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Name : LJP_0560c (LJP_0560c) Accession : YP_005861843.1 Strain : Lactobacillus johnsonii DPC 6026 Genome accession: NC_017477 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose-6-phosphate hydrolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 626431 - 628089 bp Length : 1659 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAATAATTTAGGCAATAAAGTAATTTACCAAATTTATCCAAAATCTTTTTATGACTCAAATAATGACGGTATCGGTGA TTTACGCGGAATTATCCAAAAAATTGACTATATTAAGAAGCTAAATGTCGACTTTATTTGGTTTAATCCATTTTTTGTTT CCCCGCAAAATGATAACGGCTATGATATCGCTGATTATAAAAAAATTGATCCTCGCTTTGGAACTATGGCCGACTTTGAA GAATTAGTGGCTAAACTAAAAGATATAAATGTTAATGTCATGCTTGATATGGTCTTAAACCACTGTTCCACTGAACATGA ATGGTTCAAAAAGGCTCTTGCTGGTGATAAAAAATATCAAAAATTCTTCTATCTCAGAAAAGGTAAAGATAGAAAGTTGC CTAACAATTGGCAGTCTAAATTTGGTGGCCCTGCCTGGTCAAAATTTGGTGACACAGATTATTACTACCTCCATCTTTAT GATCCAACTCAAGCGGATCTTGACTGGCACAATCCAGAGATTCGCGCTGCCTTAATTGATGTAGTAAACTTTTGGCGCAG TAAGGGTGTTCACGGTTTCCGCTTTGACGTAATTAATGTAACAGGAAAAGATACTGTCCTAGTTGATTCAACTGATCCAG TCCAAGAAAAATCACTCTATACTGATACTCCAGTAGTGCAGCAATATCTAAAAGAATTAAACGCTAAGTCCTTTGGTCAA GATCCAGAGTCTGTCACTGTTGGAGAAATGTCTTCTACTACAATTGAAAATTCAATTGCTTATACTCGTCCCCAAGATCA TGAACTCTCAATGGTATTTACTTTCCACCATCTCAAAGTTGACTACAAAAATGGAGAAAAGTGGTCAAAGATGCCTTTTG ATTTCAAAAAATTAAAAGACATTATGCTTACTTGGAACAGCAAAATTGACCAAGGTGGCGGTTGGCAAGCTCTATTTTGG AACAATCATGATCAACCTTGGGCTTTAAATCGGTTTGGCGATATCGGTAAATATCATGACAAATCTGCTGAAATGTTAGC TCTCGCTCTTCACCTACTGCGCGGAACACCTTATATCTACATGGGTGAAGAAATCGGTATGATGGATCCACACTATACTT CGATGAAAGAGTATGCTGATATTGAGGCACTAAATGCATATGATGCACTCATTGCTAAAGGGATGCATGAAAAAGAAGCT TTTGAAATCGTTCAATCAAAAGCTCGTGATAATTCAAGAGTCCCAATGCATTGGGATAATTCTAAATATGCTGGTTTTAG TGAAAGTAAGCCTTGGCTGATGCCAACTGACCAAGACAAGGTGAATGTTGAAAAGGAATTACGTGAAGGAGAAATATTTA ATTTCTACCAAAAGTTAATTAAACTTAGAAAAAGCGAAGAATTAATTTCAGCTGGTCATATTAAGCCACTTTTGATGGAT CATCCCCAGGTTATGGCATATGAACGCTACTTAGATAACTCGGATGAAAAATTATTAGTCTTTGCTAACTTCTATAGTAA AAAAACAAAAGTTGAAGTTCCTACGGAATATATAAATCGTGACGGTGAAATTTTAATTCAAAATTATGATGAAAAGATTG CTTCTCTTCCTTCAACACTTGAATTAAAGCCATATGAAGCTTTAGCAATTAAAATATAG Protein sequence : MNNLGNKVIYQIYPKSFYDSNNDGIGDLRGIIQKIDYIKKLNVDFIWFNPFFVSPQNDNGYDIADYKKIDPRFGTMADFE ELVAKLKDINVNVMLDMVLNHCSTEHEWFKKALAGDKKYQKFFYLRKGKDRKLPNNWQSKFGGPAWSKFGDTDYYYLHLY DPTQADLDWHNPEIRAALIDVVNFWRSKGVHGFRFDVINVTGKDTVLVDSTDPVQEKSLYTDTPVVQQYLKELNAKSFGQ DPESVTVGEMSSTTIENSIAYTRPQDHELSMVFTFHHLKVDYKNGEKWSKMPFDFKKLKDIMLTWNSKIDQGGGWQALFW NNHDQPWALNRFGDIGKYHDKSAEMLALALHLLRGTPYIYMGEEIGMMDPHYTSMKEYADIEALNAYDALIAKGMHEKEA FEIVQSKARDNSRVPMHWDNSKYAGFSESKPWLMPTDQDKVNVEKELREGEIFNFYQKLIKLRKSEELISAGHIKPLLMD HPQVMAYERYLDNSDEKLLVFANFYSKKTKVEVPTEYINRDGEILIQNYDEKIASLPSTLELKPYEALAIKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 3e-105 | 43 |
