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Name : LJP_1393c (LJP_1393c) Accession : YP_005862665.1 Strain : Lactobacillus johnsonii DPC 6026 Genome accession: NC_017477 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1493490 - 1496150 bp Length : 2661 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGCACAAAAGAAATTACTTTTAATTGACGGCAACTCTGTGGCCTTTCGTGCCTTTTATGCTTTATACCGTCAGCTTGA TCGTTTTACTAGTCCAGATGGATTGCATACAAATGCAATTTTTACTTTTAAAAATATGCTTGACGCAATCATGAAGCAGA CTAATCCAACTAATGTATTAGTTGCTTTTGATGCAGGAAAAGTTACTTTTAGAACTGAGATGTATCAAGATTATAAAGGT GGTCGCCAAAAAACACCGAGTGAATTATCAGAGCAGCTTCCTGTAATTCGTGAAATGCTTAAAGACTTAGGAATAAAGAG TTATGAGCTAAAGAATTATGAAGCTGATGATATTATTGGAACACTTTCTAAGATGGGAGAAGATGCTGGGTATACAGTTG ATATTGTGACTGGAGATAGAGATTTAACTCAGCTTGCATCTGATAAAACTACAGTATTAATTACTAAAAATGGAGTTGGC GATACAGAAGCATATACTCCAGACCATATGAAAGAAGTTAACGGTGTTACTCCAACCGAATTCATTGATATGAAAGCTTT GATGGGGGATAATTCAGATAATTATCCTGGTGTAACTAAGGTTGGCCCCAAAACTGCCTCCCGTCTAATTCAAAAATATG GTTCTATTGAAGAACTTTATGAACATGTAGACGAAATGAAAAAGTCTAAGCTAAAAGAGAATCTAATTAATGATAAAGAT AAGGCCTTTTTAGCTAAAAAGTTAGCCACTATTGATCGTAATTCGCCAGTGGAAGTAACTCTGGCCGACACTAAATTACA AGAACCAAATATTGAAGACTTACGTAATTTGTATGAACGTTTAGGATTTAAGAAATTCTTAGCAGAATTAGGTAGCACGG GTACGACGAGTAGTGAACAAGAGATTGAAAAATATGAATATCTTGAATTAACTAAGGAAAATATCGTTGAACTAGATAAA ATCAGTGAAAAAGAAGTAACTTTTTATTTAGCAATGCTAGGTGATAATTATCATCTAGCTCCAATTGAAGGCTTTTCTTT AAAAGTTGGTAATAAGATCTATGTATCTAAAGATCCAGTTTTGTTGCAAGAAAATCCACTTCATAAAATGCTAGAAGATA AGACCATCAAGAAAAATGTTTTTGACATTAAAAGAACTTATGTAGGTTTACATCGACTAGATCTCAAGGCAGAAGGTTTA GACTATGATATGCTTCTTGCTTCATATTTAGTTAATAATGAAAATAATTCGAACGATCTTGGCGAAGTAGCTCATTTATA CGACGATTATTCTGTAAAGACTGATTTAGAAGTTTACGGAAAAGGTAAAAAACAAGCTGTACCTAACGATAATGAATTCT TTGAACATTTAGCAGCTAAAGTTGCCGTAATTGAGAAATTAAAGACTCAACTTCTTGAAAAACTAAAAGATCATGAACAA GATGATTTATATGAAACAATTGAAATCCCAGTGGCTTTCGTCTTAGCAAAGATGGAAATTACTGGAATCAAGGTTGAAGC ATCAGTTTTGAATCAATTAGGTAATGATTTTGCAGTTAAATTACAAGAACTAGAACATAAGATTTATCAACAAGCTGGCG AAGAATTCAACTTGAACTCACCTAAGCAGTTGGGGCATATCCTATTTGAGAAATTAGGTTTACCACCAATTAAGAAGACT