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Name : Hprae_0905 (Hprae_0905) Accession : YP_005836219.1 Strain : Halanaerobium praevalens DSM 2228 Genome accession: NC_017455 Putative virulence/resistance : Unknown Product : thymidine phosphorylase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.4.2.2 Position : 1004530 - 1005834 bp Length : 1305 bp Strand : + Note : COGs: COG0213 Thymidine phosphorylase; InterProIPR000053:IPR017872:IPR018090:IPR017459:IPR 000312:IPR013102; KEGG: hor:Hore_06970 thymidine phosphorylase; PFAM: glycosyl transferase family 3; Glycosyl transferase, family 3-like; Pyrimidine nucleoside phos DNA sequence : ATGCGTGCTTATGATATAATATATAAAAAAAGAGAAGGCCAAAAACTAAGCAAAGAAGAACTAGAGTTTTTAGTAAATGG TTATGTAGACTCTAAAATACCTGATTATCAAATTGCAGCTTGGGCAATGGCAGTTTATTTTCAGGGGATGGATGCTCAAG AAACTGCTAACTTAACTATGTTAATGGCAGAATCAGGTGATATGATTGATTTAAGTCCTATTTCAGGCATCAAAGTTGAT AAACATAGTACAGGAGGTGTAGGTGATACTACCACCTTGATTTTAGCTCCTTTAGTAGCTTCTGCTGGTATTCCAGTTGC TAAAATGTCTGGTAGAGGTCTTGGTCATACAGGTGGAACTATAGATAAATTAGAGTCTATACCTAGTTTTAATACATCTT TAAGTAGAGATAAATTTTTTGATAATGTTAACCAGCATGGTGTAGCAGTAGTTGGCCAAACTGGTAATTTAACTCCAGCT GATAAAAAATTATATGCCTTAAGAGATGTTACAGCTACTGTTGAATCTATACCTTTAATTGCTAGTAGTATTATGAGTAA AAAATTGGCTGGTGGAGCAGATGCTATAGTTCTTGATGTGAAAACAGGTAATGGTGCTTTTATGAAAGATTTTGAAAATG CTAAAAAATTGGCAGAAGCAATGGTTGCAATTGGTAAAGAAGTTGGTCGTGATACTGCAGCTTATATTACTGATATGAAT CAACCTCTTGGTCAGGCAGTTGGAAATGCTTTAGAGGTAAAAGAGGCAATTAGGACTCTGAAAGGAAAAGGACCTGCAGA TTTAACAGAACTATGTGTTGAATTAGGTGCTGGTATGCTTCAATTAGCTGGTAAAGTAAGTAGTTTAGATCAAGGTAAAG AGCTTTTAAGAACTAAGCTTAAAAATGGTGAGGCTTTGGCTAAATTTGGAGAATTGATTACTGCTCAGGGCGGTAGTGCT AAAGTAATAAAAGATTTATCATTACTACCAACTGCTGAAAATAAAGTTGAAGTCAAAGCAGAAAAATCAGGCTATGTTTC TGCAATTAAAGCTTTAGATGTTGGATTAGCTGCGATGATTTTAGGTGCTGGTAGAGAAAATAAAGATTCTAAAATTGACC TAGCTGTTGGTTTAGAACTCAAGCAAAAAATAGCTGATTCTGTAGAAAAAGGAGATACTTTAGCAGTCTTACATTATAAT GATTCAGCTAATTTAGAGGAAGCTAAAGCAAAATTATTAGCAGCCTTTACTATAACTAAAGAAAAAAAGAATAAAAACAA ACTATTATATGAGATAATTAAATAA Protein sequence : MRAYDIIYKKREGQKLSKEELEFLVNGYVDSKIPDYQIAAWAMAVYFQGMDAQETANLTMLMAESGDMIDLSPISGIKVD KHSTGGVGDTTTLILAPLVASAGIPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLESIPSFNTSLSRDKFFDNVNQHGVAVVGQTGNLTPA DKKLYALRDVTATVESIPLIASSIMSKKLAGGADAIVLDVKTGNGAFMKDFENAKKLAEAMVAIGKEVGRDTAAYITDMN QPLGQAVGNALEVKEAIRTLKGKGPADLTELCVELGAGMLQLAGKVSSLDQGKELLRTKLKNGEALAKFGELITAQGGSA KVIKDLSLLPTAENKVEVKAEKSGYVSAIKALDVGLAAMILGAGRENKDSKIDLAVGLELKQKIADSVEKGDTLAVLHYN DSANLEEAKAKLLAAFTITKEKKNKNKLLYEIIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| deoA | YP_005163381.1 | Thymidine phosphorylase | Not tested | Not named | Protein | 3e-79 | 43 |
