Gene Information

Name : LJP_0364 (LJP_0364)
Accession : YP_005861650.1
Strain : Lactobacillus johnsonii DPC 6026
Genome accession: NC_017477
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : putative glycosyltransferase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 409803 - 411332 bp
Length : 1530 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGACCGTATATAACATAAATTTAGGAATAGGTTGGGCTAGCTCTGGAGTAGAATACGCTCAAAAATATCGTGATCAAAG
TTTTAATGAAGTTGGAATTAAACGAAAATTTATTTTTTCAGATTTAATTTTAGGGAATAATATCGGAGATTTAACTGCCA
ATTTGGGTTTTGATAATGACAATATTATCTGGTTATATAACTTCTTTACTGATGTAAAGATTTCAACCTCTAATTATTCT
TTAGATACTCTAGAAAATGAACTTAATTTAAAAAAACTAAGTAGTAATGTAAAGACTGTTGGAAAAGAAGTATTTTATCA
ATTAAATGATGGCTTACAACTAGTAGCTCGACTAAGCGATGCCGAAAAACGTACTATTGATCAGGTTAGCTATGTTAAAA
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AAGACGTAATTATTCTAGATAGAGAAGACGAAGATAAGAACTTAATTAATGGTCAATTAGTTTTTGAAAACCATGGTCCA
GCTAAATTAGTGGTGGTAGTCCATGCTGATCATTTTGATAAGCACTATACTACTGATCAAAATATCTTATGGAATAATTT
TTATGAGTATCAATTCCAACATGCGAAATATGTCGACAGCTTTGTTGTAGCTACAAATGAACAAAAGAAGATTTTAAAAA
ATCAATTTAAAAAATATTATAATATTGAACCACGCATCGATTGTATTCCGGTAGGAAGTCTAAATGAGTTAGAGCATCCT
ACACAGGGCAGGATGAAGCATGCCTTAATTACAGCTTCTCGCTTAGCAAAAGAAAAACACATTGATTGGATTGTAAATGC
GGTAATAGCTGCTAAAAATAGTGTTCCTGATCTTTCTTTAGATATCTATGGAACTGGCGGTGAAGCAGGAATGCTTACTA
ATTTAATCAATCAAAATCAAGCACAAGATTATATTAATATTATGGGCCAAAGAGATTTAACAAAAGTCTATCGAAACTAT
CCTGCTTATATTGCCGCTTCAACAAGCGAAGGTTTTGGTCTTTCATTGCTTGAAGCTGTGGGATCTGGACTAGCAATGAT
TGGCTTTGACGTTCCTTATGGAAATCCTACTTTTATTGAAAATGGAAAAAATGGAATGCTTTTACCATATAATGAAGAAT
GGACTGACTTTAGAAAAGAAGAAGTTTTAACAAAGGCAATTATTGAGTTGTTTGCTAAGAGTGATGTAGATAGCTTTAAT
AAAAAATCATATCAAATAGCAGAACCTTATTTAACTGAAAATGTTGCTAAACAATGGAAAAAATTAGTGGGGGAATTGGT
CAATGATTAA

Protein sequence :
MTVYNINLGIGWASSGVEYAQKYRDQSFNEVGIKRKFIFSDLILGNNIGDLTANLGFDNDNIIWLYNFFTDVKISTSNYS
LDTLENELNLKKLSSNVKTVGKEVFYQLNDGLQLVARLSDAEKRTIDQVSYVKNNTLLKRDFYSYTKYACEYYLGADKDN
RVTFREFYNEDGTIAYTQHLNGDQETFEFANGEVIYNKDDLYLKMLKELNFTKKDVIILDREDEDKNLINGQLVFENHGP
AKLVVVVHADHFDKHYTTDQNILWNNFYEYQFQHAKYVDSFVVATNEQKKILKNQFKKYYNIEPRIDCIPVGSLNELEHP
TQGRMKHALITASRLAKEKHIDWIVNAVIAAKNSVPDLSLDIYGTGGEAGMLTNLINQNQAQDYINIMGQRDLTKVYRNY
PAYIAASTSEGFGLSLLEAVGSGLAMIGFDVPYGNPTFIENGKNGMLLPYNEEWTDFRKEEVLTKAIIELFAKSDVDSFN
KKSYQIAEPYLTENVAKQWKKLVGELVND

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
gtf1 YP_006310686.1 glycosyltransferase Not tested FWisland_3 Protein 1e-105 45
SH0041 YP_251956.1 hypothetical protein Not tested SCCmec Protein 6e-96 42