AAGACTGGTTACTCAACATCTGTTGAAGTATTAGAACAATTAAAAATGAAAAGTCCAATTGTTTCAGAAATTTTGGACTA TCGCCAAATTGCTAAAATTCAAAACACTTATGTTAAGGGCTTGCTTGACTGCATTCAGCCAGATGGAAGAATTCACACTC GCTACTTGCAGACTTTGACTACAACAGGTCGTCTTTCTTCAGTTGATCCTAATTTACAAAATATTCCAACTAAAACTGAG GAAGGAAAGCAGATTAGAAAAGCTTTTGTTCCTTCAACAAAAGATGGGTATATTTTCTCTTGTGATTATTCTCAGGTTGA ACTAAGGGTGTTAGCGCATGTTTCTGGGGATGAACATATGCAAGAAGCATTCAAGTCAGGCTATGATATTCATGCCCACA CTGCAATGAAGATTTTCCACTTGGACTCACCTGATGAAGTAACGCCATTAATGCGTAGACATGCTAAAGCTGTTAATTTT GGTATCGTTTATGGTATTTCAGACTATGGCTTATCCAAAAACTTAGGCATTAGCCGTAAGCAGGCTAAAACTTTTATTGA AAATTACTTTGAACAATATCCTCAAATTAAAAATTATATGGATGAAGCAATTAAAAAAGCTCGTGAGAATGGCTATGCAG AAACAATTATGCATAGAAGACGGTATTTACCAGATATTCATTCCAAGAACTTCAATGTCAGAAGTTTTGCGGAAAGAACT GCAATTAATTCTCCAATTCAAGGATCAGCAGCTGATATTATTAAGATTGCCATGATTAATATGCAGAAAAAACTTGATGA ACTACATTTAAAGACTAAAATGGTCTTACAAGTACACGATGAATTGATTTTTGATGTGCCAAAAGATGAATTAAATACAA TTAAGAAAATTGTTCCAGAGGTTATGCAGTCAGCTGTCAAATTAGATGTTCCACTAATTGCAGATTCAAATTGGGGACAT AATTGGTACGATGCAAAATAA Protein sequence : MAQKKLLLIDGNSVAFRAFYALYRQLDRFTSPDGLHTNAIFTFKNMLDAIMKQTNPTNVLVAFDAGKVTFRTEMYQDYKG GRQKTPSELSEQLPVIREMLKDLGIKSYELKNYEADDIIGTLSKMGEDAGYTVDIVTGDRDLTQLASDKTTVLITKNGVG DTEAYTPDHMKEVNGVTPTEFIDMKALMGDNSDNYPGVTKVGPKTASRLIQKYGSIEELYEHVDEMKKSKLKENLINDKD KAFLAKKLATIDRNSPVEVTLADTKLQEPNIEDLRNLYERLGFKKFLAELGSTGTTSSEQEIEKYEYLELTKENIVELDK ISEKEVTFYLAMLGDNYHLAPIEGFSLKVGNKIYVSKDPVLLQENPLHKMLEDKTIKKNVFDIKRTYVGLHRLDLKAEGL DYDMLLASYLVNNENNSNDLGEVAHLYDDYSVKTDLEVYGKGKKQAVPNDNEFFEHLAAKVAVIEKLKTQLLEKLKDHEQ DDLYETIEIPVAFVLAKMEITGIKVEASVLNQLGNDFAVKLQELEHKIYQQAGEEFNLNSPKQLGHILFEKLGLPPIKKT KTGYSTSVEVLEQLKMKSPIVSEILDYRQIAKIQNTYVKGLLDCIQPDGRIHTRYLQTLTTTGRLSSVDPNLQNIPTKTE EGKQIRKAFVPSTKDGYIFSCDYSQVELRVLAHVSGDEHMQEAFKSGYDIHAHTAMKIFHLDSPDEVTPLMRRHAKAVNF GIVYGISDYGLSKNLGISRKQAKTFIENYFEQYPQIKNYMDEAIKKARENGYAETIMHRRRYLPDIHSKNFNVRSFAERT AINSPIQGSAADIIKIAMINMQKKLDELHLKTKMVLQVHDELIFDVPKDELNTIKKIVPEVMQSAVKLDVPLIADSNWGH NWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 55 |
