|
Name : LBHH_1936 (LBHH_1936) Accession : YP_005851088.1 Strain : Lactobacillus helveticus H10 Genome accession: NC_017467 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Maltogenic amylase or neopullulanase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2038816 - 2040537 bp Length : 1722 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGCAATTAGCAACATTAAAACACAGAACTGAAAGTGAAGACAGCTTTGTAATTGATGCGACTCATGTTCGTGTTCGTTT TCATAGCGCAAAGAATGATGTTGAAAAGGTTATTGTGCACTATTGCGATAACTATTTGCCATTAAACCAGGCTAAAACAA TTGAAATGACTAAAATTGGTGAAGGCCAAGTCGAGGATCACTGGGGAGCCACCCTTGAGGCACCATTCCATCGTTTAAAG TACACATTTGAAGTAATTGGTAATGATGGAACCAGCGTTGTTGTAGGTGATAGGGCAATTAGCAGCGATGTTGAAAGTGC TCTGATGGAAGACGGATATTATTTTAAGGTGCCGTATTGTCATGATATTGATATGGTTAAGACACCAGAATGGGTAAGAC ATACTGTTTGGTACCAAATTTTCCCAGAGCGTTTTGCTAATGGTGATAAATCTAATGATCCTAAAAATGTAAAGCCTTGG AATCCTGAAGACCATCCTGGTCGAGAAGACTACTACGGTGGTGATTTGCAAGGTGTGTTAGACCATTTGGATTATCTAAA GAAGCTAGGAGTAAATGGCTTATACTTCTGTCCTGTTTTTAAAGCAGGGTCCAACCACAAATATGACACGATTGATTACT TGCAAATTGATCCGGAATTCGGTGATAAAGATCTATTTGCCAAGGTAGTTAATGAAGCTCATGCACGTGGCATGAAAGTT ATGCTAGATGCGGTGTTTAACCACTTAGGTGATAAGTCAATGCAATGGCAAGATGTGGTCAAAAATGGCCCAAGTTCTCG TTTTGCTGGCTGGTTTCACATTAATGAATATCCGGTTGAACCATATCATGATCCATTGCAAGGTGAAGGAAATCCTCAAT TTGATACTTTTGCCTTTGAAAAACACATGCCAAAATTAAATACTGCTAACCCTGAAGTACAAGACTTCTTGCTAGAAATA GCAACTTACTGGGTGAAATACTTTGACATTGATGCTTGGCGTTTGGATGTTGCCAATGAAGTGGATCATCATTTCTGGAA GAAGTTTCATAAGGCTGTGACTGATATCAAGCCAGACTTTTACATTGTCGGTGAAGTTTGGCACTCAGCTCGTCCATGGC TTAATGGTGATGAATTTACAGGTGTAATGAATTATCCATATACTTTGCAAATTGAAGATCATTTCTTTAAGCACAAGCTA ACAGCTGATCAAATGACCAAGCGTTTAACTGATCAGCTCATGAAGTACCGTGATTCAACTAATGCAGCAATGATGAACAT GCTTGATTCACATGATACTGCTAGAATTTTGACAGTGGCTAACGGCGATCAAGATTTGGCTTTGCAGGCATTAACCTTTG AATTTGTGCAAAAAGGCAGTCCATGTATTTATTACGGTACTGAAATGGGAATGACTGGCGGCAATGACCCAGACTGTCGT AAGCCGATGGATTGGTCAAAAGAAGATGGACCTGTTTGGCAAAGAGTTCATGAACTGATTAAGTTCCGTTTAGACCATGA TGAGACCTTCGGAAAGGGTACAATTAAGTTACACGTAACAGAAAATGGCTTGATTGAGGTTGATAGAGACGGAATTGAAT CTGTTAAGGCATACTTTAATACCACTGATCATGATGTAAAAATCGATTGTAAAGATTCATTTAGTCAAGATTATCGAAAT GGAGTATTGGCTCCGAAAGGCTTTGTAATCACGGTTCGCTAA Protein sequence : MQLATLKHRTESEDSFVIDATHVRVRFHSAKNDVEKVIVHYCDNYLPLNQAKTIEMTKIGEGQVEDHWGATLEAPFHRLK YTFEVIGNDGTSVVVGDRAISSDVESALMEDGYYFKVPYCHDIDMVKTPEWVRHTVWYQIFPERFANGDKSNDPKNVKPW NPEDHPGREDYYGGDLQGVLDHLDYLKKLGVNGLYFCPVFKAGSNHKYDTIDYLQIDPEFGDKDLFAKVVNEAHARGMKV MLDAVFNHLGDKSMQWQDVVKNGPSSRFAGWFHINEYPVEPYHDPLQGEGNPQFDTFAFEKHMPKLNTANPEVQDFLLEI ATYWVKYFDIDAWRLDVANEVDHHFWKKFHKAVTDIKPDFYIVGEVWHSARPWLNGDEFTGVMNYPYTLQIEDHFFKHKL TADQMTKRLTDQLMKYRDSTNAAMMNMLDSHDTARILTVANGDQDLALQALTFEFVQKGSPCIYYGTEMGMTGGNDPDCR KPMDWSKEDGPVWQRVHELIKFRLDHDETFGKGTIKLHVTENGLIEVDRDGIESVKAYFNTTDHDVKIDCKDSFSQDYRN GVLAPKGFVITVR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SPN23F_09660 | YP_002510949.1 | alpha-amylase | Not tested | PPI-1 | Protein | 2e-128 | 46 |
