|
Name : LBHH_1881 (LBHH_1881) Accession : YP_005851036.1 Strain : Lactobacillus helveticus H10 Genome accession: NC_017467 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1975585 - 1977768 bp Length : 2184 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGCAGGTGAAGACAATGACTGATAATCTTAATCATGATTCATATATTTCTTTAAATGCACTTACTAAATTTAAAGATGA AAAAGGAAATTATAATTTTAAAGCTGACAAGGAAGCTACTAAGCAATATCTTGAAAATCATATTGAACCAAGAATGAAAA AGTTTGCTTCTTTAGAAGAAAAATTAGCTTATTTAGTTGATAATAATTACTATGATAAAAAAGTTCTAGATTTATATACA CCTAAATTTATTAAAGAAATTTTCAAATTAGCTTATGCACAAAATTTTAGCTTTTTGAACTTTATGGGTGCAGCTAAATT CTATAAAGCATATGCCTTAAAAACAAACGATAATAAACAATTTTTAGAACGTTTTGAAGATCGGGCTGTTATGAATGCTT TATTTTTAGCTGATGGCAATGAAGAACTGGCCTTGAATTTAGTTAAAGATATTATTAGTAATCGTTTCCAGCCAGCAACT CCGACTTTCTTGAATGCAGGTAAAAAGAGACGTGGTGAATATATTTCATGTTATTTGCTCAGAGTTGAAGACAATATGGA ATCAATTTCACGAGCAATAAGCACAAGTCTGCAATTATCTAAACGTGGTGGTGGTGTTGCTCTATGCTTAACTAATTTGC GTGAATTAGGTGCACCTATTAAAAAAATGAAGAATTTATCTAGTGGGATAATTCCTGTAATGAAATTACTAGAAGATTCA TTTTCTTATGCCAATCAATTAGGGCAAAGACAAGGTGCCGGTGCAGTTTATTTAAGTGCCCATCATCCCCAGATTATGCA ATTTTTAGATACTAAACGAGAAAACGCTGACGAAAAGGTAAGAATTAAATCTTTATCACTTGGCGTAGTGATTCCAGATA TTACTTTTGAACTAGCCAAAGAAAATAAAAAGATGGCTTTGTTTTCACCATATGATATTAAACGTGAATATGGTAAACCA ATGTCAGATATTTCAATTACTAAAGAATACCAAAATCTCCTTAATAATCCATGTATTAAAAAGACATTTATCAGTGCTAG AAAATTCTTCCAAACTATTGCTGAAGTTCAATTTGAATCAGGGTATCCTTATATTATGTATGAAGATACTGTCAATCGAA GAAACCCACAAAAGAAATTGGGGCGGATCGTGATGTCTAATTTATGTTCAGAAATTGCTCAGGTTAATACGCCAAGTACC TATAATGAAGACTTAAGTTTTAATAAGACGGGCTACGATGTTTGTTGTAATTTAGGATCACTTAATATTGCAGCAGCAAT GAATAGCGCTGACAAGTTAGGTGGTTTGGTTTCTGATAGTGTTCAAGCGCTTAATCGTGTTGCCAGGTCTTCAGATTTAG ATTGTGCTCCTTCAATTAAAAAGGGAAATAAAGCTAATCGAGCAATCGGTCTAGGAGCAATGAATTTACATGGCTTTTTA GCAACTAATCATATTTATTATGATTCACCAGAAGCAGTTGAATTTACAGGAATTTTCTTTTATACAATTGCATACCATGC ATTTAAAGAATCAAATAAATTAGCTGAAAAGTATGGTGCTTTTAAAGGATTCAAAGATTCATCATATGCTAGTGGTGATT ATTTCAAAAAATTTATTGATGAGGAAGTCTCACCGAAAACAGACAAGATTAAAGAAATTGTAGCTAAATATAAATTAGTT ATTCCAACTAAAGAAGATTGGGAAGAATTGATTACTAAAATTAAAAAGACAGGTATAGCTAATGCTAACTTATTAGCAGT TGCACCTACTGGATCAATTAGTTATTTATCCTCATGTACACCAAGTTTGCAGCCAGTAGTAGCTCCTGTTGAAACACGCA AAGAGGCTGATTTGGGTCGAATTTATGTACCAGCTTATAAGATTAATAAAGACAATTATGAGTATTACGAAAAGGGTGCA TATGAAGTAGGACCTAATGCTATTATTGATATTACAGCTGCTGCACAAAAGTATGTTGATCAATCAATTTCGTTAACTTT ATTTGTTGAAGATAATGCAACAACAAGAGATTTAAATAAGGCTTATATTTATGCCTTTAAAAAGCGATGCAACTCAATTT ATTATGTTAGAGTAAGAGAAAAAGTTTTAGCTGGTAGTGAGAACTTGACTGCAGACGAATGTTTAATTCAAAATGGTGCA GAATGCCAGAAATGTATGATTTAG Protein sequence : MQVKTMTDNLNHDSYISLNALTKFKDEKGNYNFKADKEATKQYLENHIEPRMKKFASLEEKLAYLVDNNYYDKKVLDLYT PKFIKEIFKLAYAQNFSFLNFMGAAKFYKAYALKTNDNKQFLERFEDRAVMNALFLADGNEELALNLVKDIISNRFQPAT PTFLNAGKKRRGEYISCYLLRVEDNMESISRAISTSLQLSKRGGGVALCLTNLRELGAPIKKMKNLSSGIIPVMKLLEDS FSYANQLGQRQGAGAVYLSAHHPQIMQFLDTKRENADEKVRIKSLSLGVVIPDITFELAKENKKMALFSPYDIKREYGKP MSDISITKEYQNLLNNPCIKKTFISARKFFQTIAEVQFESGYPYIMYEDTVNRRNPQKKLGRIVMSNLCSEIAQVNTPST YNEDLSFNKTGYDVCCNLGSLNIAAAMNSADKLGGLVSDSVQALNRVARSSDLDCAPSIKKGNKANRAIGLGAMNLHGFL ATNHIYYDSPEAVEFTGIFFYTIAYHAFKESNKLAEKYGAFKGFKDSSYASGDYFKKFIDEEVSPKTDKIKEIVAKYKLV IPTKEDWEELITKIKKTGIANANLLAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVAPVETRKEADLGRIYVPAYKINKDNYEYYEKGA YEVGPNAIIDITAAAQKYVDQSISLTLFVEDNATTRDLNKAYIYAFKKRCNSIYYVRVREKVLAGSENLTADECLIQNGA ECQKCMI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 57 |
