Gene Information

Name : IALB_0195 (IALB_0195)
Accession : YP_005845175.1
Strain : Ignavibacterium album JCM 16511
Genome accession: NC_017464
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transketolase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 204591 - 206600 bp
Length : 2010 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGACAGAACCTAATACTTCTATTGAACAACTCGCCATAAATACAATTCGCACTTTATCAATTGATGCAGTTCAAAAAGC
TAATTCGGGACATCCGGGAATGCCTTTGGGATGTGCACCAATTGCCTATTTGCTCTATTACAAATTAATGAAACATAATC
CGTCCAATCCCGAATGGATTAACCGTGACAGATTTATACTCTCTGCCGGTCACGGAAGTATGTTACTATATTCAATTCTT
CATTTAAGTGGTTATGATTTGTCGCTCGATGATATTAAAAACTTCAGACAATGGGGTAGTAAAACACCAGGTCATCCGGA
ATATGGGCATACAGCCGGAGTTGAGACTACAACAGGTCCATTAGGTCAGGGCTTTGCAACTGCAATTGGAATGGCTGTTG
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GGAGATTTGATGGAAGGCATATCACACGAGGCAGCTTCTTTTGCAGGTCATCATAAAATTGAGAAAATAATTTTCTTTTA
TGATGATAACAGAATTACAATAGAAGGTAAAACAGATTTGACCTACTCAGATGATGTCCAGAAGAGATTTGAAGCTTATG
GATGGAATGTTTATCGTGTTAATGATGTTAATAATCTTTCTGAACTTGAAAACGCTGCAAATCTTGCAATAAAAAATTCA
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AGCTCCGCTTGGTGTGGAAGAAGTTAAACTAACAAAGAAAAATCTTGGCTGGAATTACGAAGAAGAATTTTTTATTCCGG
AGGAAGTTAAAAAACACTTCGCCGGAATAAAAGAATGTGGTAATGAAGCGGAAGAATTGTGGAGAAAACAATTTGATAAT
TATAAAAAGAAATTTCCCTCTGAAGCCGGACTTTTCGAAAAAATCTTTAATGGTGATTTTGGTGATGAATGGGAAAAACA
TCTTCCAACATTTTCTGAAGCAATGGCAACCAGAGCTGCATCAGGAAAATTTCTGAACGCTGTTGCACCATATTTGCCAA
CATTGATTGGTGGCTCTGCAGACCTTGCTGAATCTAACAACACCCATTTAAAGGAGTGTGAAAGTTTTTCTGCTGATAAT
AAAAATGGAAGAAACATTCACTTTGGTGTGCGGGAACATGCAATGGGTGCCATTCTTAATGGAATGTCGCTCTACGGTGG
TGTAATTCCTTATGGTGGAACATTTTTGATATTTTCAGATTACCTTCGTCCGGCGCTTCGTTTAAGTGCATTGATGAAAC
TCAGAACAATTTTTGTTTTTACTCACGATAGCATTGGTCTTGGTGAAGATGGTCCGACCCATCAACCTATCGAACAGCTT
CCATCATTACGTGCAATTCCAAATGTTACTGTTATTCGTCCCGCCGATGCAAATGAAACTACCGAAGCATGGCGATTTGC
AATTAAGCATAAAGGTGGTCCCGTTCTGCTTGTACTTACAAGACAAAAGCTTCCTTGTTTTGACAGAACCAGATTAACTT
CATCAAAAGAATTATCCAAAGGTGCTTACATTTTAAAGGAAACTTCGGGAAACCCGGACATAATTTTAATGGCAAGTGGT
TCTGAAGTTGATTTGATTCTGAAAGCTTCTGATAAATTAGAATCAGAAGGAATAAAAGCAAGAGTAATAAGTTTTCCAAG
TTGGGAAATTTTCGAAATGCAATCTGATGAATATAAAAGAAAAATATTTCCACCAGAGATAAAAGCCAGATTGGCTGTTG
AAACCGGCGTTAAACAGGGTTGGGAAAAATATGTCGGGGAAAAAGGTGATGTAATTTGTATGAAAACATTTGGTGCTTCT
GCACCTGATAAAGTGCTTTTTGAAAAATTCGGGTTCACAGTCGAGAATGTAATTAACAAAGCAAAAGAAATAATAAATAA
TAAATCATAA

Protein sequence :
MTEPNTSIEQLAINTIRTLSIDAVQKANSGHPGMPLGCAPIAYLLYYKLMKHNPSNPEWINRDRFILSAGHGSMLLYSIL
HLSGYDLSLDDIKNFRQWGSKTPGHPEYGHTAGVETTTGPLGQGFATAIGMAVARDFLASIFNKDGFNLIDHYIYGICSD
GDLMEGISHEAASFAGHHKIEKIIFFYDDNRITIEGKTDLTYSDDVQKRFEAYGWNVYRVNDVNNLSELENAANLAIKNS
DKPCLIITRTHIGYGSPNKQDSASAHGAPLGVEEVKLTKKNLGWNYEEEFFIPEEVKKHFAGIKECGNEAEELWRKQFDN
YKKKFPSEAGLFEKIFNGDFGDEWEKHLPTFSEAMATRAASGKFLNAVAPYLPTLIGGSADLAESNNTHLKECESFSADN
KNGRNIHFGVREHAMGAILNGMSLYGGVIPYGGTFLIFSDYLRPALRLSALMKLRTIFVFTHDSIGLGEDGPTHQPIEQL
PSLRAIPNVTVIRPADANETTEAWRFAIKHKGGPVLLVLTRQKLPCFDRTRLTSSKELSKGAYILKETSGNPDIILMASG
SEVDLILKASDKLESEGIKARVISFPSWEIFEMQSDEYKRKIFPPEIKARLAVETGVKQGWEKYVGEKGDVICMKTFGAS
APDKVLFEKFGFTVENVINKAKEIINNKS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
APECO1_2641 YP_859417.1 transketolase Not tested Not named Protein 7e-148 49
tktA AAO17218.1 TktA Not tested tcd island Protein 2e-149 49