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Name : Hprae_0082 (Hprae_0082) Accession : YP_005835401.1 Strain : Halanaerobium praevalens DSM 2228 Genome accession: NC_017455 Putative virulence/resistance : Unknown Product : PTS system N-acetylglucosamine-specific transporter subunit IIBC Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.1.69 Position : 100127 - 101554 bp Length : 1428 bp Strand : + Note : COGs: COG1263 Phosphotransferase system IIC components glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific; InterProIPR003352:IPR018113:IPR010974:IPR011535:IPR 001996:IPR013013; KEGG: tex:Teth514_0412 PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit; PFAM: DNA sequence : ATGAAAAAAGTATTTTCTAATTTGCAAAAGATAGGTAAATCTTTAATGCTGCCAATTGCTGTTTTACCAGCAGCTGCTTT GCTACTTAGACTTGGTGCTGGTGATGTTTTGGATATTCCTTTTGTGATGGCCGCTGGGGCTGCAATTTTTGATAATTTAG CTTTATTGTTTGGAATTGGAGTTGCAGTTGGAATTGCCCATGATAGTTCTGGAGCAGCTGGTTTGGCTGGAGCAGTAAGT TATTTTATTTTAACTAATGCAACCCAAGCTATTAATGGCGATATAAATATGGGAGTTTTAGCTGGTATTATCGGTGGTCT TTTGGCTGGATTTTTATATAATCGTTATCATGATATTGAATTACCTGATTTTTTAGGATTTTTTGGTGGTAAACGTTTTG TACCAATTGTAACAGGAGCTGCAAGTGTTTTATTGGCTGGTTTATTTGGTTATATTTGGCCTCCAATTCAAAATGTAATT CAGCTAACAGGAGAATGGATTATTAATGCAGGTCCAATCGGTGTTTTTGTATATGGATTTTTAAATAGATTACTAATTCC TCTTGGTTTACATCATGTTTTAAATAGTTTTATTTGGTTTGTCTTTGGCGAATTTACTACCGCAGCAGGAGAGGTTGTTA CAGGAGATTTATCTCGCTTTTTTGCTGGAGATCCTTCAGCTGGATTTTTCATGTCAGGCTTTTTCCCAATGATGATGTTT GGTCTGCCAGCAGCAGCCTTAGCAATGTATCATGCAGCTAAACCGGAAAACAAAAAAGCTGTTAGTGGTATTTTCTTAAG TGTTGGTTTAACTGCCTTTTTAACTGGAATTACAGAGCCGATCGAATTTGCATTTATGTTTTTAGCACCAGTTTTATATG TTATTCATGCTATTTTAACTGGTTTATCAATGGTTGTAACTTATATTTTAGGTATTCAACATGGTTTTGGTTTTTCAGCT GGGGCAATTGATTACTTTTTAAATTATGGTTTAGCTACAAAACCAATCTTAATTATTCCTTTAGGAATTGCAGCTTTTGC TATTTATTATTCTCTTTTCCGTTTTGTAATTGAAAAATTTGATATTGCAACTCCTGGCCGGGTAGAAGGAGAAGCTGAAA CTAACAATATGAGTGTAATGCCTGATTCGCAGTCAGAATCTGAGCAGTCTACAACCAATACAAAGAATAAGACAAAAGCA GCCCAATATATTGAAGCTTTAGGTGGAGCTGAAAATATTGAAAGAGTTGATTCTTGTATTACTAGATTAAGACTAGAGGT GAAAAATTCAGATAATTTAGATGAAGCTAAATTAAAAGAATTGGGAGCTTCTGGAGTTATGAAAGCTAATAAGTCTAATG CTCAAGTTGTAGTTGGAACTAAAGCAGAACTAATAGCTGAACAAATAAAAAAAGAATTAAATAGTTAA Protein sequence : MKKVFSNLQKIGKSLMLPIAVLPAAALLLRLGAGDVLDIPFVMAAGAAIFDNLALLFGIGVAVGIAHDSSGAAGLAGAVS YFILTNATQAINGDINMGVLAGIIGGLLAGFLYNRYHDIELPDFLGFFGGKRFVPIVTGAASVLLAGLFGYIWPPIQNVI QLTGEWIINAGPIGVFVYGFLNRLLIPLGLHHVLNSFIWFVFGEFTTAAGEVVTGDLSRFFAGDPSAGFFMSGFFPMMMF GLPAAALAMYHAAKPENKKAVSGIFLSVGLTAFLTGITEPIEFAFMFLAPVLYVIHAILTGLSMVVTYILGIQHGFGFSA GAIDYFLNYGLATKPILIIPLGIAAFAIYYSLFRFVIEKFDIATPGRVEGEAETNNMSVMPDSQSESEQSTTNTKNKTKA AQYIEALGGAENIERVDSCITRLRLEVKNSDNLDEAKLKELGASGVMKANKSNAQVVVGTKAELIAEQIKKELNS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ef0067 | AAM75272.1 | EF0067 | Not tested | Not named | Protein | 6e-51 | 41 |
