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Name : LJP_0217 (LJP_0217) Accession : YP_005861506.1 Strain : Lactobacillus johnsonii DPC 6026 Genome accession: NC_017477 Putative virulence/resistance : Unknown Product : neopullulanase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 250914 - 252638 bp Length : 1725 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCAACTTGCAGCTTTAAAACACAGAACTGAAAGTGAAGATTGTTTTGTTATTGATCATTCACACGTAAAAATTAGACT TCATACAGCAAAAGATGATGTAGAAAAAGTAATTGTTCATTACACGGATAACTATCTCCCACCAAAACAAGCTAAGGAAC TTGAAATGGAAAAAATAGGTAGTGGTCAAGTTAATGATTACTGGGGAGCAACTTTAACTGCGCCTTATCATCGGATTAAA TATACTTTTGAAATAATTGGAAAAGATGGAAGTCATTATATCTTTGGTGACCGTAGTATTGAAAACTTTAGCGATGAAAA ATTAAGAGAAGATGGAATGTATTTTAAAGTTCCATACTTTCATGATATTGATCGAATCAAAACACCAAAATGGCTTAAAG ATGTTGTTTGGTATCAAATTTTTCCAGAGCGTTTTGCTAATGGAGATAAAAGTAATGACCCAGCAAATGTTAAGGAGTGG AATCCGGAAGATCATCCAGGCAGAGAAGATTTTTATGGAGGAGACTTACAGGGAGTTTTAGATCATCTAGATGATCTACA GAAGTTAGGAGTTACAGGACTATATTTCTGCCCAATTTTTAAAGCGAGTTCTAATCATAAATATGACACAATAGACTATT TACAAGTAGATCCAGCTTTCGGAGACAAGGATTTATTTGCAAAAGTAGTTAATGAAGCACATAAGCGTGGCATGAAAGTA ATGCTTGATGCTGTATTTAATCACTTAGGTGACCAATCAATGCAGTGGCAAGATGTGGTTAAAAATGGCGAAAAATCACG TTTTAAAGATTGGTTCCACATTAATTCATATCCTGTTGAACCATATCGTGACCCAAGTAAAGGTGAGAAAAATCCACCGT ATGAAACTTTTGCCTTTGAAAAGCATATGCCTAAGTTAAATACGGCTAATCCAGAAGTACAGGACTTCTTATTAGAAATT GCGACCTACTGGGTAAAATATTTTGATATTGATGCATGGCGTCTAGATGTTGCAAATGAAGTTGACCATCATTTCTGGAA GAGATTCCATGATGAATTAATTAAAATAAAGCCTGATTTCTATATTGTTGGTGAAATATGGCATTCAGCTCGTCCATGGC TTCAGGGAGATCAATTTACAGGTGTCATGAATTATCCATATACTTTACAAATTGAAGATCATTTCTTCAAGCATAAAATG GATGCTAAAGACCTAAGTGAACACTTAACTGATCAGCTAATGATGTATCCTGATATGGTGGACCAGGCTATGATGAATAT GCTTGATTCCCATGATACGGCTAGAATTTTAACTTTAGCAAAAGACAATCAAGATTTAGCTTTACAAGCAGTTGCGTATG AATTTGTTCAACCTGGAGTGCCATGTATTTACTATGGAACAGAGATGGGAATGAGCGGCGATAATGATCCGGATTGTCGC AAACCAATGGATTGGAGCAAGCTCGAAGGACCAGTATGGCAAAGAGTCCATGAATTAGTGAAATTCAGACTTGATCATAG CGATACTTTGAATAAAGGTACTGTTAAGTTAACGGTAACAGAAAAAGGTCTCTTAAAAGTTGAACGAACAGGCAAAGAAA CAATAAAGGCCTACTATAACACAGGTAAAAAAGGTATTAAAATTGATAAAACAGCAGTACTTAGTCAGAACTATAAATCG GAAGTATTAGCACCAGATGGCTTTTTGATCGAGGTTGAAGCTTAA Protein sequence : MQLAALKHRTESEDCFVIDHSHVKIRLHTAKDDVEKVIVHYTDNYLPPKQAKELEMEKIGSGQVNDYWGATLTAPYHRIK YTFEIIGKDGSHYIFGDRSIENFSDEKLREDGMYFKVPYFHDIDRIKTPKWLKDVVWYQIFPERFANGDKSNDPANVKEW NPEDHPGREDFYGGDLQGVLDHLDDLQKLGVTGLYFCPIFKASSNHKYDTIDYLQVDPAFGDKDLFAKVVNEAHKRGMKV MLDAVFNHLGDQSMQWQDVVKNGEKSRFKDWFHINSYPVEPYRDPSKGEKNPPYETFAFEKHMPKLNTANPEVQDFLLEI ATYWVKYFDIDAWRLDVANEVDHHFWKRFHDELIKIKPDFYIVGEIWHSARPWLQGDQFTGVMNYPYTLQIEDHFFKHKM DAKDLSEHLTDQLMMYPDMVDQAMMNMLDSHDTARILTLAKDNQDLALQAVAYEFVQPGVPCIYYGTEMGMSGDNDPDCR KPMDWSKLEGPVWQRVHELVKFRLDHSDTLNKGTVKLTVTEKGLLKVERTGKETIKAYYNTGKKGIKIDKTAVLSQNYKS EVLAPDGFLIEVEA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SPN23F_09660 | YP_002510949.1 | alpha-amylase | Not tested | PPI-1 | Protein | 3e-128 | 44 |
