Gene Information

Name : Hprae_0471 (Hprae_0471)
Accession : YP_005835785.1
Strain : Halanaerobium praevalens DSM 2228
Genome accession: NC_017455
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : argininosuccinate lyase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 4.3.2.1
Position : 534275 - 535696 bp
Length : 1422 bp
Strand : +
Note : COGs: COG0165 Argininosuccinate lyase; InterPro IPR009049:IPR020557:IPR003031:IPR000362; KEGG: hor:Hore_02920 argininosuccinate lyase; PFAM: fumarate lyase; SPTR: Argininosuccinate lyase; TIGRFAM: argininosuccinate lyase; PFAM: Lyase; TIGRFAM: argininosuc

DNA sequence :
ATGGCAAAAAATAAATTATGGGGTGGAAGATTTAAGGTAGACACTTCTGAATTAATGGATGAGTTTAATGCTTCACTTCC
TTTTGATATTAAGCTCTTAAAATATGATGTCAAAGGTAGTTTAGCTCATGTGCAAATGCTAGCTAAACAGGGTATTTTAA
CTAAAGAAGAAACAAAAAAAATCAGTTCAGGCTTGCAAGCTGTTAAAAAAGAAATTGAAAAAGAATTAGCAGCTGGTAAA
TTTGATTTTAAAGAGGCAGAAGATATTCATAGTTTAATAGAGGCTCGTTTAACAGCTAAAATTGGTGAAGTAGGCGGCAA
ATTACATACTGGCCGCAGCCGTAATGATCAGGTTGCTCTTGATCTTCGTTTATATTTAAGAGAAGAGACTTTAGATCTTA
GAAAAATGCTACTTGATTTTATGCAGGTGATTTTAGATTTAGCAGAAAAACACACAGAAACTATAATGCCAGGTTATACT
CATTTACAGAGAGCTCAAGCTATTACTTTTGCTCATCACCTTTTGGCTTACTATTTTAAGTTAAAAAGAGACTATGAACG
TTTTGGAGATGCTTTAAAAAGAATAAATATTTCTCCCTTAGGCTCAGGTGCTTTAGCAGGTAGTTCTTTTGACTTAGATA
GAGAATTTACAGCTAAAAAATTAGGCTTTATTAGAGCTTGTAAAAACTCTATTGATGGAGTTAGTGATCGAGATTTTGTG
CTTGAGTTTTTAGCTGTTGCTTCTAATTTAATGTTACATTTAAGCAGTTTAAGTGAAGAAGTAATTTTGTGGAATTCAAA
AGAGTTTTCATTTATTGAGCTGGCTGATCAATATACTACTGGTAGTTCTATTATGCCACAAAAGAAAAATCCTGATTTAG
CTGAATTAGTACGCGGGAAAACTGGTAAAGTTATTGGTAATTTAAACCAGATGTTGTTAACTTTAAAAGGATTGCCATTA
GCATATAATAAAGATTTACAAGAAGACAAAGAAGGTCTTTTTGCTAGTGTAGAAACACTTAAAATCATTTTAAAATTATA
TCCAGAAATGTTAAAAACAATGAAAGTTAAGAAAAAAGAGATGCAAAAAGCAGCAGCAAAAGGTTTTTTAAATGCAACTG
AGTTAGCTGATTTCTTAGCAGTAAATAATATTCCTTTTCGGAAAGCACATCAAATTGTAGGCAAAGCAGTAATTTTAGCT
GCTCAAAAAGAAAAAGAGCTAGAAGATTTACAAAAATCTGATTGGGAAGAAATATTTGATTCAGATTTAAAAGAAGAATT
AAAAGTTGATTTTGAAAAGCTAAAAGAAAAATTAAAAGTTGAAACAGCTGTTAATTCACATTCTACTTTAGGTGGTCCAG
CTTTTAAAGAAAGTCAGTCAATAATCCAAAAAGAAAGAAGCCTACTAGCCTCTAAAAAATAA

Protein sequence :
MAKNKLWGGRFKVDTSELMDEFNASLPFDIKLLKYDVKGSLAHVQMLAKQGILTKEETKKISSGLQAVKKEIEKELAAGK
FDFKEAEDIHSLIEARLTAKIGEVGGKLHTGRSRNDQVALDLRLYLREETLDLRKMLLDFMQVILDLAEKHTETIMPGYT
HLQRAQAITFAHHLLAYYFKLKRDYERFGDALKRINISPLGSGALAGSSFDLDREFTAKKLGFIRACKNSIDGVSDRDFV
LEFLAVASNLMLHLSSLSEEVILWNSKEFSFIELADQYTTGSSIMPQKKNPDLAELVRGKTGKVIGNLNQMLLTLKGLPL
AYNKDLQEDKEGLFASVETLKIILKLYPEMLKTMKVKKKEMQKAAAKGFLNATELADFLAVNNIPFRKAHQIVGKAVILA
AQKEKELEDLQKSDWEEIFDSDLKEELKVDFEKLKEKLKVETAVNSHSTLGGPAFKESQSIIQKERSLLASKK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00324 YP_008207789.1 Argininosuccinate lyase Not tested AbaR25 Protein 1e-94 48
BJAB0868_00328 YP_008211654.1 Argininosuccinate lyase Not tested AbaR26 Protein 1e-94 48