Name : LJP_0363 (LJP_0363) Accession : YP_005861649.1 Strain : Lactobacillus johnsonii DPC 6026 Genome accession: NC_017477 Putative virulence/resistance : Unknown Product : preprotein translocase subunit SecA Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 407424 - 409790 bp Length : 2367 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCTAACAGATAGGTTAAGACTAAAAAAAGCTAGGAAATTATTAAATAAAATTAATAAATTAGGTCCTAAAATGCAGGC AATGAGTGATGAAGAACTGCAAGGACAAACTGCTATTTTTAAAAAGCAACTTAAAGAAGGCAAAAGTTTAGACGATATTT TACCAGAAGCTTATGCGACTGTAAGGGAAGCAGATAAAAGAATTTTGGGGATGTTTCCTTACGATGTACAGGTTTTAGGG GCAATTGTATTACATAATGGTTCTATTGCTGAAATGAAAACTGGGGAAGGGAAAACTTTGGTAGCAACAATGGCACTATA TCTAAATGCTTTAGAAGGTAAAGGCGCAATGCTAGTAACCCCAAATGGTTATCTTGCATCTCGTGATAAAAAAGAGTTAG CTCCAGTCTATGAATGGCTAGGCTTAAGTGTGAGTTTAGCTTTCGCAGAAGAGAAAGATAGTAAAAAGAAGATAACTGCT AAAACTAAAAGAAAATGGTATAACTCAGATATTGTATATACTACTGCTTCTTCTTTAGCCTTTGATTATTTGTTTAATAA TCTTGCCAGCTCCAAAGAAAATCAATATTTACGTCCATTTAATTATGTTATTGTCGATGAAGTGGATGAGGTTTTATTAG ATGAAGCACAGACTCCATTCGTGGTCTCCTCTAGTCCTAATGTTCAATCCAATCTATATCATTTGGCGGATCAGTTTGTA AGATTGCTAGATCCAGAGGTGGACTATGTATTTAAAAAGGATGATCAATTATTTTGGTTAACAGCCCATGGTATTGAAAA AGCAGAGCAATTTTTCAAACTAGATGACCTATTTTCTAATGAGAGCAGGAGTGTTTATCGCCATATTATTTTAGCGATGG GTGCGCACTTAACTATGAGACGAGGACATGACTACTTAGTTGTAAAAGGCGAAGTGGTCTTGTTAGATGAAGATAGCGGC AGATTAAAACGTGGAGTGCAGGTAAGTACAGGAATTCACCAGGCTGTTGAAGCTAAAGAAAAGGTTGAGTTGACTAAAAT TCAGAAAACAGCAGCTTCAATAACATTTCCAGCTTTATTTGCTTTGTTTAATGAAGTAAGTGGAATGAGTGGAACCGCTA AAGTTAATGAGGAAGAGTTTTTACAGACCTATAACTTAAAAGTGGTAACTATCCCTACAAGAGTGCCAGTAATTAGAAAA GATTATCGTCCACTTATTTTCTTAACTACAAGAGATAAATTAATGACAGCTGTAGATGACGTAGTAGAAATGCATAAAAC TGGTCGACCTGTATTACTTGTTGCTGGTTCTGTAGAAAATTCAGAAATTATTTCAGAACTGCTCCTCAATATTGATATTC CGCATAATGTGTTAAATGCCTATAATGCAGCCTATGAAGCACAAATTATTAAAAATGCAGGTCAAAAAAATGCTGTAACT ATTGCAACAAATATGGCTGGTAGAGGAACTGATATTAAGCTAGGTCCAGGAGTTAAGGAACTGGGTGGCTTAGCAGTAAT TGGAACTGAAATGTTACCTAAAAGAGTGGAATTGCAGCTAGCGGGACGTGCCGGCAGACAAGGAGATTCAGGTAGTAGTC AATTTTTGATTTCCTTAGAAGATTCATTTATTTCTTCTAATAGCACTGCTCGTCAGAAGAAGTATTACCGCAAATTAATG AAGAAGAAGTCAAAGGGGAAAGATATTACCCTTCTTTCAGGTCCGCGAATTCGATTTAGTTTGTTTATGTTAAGAACTCG TAAAGAAGATCTTAATGAGTTGATGAGAAGTCAAACTAACAAGATGGAAATAATTTTATCGCTTCAACGGAAGAATTTTT ATACTAGAAGAGACAAAATTATGAAAACTGATGATTTACAGAAAGATGTAGATCGGATCATCGATAATGCATTGGATCTT TATTTAGAAAAACAGGATTTATCAGATAAGAGTGATTTAAAGTACTTTATTAACCAGCATGTTACTTATCAACAGGTTAA CGTACCGGATAATTTAAAAACGAAAAAAGCGATAAAAGACTTTTTGAAAGAATTAGCTTACAAGATTCTTGATGAGAAAA AGCATGTATTAATTAACAAAAAACAAGCAAATGATTTTTATCAACAAGTAATCATTTCATCAATGGATGGAAATTGGATT GATCAAGTAGATAGAATTGAAAAAATAAAGGTTAATGCACAGCAATGGGGAAGAAGTGGCAGACCTCAAGATCTTCTCCA CCAAGAAAAGGCTTTTGAAGCGTATAAAGATTTCTTAGATAAAATTACCTTGTCTGCCTTTGATAATCTTTTATTAAGCA AGATTTTTACGAATGAAAAAGGACAGTTAGTTGTAGTATTTAATTAG Protein sequence : MLTDRLRLKKARKLLNKINKLGPKMQAMSDEELQGQTAIFKKQLKEGKSLDDILPEAYATVREADKRILGMFPYDVQVLG AIVLHNGSIAEMKTGEGKTLVATMALYLNALEGKGAMLVTPNGYLASRDKKELAPVYEWLGLSVSLAFAEEKDSKKKITA KTKRKWYNSDIVYTTASSLAFDYLFNNLASSKENQYLRPFNYVIVDEVDEVLLDEAQTPFVVSSSPNVQSNLYHLADQFV RLLDPEVDYVFKKDDQLFWLTAHGIEKAEQFFKLDDLFSNESRSVYRHIILAMGAHLTMRRGHDYLVVKGEVVLLDEDSG RLKRGVQVSTGIHQAVEAKEKVELTKIQKTAASITFPALFALFNEVSGMSGTAKVNEEEFLQTYNLKVVTIPTRVPVIRK DYRPLIFLTTRDKLMTAVDDVVEMHKTGRPVLLVAGSVENSEIISELLLNIDIPHNVLNAYNAAYEAQIIKNAGQKNAVT IATNMAGRGTDIKLGPGVKELGGLAVIGTEMLPKRVELQLAGRAGRQGDSGSSQFLISLEDSFISSNSTARQKKYYRKLM KKKSKGKDITLLSGPRIRFSLFMLRTRKEDLNELMRSQTNKMEIILSLQRKNFYTRRDKIMKTDDLQKDVDRIIDNALDL YLEKQDLSDKSDLKYFINQHVTYQQVNVPDNLKTKKAIKDFLKELAYKILDEKKHVLINKKQANDFYQQVIISSMDGNWI DQVDRIEKIKVNAQQWGRSGRPQDLLHQEKAFEAYKDFLDKITLSAFDNLLLSKIFTNEKGQLVVVFN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 1e-138 | 45 |