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Name : LJP_1597 (LJP_1597) Accession : YP_005862863.1 Strain : Lactobacillus johnsonii DPC 6026 Genome accession: NC_017477 Putative virulence/resistance : Unknown Product : PTS system transporter subunit IIABC, glucose specific Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1739796 - 1741679 bp Length : 1884 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTCTAAGAAATTTTCTCATATTGGCCAAGCCTTCTCACAACTGGGGCAAGCCTTTATGCTTCCAATAGCTATTTTACC TGTAGCCGGCTTACTCCTAGGACTAGGCGGAGCCTTAACCAATAAAGCTGCCGTTACCTCTTATCCTTGGCTTAATCAAG AATGGCTTCAAACAATTCTAAAGATAATGAATTTTGCAGGAAGTGCTGTTTTTAATAACTTAGCTCTTATTTTCTCAATT GGTTTAGCAGTTGGCTTAGCAAAAGGGGATAAAGGAACAGCTGGCTTAGCGGGTGGCGTTGCCTATCTAGTATATACAGC CACAATCTCAGGACTACTCCAACTATTTTCACCTAAAAACACTATTGATACAGGAGTATTAGGTGCAATTGTGATTGGCT CAGTTGTTGCCTACCTACATAATCATTATCGCAAGGTAGAATTACCACAATTCTTAGGCTTTTTTGGTGGTTCAAGATTT ATTCCTATTATTTCATCTTTAGCTGCGATTGTTATTGGTGCTATCTTCTTCATTATTTGGCCACCAATTCAAAGCGGTTT AACCAGTGCAGGTTATGCAATAGCTAAAATGGGAAGTTTGGGAAGTTTTCTATATGGCTTCTTGCTTCGCTTAACTGGAG CAGTTGGTCTACATCACACAATTTATCCAATGTTTTGGTACACAGCCCTAGGTGGAACTGCAGATGTAGCTGGTAAAACT GTTGTTGGTGCTCAAAATATTTTCTTTGCTCAATTAGCTGATCCTAATCACCATGGTTTGTTTACTTACGGTACTAGATT TTTTGCTGGTCGTTTTGCAACTATGATGTTTGGTCTTCCAGGGGCCGCTTTAGCAATGTACCTTTGCTTACCTAAGAGAA ATCGGAAGACTAACGGTGGTCTATATCTTTCAGGTGGTTTAACCTCATTTTTAACTGGTATTACTGAACCAATTGAATAT ACTTTCTTATTCGTAGCACCTTGGTTATATGTTATCCATGCTTTTCTCGATGGATGTTCATTTTATGTTGCTGATATCAT GAATATTAGAATCGGAAATTCATTCTCTGGTGGTTTAATTGACTATCTTCTCTTTGGCGTCTTACAAGGAAAAGATAAAA CTAATTGGCCGAATGTCTTAATTATGGGAGTTATCTGGTTCTTCCTTTACTTCTTTATTTTTACTTTTTGTATTAAAAAA TTCCATGTTGGTATTCCAGGAATGGTTGTAGAAGAAAATCAAGATGCTGAAAAAATTATGTCGAACAGCCCCAAGACTGA TGACAAACTATACAACGAATCTTGTGAGATTATCACTGCTCTTGGCGGTTTAGAAAATATTGAAACTGTTTCAGCTTGTG CAACCAGATTGAGAGTTTCTTTAAAGAATAATAGTTTAGTTAATGATGATGTATTTAAAATGTTGGGTGCTCCTGGGGTA TTAAAAGTTGCCGGTGGTGTTCAAGCTATTTTTGGTGGAAAAGCCGATCTATATAGTCAAGAAATTAATGACATTATCGC CCATCCAGATGTGCAGCCCGTAAATAATCCACAAGTGGATAAAGTTTCTAATCCTCAATCAAATTCTGTGCATAAGTCAG AAAAGATTATTTTCAAGGCACCTGTCAAGGGGACTTTTGAAGATATATCTCAAGTTAATGACGAAGTATTTTCACAAAAG ATGATGGGTGAAGGATTTGCAGTTAAACCAGAAAATGGAAAAATTTATAGTCCGGTTACCGCTACAGTCGTATCAATCTT TAAAACAAAACATGCTGTAGGTCTTAAAACCGAATCTGGTTTAGAAGTTATGCTTCATCTTGGAATAGATACTGTTGAAC TAGAAGGTAAGCCATTTACCTTAAAGGTAAAAGAAGGCGATTAA Protein sequence : MSKKFSHIGQAFSQLGQAFMLPIAILPVAGLLLGLGGALTNKAAVTSYPWLNQEWLQTILKIMNFAGSAVFNNLALIFSI GLAVGLAKGDKGTAGLAGGVAYLVYTATISGLLQLFSPKNTIDTGVLGAIVIGSVVAYLHNHYRKVELPQFLGFFGGSRF IPIISSLAAIVIGAIFFIIWPPIQSGLTSAGYAIAKMGSLGSFLYGFLLRLTGAVGLHHTIYPMFWYTALGGTADVAGKT VVGAQNIFFAQLADPNHHGLFTYGTRFFAGRFATMMFGLPGAALAMYLCLPKRNRKTNGGLYLSGGLTSFLTGITEPIEY TFLFVAPWLYVIHAFLDGCSFYVADIMNIRIGNSFSGGLIDYLLFGVLQGKDKTNWPNVLIMGVIWFFLYFFIFTFCIKK FHVGIPGMVVEENQDAEKIMSNSPKTDDKLYNESCEIITALGGLENIETVSACATRLRVSLKNNSLVNDDVFKMLGAPGV LKVAGGVQAIFGGKADLYSQEINDIIAHPDVQPVNNPQVDKVSNPQSNSVHKSEKIIFKAPVKGTFEDISQVNDEVFSQK MMGEGFAVKPENGKIYSPVTATVVSIFKTKHAVGLKTESGLEVMLHLGIDTVELEGKPFTLKVKEGD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ef0067 | AAM75272.1 | EF0067 | Not tested | Not named | Protein | 3e-137 | 72 |
