Gene Information

Name : IALB_0548 (IALB_0548)
Accession : YP_005845528.1
Strain : Ignavibacterium album JCM 16511
Genome accession: NC_017464
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : thymidine phosphorylase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 607335 - 608639 bp
Length : 1305 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAACACTATAGAAATTATCCGCAAGAAGAGAGATAACCATTCTCTGACAAAAGAAGAAATCGATTTTCTGATTTCTGC
TTATACAAAAGGAACAATTCCCGATTATCAATTCTCTGCTTTTCTTATGGCAGCTTTTATAAATGGTTTGAACAAAACCG
AAACTGCTGCATTAACAAAAGCAATGCTCTACAGCGGTAAGGTTGTTGATCTTTCATCAATCAAAGGTGTTAAAGTTGAT
AAACACTCAACTGGTGGAGTAGGTGATAAAACTTCATTGATAATTGCACCAATAGTTGCTGCTGCAGGAGTTTATGTTCC
GATGATTTCAGGCAGAGGACTCGGACATACCGGCGGAACTCTCGATAAACTTGAATCTATTCCCGGCTTCAGAACTAATT
TAACTCTTAAAGAATACAAAAATGTTCTGAAGAAAACCGGTGTGGTTTTAATCGGACAAACAAAAGAAATTGCACCAGCC
GATAAATTAATCTATTCTCTCCGTGATGTAACTGCAACAGTTGAATCAATTCCTTTAATCACCGGAAGTATTATGAGCAA
AAAACTTGCAGAAGGAATTGATGCACTTGTTCTTGATGTTAAAACCGGTAACGGTGCTTTTATGAAAGAAATGAAAGATG
CCGAACAACTCGCTTATTCCCTTTCAGATACTGCCAAAGCGTTTGGTAAAAAATGTATTGCTTTTATCACTGATATGAAT
CAACCACTTGGAAATTATATCGGTAACTGGCTTGAAGTTTATGAATCAATTGAAGTATTAAAAGATGGAAAGAAGAACGA
CTTAACAGAACTTTCCTTAATTCTTGCCGGTGCGATGATTTATCTTGGTAAAAAAGCAAACTCGCTCGAAGATGGAATTG
AAAAAGCAATTACAACATTAAACTCAGGAAAAGCTTTTGATAAATTTCTGGAAATAGTTAAAGCTCAGGGCGGGGATATT
TCATACATAAAAAATCCTGAAAGGTATCCGAAGTCTAAACATCACAAGAAGCTTAAGATGTTGAATGAAGGCTATCTTTC
TTTTGTTAATACCTATGAAATCGGAATGGCAGCTATTGATCTTGGTGCCGGAAGATTAAAAAAAGAAGATAAAATTGACC
CTAAAGCTGGGATTATCTTTCATTACAAATTGGGTAATAAGATTAGAAAAGGTGATGTAATTGCAGAGCTATTTTCTGAA
TCCTCTGAAAAAATTAATTTAGCAGAGAAAAGAATTCTTAATGCAGTTAAGCTATCTGATAAAAAAACTAAAAGTCCTGT
TCTAATTAAACACATAATAAATTAA

Protein sequence :
MNTIEIIRKKRDNHSLTKEEIDFLISAYTKGTIPDYQFSAFLMAAFINGLNKTETAALTKAMLYSGKVVDLSSIKGVKVD
KHSTGGVGDKTSLIIAPIVAAAGVYVPMISGRGLGHTGGTLDKLESIPGFRTNLTLKEYKNVLKKTGVVLIGQTKEIAPA
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SSEKINLAEKRILNAVKLSDKKTKSPVLIKHIIN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
deoA YP_005163381.1 Thymidine phosphorylase Not tested Not named Protein 5e-75 43