATTTGTTTAGCCTTTTTAGCAAT
TGGTTTAGTTGTTTACTAA

Protein sequence :
MSDTVQKKKKHQFPTAYTVIIIVLLLVQILTFFIPSGNYATLEYDQPSKEFVITKPNGSKHKEAATQKTLDKYKVKIDVK
KFTSGTIYKPVAIPDSYEKINQKKPGLGGAIYQFLSSQVNGIAQSIDIIAFVLILGGCIGVVHANGAIDAGMQALSKKIK
GKQVLLIVLVMGLIAIGGTTFGLAEETMAFYPILIPVFLLAGFDRMTVVATIFLGTSIGTMASTINPFSTVIASNTAGVN
FTDALPLRICMWATCVIVGMIYVILYAKKVQKNPKASYVYNDFAKEDQEYMNQNETVQESEFTWRQKLTLLVFAIAFIVM
IWGVQQKGWYFTEIAVVFLATGYIFAFISGLSEHKFVESFVNGAADLLGVALTIGLARAVSIVMEESHTSDTIMNFFSQQ
VSGMPPLLFIWFMFLVYIVLGFFIQSSSGLAVLSMPIMAPLANVVGIDRASIIDAYNWGQGFISLIAPTGLILMSLMMVN
IGFNKWFKFCWKLLVIEFGICLAFLAIGLVVY

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
MW1052 NP_645869.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 4e-92 45
SACOL1183 YP_186046.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 3e-92 45
SAUSA300_1064 YP_493762.1 TRAP family protein Not tested vSa¥ã Protein 3e-92 45
SAKOR_01092 YP_008491280.1 Arginine/ornithine antiporter Not tested vSa¥ã Protein 2e-92 45
SA1014 NP_374287.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 1e-91 44
SAV1171 NP_371695.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 1e-91 44